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dc.creatorMontoya Solano, José David
dc.creatorSuárez Moreno, Zulma Rocío
dc.creatorMontoya Castaño, Dolly
dc.creatorAristizábal Gutiérrez, Fabio Ancízar
dc.date.accessioned2019-06-25T20:33:17Z
dc.date.available2019-06-25T20:33:17Z
dc.date.created2006
dc.identifier.urihttps://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/22112
dc.descriptionEste trabajo tuvo como propósito identificar secuencias de genes en clones obtenidos en una librería genómica de la cepa colombiana de Clostridium sp. IBUN 22A. Los insertos de nueve clones con tamaæos superiores a 500 pb fueron secuenciados y analizados por medio de bÅ“squedas de los insertos completos o de sus marcos abiertos de lectura (ORFs) traducidos en GenBank 141.0 y Uniprot 6.6 con BLAST 2.2.8. Se identificaron seis genes con alta similaridad a genes de metabolismo bÆsico (housekeeping) en diferentes especies de Clostridium. En el clon pBsIBUN22A-1 se localizó una secuencia de 851 pb con una identidad del 99.74% respecto al gen codificante de la enzima glicerol deshidratasa (DhaBl) de Clostridium butyricum (AY968605) involucrada en la producción de 1,3 Propanodiol (1,3-PD). La identifica­ción de genes presentes en la cepa nativa Clostridium IBUN 22A abre la puerta a la investigación básica y a la ingeniería metabólica para hacer más rentable el proceso de producción de 1,3-PD junto al conocimiento de los genes presentes en la cepa nativa. Palabras clave: análisis de secuencias, librería genómica, Clostridium, glicerol deshidratasa, 1,3-propanodiol.
dc.descriptionThis work was aimed at identifying gene sequences in recombinant clones obtained from a genomic library from the Colombian Clostridium sp. IBUN 22A native strain. Nine clones greater than 500 bp were sequenced and analysed using BLAST 2.2.8 to search for complete inserts or their translated open reading frames (ORFs) in GenBank 141.0 and Uniprot 6.6. Seven genes having high similarity to housekeeping genes from different Clostridium species were identified. An 851 bp sequence was located in the pBsIBUN22A-1 clone, having 99.74% identity with the gene encoding the Clostridium butyricum enzyme glycerol dehydratase (DhaBl) which is involved in 1,3-propanediol (1,3-PD) production. Identifying genes in the native IBUN 22A strain formed the starting point for basic research and metabolic engineering aimed at making 1,3-PD production more profitable and increasing knowledge of genes present in the native strain. Key words: glycerol dehydratase, 1,3-propanediol, genomic library, Clostridium, sequence analysis.
dc.formattext/html
dc.publisherUniversidad Nacional de Colombia
dc.relationhttp://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/505
dc.relation.ispartofUniversidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Revista Colombiana de Biotecnología
dc.relation.ispartofRevista Colombiana de Biotecnología
dc.relation.ispartofseriesRevista Colombiana de Biotecnología; Vol. 8, núm. 1 (2006); 57-64 1909-8758 0123-3475
dc.subjectanálisis de secuencias
dc.subjectlibrería genómica
dc.subjectClostridium
dc.subjectglicerol deshidratasa
dc.subject1
dc.subject3-propanodiol
dc.subjectglycerol dehydratase
dc.subject1
dc.subject3-propanediol
dc.subjectgenomic library
dc.subjectClostridium
dc.subjectsequence analysis
dc.titleAnálisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de clostridium sp. ibun22a
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.type.spaArtículo - Article
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.rights.accessRightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.identifier.bibliographicCitationMontoya Solano, José David and Suárez Moreno, Zulma Rocío and Montoya Castaño, Dolly and Aristizábal Gutiérrez, Fabio Ancízar (2006) Análisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de clostridium sp. ibun22a. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 8, núm. 1 (2006); 57-64 1909-8758 0123-3475 .
dc.identifier.eprintshttp://bdigital.unal.edu.co/13146/


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