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dc.rights.licenseAtribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.contributorVanegas Guerrero, Javier
dc.contributor.advisorAristizábal Gutiérrez, Fabio Ancízar (Thesis advisor)
dc.contributor.authorFigueroa Galvis, Ingrid Paola
dc.date.accessioned2019-07-02T16:19:58Z
dc.date.available2019-07-02T16:19:58Z
dc.date.issued2017
dc.identifier.urihttps://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/59560
dc.description.abstractLos suelos de manglar poseen una alta actividad microbiana, la cual se encarga de realizar el ciclaje de nutrientes y asimismo sustenta la cadena trófica. El objetivo principal del presente trabajo fue identificar la diversidad y predecir el potencial genético funcional de las comunidades microbianas, presentes en el suelo rizosférico del mangle negro (Avicennia germinans), a lo largo del gradiente de salinidad. El lugar de estudio se ubicó en el manglar de la desembocadura del río Ranchería, en el departamento de La Guajira. El trabajo se dividió en tres objetivos: 1. Determinar la diversidad de microorganismos presentes en las tres zonas de muestreo mediante la secuenciación del gen 16S rRNA. 2. Evalular del efecto de las características fisicoquímicas del suelo sobre la diversidad taxonómica de las comunidades microbianas. 3. Predecir el potencial funcional microbiano, utilizando el software PICRUSt. Se identificó la diversidad y estructura de la comunidad de bacterias y archaeas, siendo la abundancia de bacterias más alta. Se encontraron diferencias significativas en 161 especies bacterianas a lo largo del gradiente de salinidad del suelo. Las variables fisicoquímicas del suelo carbono orgánico, arcilla y salinidad afectaron la distribución de OTUs. Mediante la predicción PICRUSt se identificaron diferencias significativas en los genes betA, betB, otsA, otsB, otsA otsB y proB relacionados a tolerancia al estrés por salinidad. En conclusión, este trabajo presenta una visión de la diversidad microbiana presente en un manglar de La Guajira, las variables ambientales que afectan la diversidad y la predicción de funciones metabólicas que se pudieran estar llevarse a cabo.
dc.description.abstractAbstract. Mangrove soils have high microbial activity, and these microbes perform nutrient cycling that supports food webs. The aim of the study was to identify microbial diversity and predict functional genetic potential of the microbial communities in the rhizosphere of black mangrove (Avicennia germinans), taking into account the salinity gradient. The location of soil samples was at the Brazo Riíto's mangrove, Ranchería river, La Guajira. The thesis is divided into three objectives: 1. Determinate microbial diversity present in the three sampling sites through gen 16S rRNA sequencing. 2. Evaluate the effect of physicochemical factors from soil into taxonomic diversity of microbial communities. 3. Predict functional potential microbial, by using PICRUSt software. Significant differences were found in 161 species along soil gradient salinity. Soil physicochemical variables such as organic carbon, clay and salinity affected the OTUs distribution. Through the PICRUSt prediction we identified significant differences genes such as betA, betB, otsA, otsB, otsA otsB y proB related to salinity stress tolerance. This work presents a vision of the microbial diversity present in the mangrove of La Guajira, the environmental variables that affect the diversity and the prediction of the metabolic functions that can be carrying out.
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isospa
dc.relation.ispartofUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Posgrado Interfacultades en Microbiología
dc.relation.ispartofPosgrado Interfacultades en Microbiología
dc.rightsDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.subject.ddc55 Ciencias de la tierra / Earth sciences and geology
dc.subject.ddc57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
dc.titleCaracterización de la diversidad y predicción del potencial genético funcional de las comunidades microbianas asociadas a la rizósfera del mangle negro (Avicennia germinans) en un gradiente de salinidad de La Guajira
dc.typeTrabajo de grado - Maestría
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.identifier.eprintshttp://bdigital.unal.edu.co/57111/
dc.description.degreelevelMaestría
dc.relation.referencesFigueroa Galvis, Ingrid Paola (2017) Caracterización de la diversidad y predicción del potencial genético funcional de las comunidades microbianas asociadas a la rizósfera del mangle negro (Avicennia germinans) en un gradiente de salinidad de La Guajira. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia-Sede Bogotá.
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subject.proposal16S rRNA
dc.subject.proposalDiversidad microbiana
dc.subject.proposalRizósfera
dc.subject.proposalManglar
dc.subject.proposalAvicennia germinans
dc.subject.proposalMicrobial diversity
dc.subject.proposalRhizosphere
dc.subject.proposalMangrove
dc.subject.proposalAvicennia germinans
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.contentText
dc.type.redcolhttp://purl.org/redcol/resource_type/TM
oaire.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2


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