Zinowiewia sebastianii, a new species from high-Andean forests of the Eastern Cordillera at the department of Boyacá (Colombia) is described and illustrated, and its taxonomic affinities are discussed. Individuals of the new species are shrubs to 5 m tall, with interpetiolar, laciniate stipules, leaf blades with 8–11 pairs of lateral veins and entire, plane margin, 2-forked dichasia to 1 × 1 cm, axillary to the distal leaves, calyx, corolla and androecium pentamerous or tetramerous, and two-celled, one-seeded samaras 18–20 × 5–7 mm. Based on the low number of individuals of Z. sebastianii observed within an area of occupancy 10 km2, in severely fragmented forests, the species is proposed as Critically Endangered (CR), as it faces an extremely high risk of extinction in the wild.Zinowiewia sebastianii, una nueva especie del bosque altoandino de la Cordillera Oriental de Colombia, en el departamento de Boyacá (Colombia) es descrita e ilustrada, y sus afinidades taxonómicas son discutidas. Los individuos de la nueva especie son arbustos hasta de 5 m alto, con estípulas interpeciolares laciniadas, lámina foliar con 8-11 pares de venas laterales y margen plano, entero, dicasios 2-ramificados hasta de 1 × 1 cm, formados en las axilas de las hojas distales, cáliz, corola y androceo pentámeros o tetrámeros, y sámaras biloculares, uniseminadas de 18-20 × 5-7 mm. Basados en el bajo número de individuos de Z. sebastianii observados dentro de un área de ocupación 10 km2, en bosques extremadamente fragmentados, proponemos que la nueva especie sea considerada en Peligro Crítico (CR), ya que enfrenta un alto riesgo de extinción en estado silvestre.