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dc.rights.licenseAtribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.contributorLópez Kleine, Liliana
dc.contributor.authorGonzález Prieto, Cristian Andrés
dc.date.accessioned2019-07-03T07:23:34Z
dc.date.available2019-07-03T07:23:34Z
dc.date.issued2018-10-08
dc.identifier.urihttps://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/68651
dc.description.abstractLa utilización de datos de secuenciación de ARN se ha convertido en un reto en cuanto a la construcción de métodos estadísticos que permitan analizar, entre otras cosas, la interacción de los genes dentro de las células. Esta interacción puede ser vista mediante una red, pues permite observar la forma en cómo los genes se comunican entre sí, proceso conocido como regulación. Se propone una metodología para la construcción de redes de regulación génica de dos maneras distintas: la primera enfocada a la construcción de la red utilizando las características topológicas de la misma. La segunda, haciendo uso de un modelo gráfico que incluya la distribución nodo-condicional de los datos de RNA-Seq; de esta manera abordar el problema desde la visión distribucional y no paramétrica.
dc.description.abstractAbstract: The use of RNA sequencing data has become a challenge in the construction of statistical methods that allow to analyze, inter alia, the interaction of genes within cells. This interaction can be seen on a network, since this allows to see how the genes communicate with each other, the process known as regulation. It is proposed to construct a network from the RNA sequencing data using a measure of similarity for the counting data and defining a similarity threshold that allows one to decide whether a gene is regulator or regulated in order to construct a directed network as well as a network-based node-conditional distribution of RNA sequencing data using graphical models, to then make an assessment of the advantages and disadvantages of each of the proposed methods.
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.language.isospa
dc.relation.ispartofUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de Estadística
dc.relation.ispartofDepartamento de Estadística
dc.rightsDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.subject.ddc5 Ciencias naturales y matemáticas / Science
dc.subject.ddc51 Matemáticas / Mathematics
dc.subject.ddc57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
dc.titleConstrucción de redes de regulación génica usando datos de secuenciación de ARN
dc.typeTrabajo de grado - Maestría
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.identifier.eprintshttp://bdigital.unal.edu.co/69726/
dc.description.degreelevelMaestría
dc.relation.referencesGonzález Prieto, Cristian Andrés (2018) Construcción de redes de regulación génica usando datos de secuenciación de ARN. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subject.proposalRedes de Regulación Génica
dc.subject.proposalRNA-Seq
dc.subject.proposalUmbral de similitud
dc.subject.proposalGraphical models
dc.subject.proposalGene Regulation Network
dc.subject.proposalSimilarity threshold
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.contentText
dc.type.redcolhttp://purl.org/redcol/resource_type/TM
oaire.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2


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