En el río Tota (Boyacá, Colombia) se midieron variables ambientales e hidrológicaspara conocer la influencia sobre la colonización de algas del perifiton. Se estimó ladiversidad y la densidad e igualmente se establecieron a partir de los días de aparición,la morfología y la medición de los tamaños celulares los patrones de colonizacióny las etapas de desarrollo de la comunidad. Los muestreos se realizaron en tresperíodos climáticos diferentes en las cuales se midieron diariamente durante 15 díaslas variables ambientales e hidrológicas y se tomaron mediante la utilización desubstratos artificiales las muestras biológicas. En cuanto a las variables medidas seencontró que la variación mensual fue más importante que la variación diaria. El flujo(caudal) está altamente relacionado con la precipitación pluvial (n= 45; r= 0.93) yejerció influencia en la colonización de las algas ya que generó patrones diferentesde acuerdo con las variaciones estacionales. Las diatomeas dominaron en las épocasde estudio y se ordenaron durante las etapas de desarrollo como especiescolonizadoras de etapas primarias, intermedias y tardías. Las clorofíceas, cianofíceasy las euglenofíceas ocuparon un porcentaje menor del conjunto de las especies. Ladiversidad fue mayor en condiciones de flujos medios y lluvias esporádicas, mientrasla densidad fue máxima cuando los valores de flujo fueron mínimos.