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dc.contributorBermúdez Santana, Clara Isabel
dc.contributorDíaz Morales, Hernando (Thesis advisor)
dc.creatorRomero Marroquín, Liliana Constanza
dc.date.accessioned2019-07-03T15:55:21Z
dc.date.available2019-07-03T15:55:21Z
dc.date.created2014
dc.identifier.urihttps://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/73129
dc.descriptionEn este trabajo se consideran los genomas secuenciados de 12 especies del género Drosophila. A cada genoma le es asociado un vector de 22 componentes; 21 de éstas corresponden al número de genes ARNt funcionales, clasificados según el aminoácido que su molécula transcrita es capaz de transportar, la componente restante corresponde al número de pseudogenes ARNt. Considerando los criterios de conservación en sintenia y similitud entre cadenas, la cual es estudiada usando la distancia de Hamming, se establece que cada pareja de vectores está relacionada mediante una transformación afín. Las entradas de las matrices de dichas transformaciones afines representan las tasas de ganancia de genes o pseudogenes ARNt entre los genomas. Adicionalmente, se estudia la correlación entre la distancia de mutación genómica de dos especies y las tasas encontradas.
dc.descriptionAbstract. In this document, we consider the sequenced genomes of 12 species in the genus Drosophila. Each genome is associated with a vector. These vectors have 22 components; 21 of them correspond to the number of functional tRNA genes classified according to the unique type of amino acid that is carried by their transcribed molecules, the remaining component correspond to the number of tRNA pseudogenes. Taking into account the syntenic conservation criteria and the similarity between strings, that has been studied using the Hamming distance, we stablish that each pair of vectors is related by an affine transformation. The matrices entries of those affine transformations represent rates of tRNA gene or pseudogene gain between a pair of genomes. Furthermore, we study the correlation between the genome mutation distances and the obtained rates.
dc.formatapplication/pdf
dc.relation.ispartofUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de Matemáticas
dc.relation.ispartofDepartamento de Matemáticas
dc.subjectOrganización genómica
dc.subjectARN de transferencia
dc.subjectConservación sinténica
dc.subjectTasas de ganancia y degradación de genes
dc.subjectDistancia de Hamming
dc.subjectTransfer RNA
dc.subjectSyntenic conservation
dc.subjectAffine transformations
dc.subjectHamming distance
dc.subject.ddc12 Epistemología, causalidad, género humano / Epistemology
dc.subject.ddc51 Matemáticas / Mathematics
dc.subject.ddc57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
dc.subject.ddc61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health
dc.titleUna descripción matemática del recambio evolutivo de los ARNt en el género Drosophila
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.spaTesis/trabajos de grado - Thesis
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/draft
dc.coverage.modalityMaestría
dc.rights.accessRightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.identifier.bibliographicCitationRomero Marroquín, Liliana Constanza (2014) Una descripción matemática del recambio evolutivo de los ARNt en el género Drosophila. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.
dc.identifier.eprintshttp://bdigital.unal.edu.co/37604/


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