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Browsing Maestría en Bioinformática by Issue Date
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Modelo computacional de la interacción compatible entre Phytophthora infestans y Solanum tuberosum a través de la reconstrucción computacional del metabolismo de la planta y datos de expresión génica
Solanum tuberosum, la papa común, es uno de los principales cultivos para el consumo humano; el patógeno más importante que afecta su producción es el oomicete Phytophthora infestans, causante de la enfermedad del tizón ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Identifying proteins and metabolic pathways associated with the neuroprotective response mediated by tibolone in astrocytes under an induced inflammatory model
En este trabajo, se identificaron las proteínas y rutas metabólicas asociadas a la respuesta neuroprotectora mediada por el neuroesteroide sintético tibolona bajo un modelo inflamatorio inducido por palmitato usando análisis ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial Ingeniería de Sistemas. -
Estrategia computacional para detección y caracterización de bloques microsíntenicos relacionados a regiones genómicas asociadas a domesticación en frijol Lima
El frijol Lima (Phaseolus lunatus L.) es la segunda especie domesticada más importante del género Phaseolus y es de interés desde el punto de vista agronómico y ecológico por el amplio rango de adaptaciones agro-ecológicas ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Herramienta de software para identificación y tipificación de bacterias a partir de información genómica
El objetivo principal de este trabajo se basa en la premisa que, si tuviéramos un paciente que presente una IAAS, del cual se ha podido extraer y aislar la bacteria que genera la infección, pero no sabemos nada sobre ella ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Análisis automatizado de Dominios ancestrales asociados al sistema inmune en cordados basales dentro de un contexto evolutivo
Esta tesis tiene como objetivo la construcción de un flujo automatizado de trabajo que integre diferentes procesos, la información de bases de datos y los modelos computacionales requeridos para identificar dominios asociados ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Comparación de genes que codifican resistencia antibiótica en Mycobacterium avium Complex y Mycobacterium tuberculosis Complex
En la actualidad, los complejos M. avium (MAC) y M. tuberculosis (MTBC) son considerados como agentes etiológicos en enfermedades como la tuberculosis humana, una de las 10 principales causas de mortalidad en el mundo. ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Búsqueda de compuestos inhibidores de la enzima dihidroorotato deshidrogenasa de Leishmania spp a través de estrategias de mecánica molecular
La leishmaniasis es una enfermedad infecciosa causada por protozoos del genero Leishmania, los cuales son parásitos intracelulares obligados, siendo endémica en zonas tropicales y subtropicales. Esta patología se presenta ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial Ingeniería de Sistemas. -
Standardization of a methodology for identification and annotation of associations between single nucleotide polymorphisms and highly polygenic traits in ruminants
Given the importance of the production of ruminants, it is necessary to investigate the genetic variants associated with the traits of economic interest in these animals, as well as the biology underlying the genotype-phenotype ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Asociación de variantes en regiones codificantes de genes con datos clı́nicos en pacientes colombianos usando minerı́a de datos
En esta tesis de maestrı́a se propone un modelo para el análisis de variantes en regiones codificantes de genes en pacientes colombianos. Los datos corresponden a 227 pacientes a los cuales se les secuenciaron 4813 genes ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial Ingeniería de Sistemas. -
Diseño, modelamiento y evaluación in silico de péptidos que reconocen antígeno Tn
El antígeno Tn (GalNac α-Ser / Thr) fue descrito por primera vez en pacientes con una rara enfermedad hemolítica (síndrome Tn), y desde que se descubrió su presencia en el 90 % de los carcinomas a mediados de la década de ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Método computacional para establecer un esquema de identificación de Mycobacterium tuberculosis a partir de secuencias genómicas
El complejo Mycobacterium tuberculosis es un grupo de agentes patógenicos caracterizados principalmente por causar tuberculosis en distintos animales. En la actualidad métodos más eficientes y efectivos para identificar ... -
Modelo integrado para la caracterización in silico del efecto de la diversidad genética sobre regiones estructuradas codificantes y no codificantes del virus del Dengue
La diversidad y evolución genética del virus Dengue (DENV) ha sido un tema de atención en virología abordado para comprender las interacciones que surgen entre él y sus hospederos lo cual involucra descifrar el desarrollo ... -
Protocolo computacional para la asignación taxonómica de virus en metadatos genómicos
Los virus están ampliamente distribuidos en todos los ecosistemas naturales y son el grupo de entidades biológicas más diverso conocido. Aunque su biodiversidad biológica estimada es de 31 ordenes de magnitud, nuestro ... -
Construcción de una plataforma computacional para la identificación de relaciones sinténicas entre subregiones genómicas asociadas al sistema inmune innato del organismo D. vexillum y otros tunicados
This works presents protocols and results associated to identify sintenic relationships between subgenomics regions associated with the innate immune system of the organism Didemnum vexillum and other Tunicates. In order ... -
Modelo farmacogenético y clínico para la predicción de desenlaces en pacientes con artritis reumatoide tratados con metotrexato y adalimumab
GOAL: To develop a pharmacogenetic and clinical model to predict effectiveness outcomes in a cohort of patients diagnosed with rheumatoid arthritis (RA) treated with methotrexate or adalimumab at the Central Military ... -
Identificación y clasificación de las rutas metabólicas de las especies de Leptospira spp
El aislamiento de Leptospira spp. es considerado como la prueba de laboratorio de mayor fiabilidad para el diagnostico de leptospirosis. Sin embargo, las limitaciones del cultivo impiden su implementación para el diagnostico ... -
Análisis de metodologías estadísticas en RNA-seq, con aplicación a cáncer de pulmón
La identificación de genes expresados diferencialmente en un grupo de pacientes que padezcan una enfermedad, es un primer paso en el desarrollo de procedimientos para la detección temprana de dicha enfermedad en los pacientes ... -
Modelo Computacional para el análisis de historias clínicas de pacientes con Artritis Reumatoide aplicando bioinformática traslacional y minería de textos
Este trabajo tiene como finalidad crear un modelo computacional que permita identificar el avance de la enfermedad de artritis reumatoide (AR) con base en el análisis de historias clínicas de pacientes diagnosticados con ... -
Modelado computacional de astrocito humano usando datos de transcriptómica y proteómica
Aunque la astrogliosis está relacionada con eventos neuroprotectores; su neurotoxicidad se ha correlacionado con enfermedades neurodegenerativas y otros desórdenes (Sofroniew & Vinters, 2010). Lo que ha aumentado la ... -
Identificación de reacciones controladoras en un modelo computacional multi-ómico astrocitario de lipotoxicidad inducida por ácido palmítico
Los astrocitos juegan un papel importante en varios procesos en el cerebro, incluidas condiciones patológicas como las enfermedades neurodegenerativas. Estudios recientes han demostrado que el aumento de ácidos grasos ...
