Reconocimiento 4.0 InternacionalAlí Torres, Jorge IsaacPuello Silva, Jorge Raúl2025-03-282025-03-282024https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/87771ilustraciones a color, diagramas, tablasLa interacción entre el hierro y el péptido amiloide β (Aβ) ha sido objeto de gran atención en la investigación de la enfermedad de Alzheimer (EA) debido a sus posibles implicaciones en el desarrollo de esta patología. Mientras que los estudios previos han investigado las preferencias de coordinación del hierro y el péptido Aβ1−42, no se ha estudiado la contribución de la parte peptídica dentro de la estabilización de estos sistemas. En este trabajo se utilizó una serie de herramientas computacionales que combinan técnicas de modelado por homología con cálculos de mecánica cuántica (DTF-xTB) para construir y evaluar los modelos 3D plausibles de Fe2+/3+-Aβ1−42. Además, se evaluó un conjunto de ligandos tipo salen como potenciales agentes farmacológicos con afinidad por los iones de hierro que puedan competir para coordinar el hierro con el Aβ1−42. Nuestros resultados revelaron la formación de complejos Fe2+/3+-Aβ1−42 bien definidos, tanto en la fracción metálica como en la peptídica, y se caracterizaron las interacciones moleculares que estabilizan estos complejos al elucidar los entornos de coordinación y las preferencias de unión de los mismos, destacando la importancia de la parte peptídica para estabilizar los complejos. En cuanto a los ligandos, se han identificado tres mecanismos de acción, de acuerdo con los valores de potencial estándar de reducción y las afinidades obtenidas para los complejos metal-ligando: antioxidante, distribuidor y regulador, este ´ultimo propuesto en este trabajo. Finalmente, los modelos propuestos junto con los ligandos evaluados ofrecen valiosa información sobre el papel del hierro en la patología de la EA y en futuras estrategias para interferir en las reacciones redox promovidas por los complejos Fe2+/3+-Aβ1−42 (Texto tomado de la fuente).Interaction between iron and amyloid β peptide (Aβ) has been the subject of much attention in Alzheimer’s disease (AD) research because of its possible implications in the development of this patology.While prior studies have examined the coordination preferences of iron and Aβ1−42 peptide, the contribution of the peptidic moeity in stabilising these systems remains uninvestigated. In this work, a set of computational tools combining homology modeling techniques with quantum mechanical calculations (DTF-xTB) were used to built and evaluate several 3D models of Fe2+/3+-Aβ1−42. In addition, a set of salen-like ligands were evaluated as potential pharmacological agents with affinity for iron ions that can compete to coordinate iron with Aβ1−42 peptide. Our results revealed the formation of well-defined Fe2+/3+-Aβ1−42 complexes in both the metal and peptide moieties, and the molecular interactions that stabilize these complexes were characterized by elucidating the coordination environments and binding preferences of the complexes, emphasizing the importance of the peptide moiety in stabilizing the complexes. As for the ligands, three mechanisms of action have been identified, according to the standard reduction potential values and affinities obtained for the metal-ligand complexes, antioxidant, distributor and regulator, the latter proposed in this work. Finally, the proposed models together with the ligands evaluated provide valuable insights into the role of iron in the pathogenesis of AD and future strategies to interfere with the redox reactions promoted by Fe2+/3+-Aβ1−42 complexesxvi, 168 páginasapplication/pdfspahttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/570 - Biología::572 - Bioquímica000 - Ciencias de la computación, información y obras generales540 - Química y ciencias afines::541 - Química físicaTrabajo de grado - DoctoradoUniversidad Nacional de ColombiaRepositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiahttps://repositorio.unal.edu.co/info:eu-repo/semantics/openAccessENFERMEDAD DE ALZHEIMERAlzheimer's diseaseESTRUCTURA ELECTRONICAElectronic structureNEUROPEPTIDOSNeuropeptidesNEUROTRANSMISORESNeurotransmittersPRECURSOR DE PROTEINA BETA AMILOIDEAmyloid beta-protein precursorPROTEINA BETA AMILOIDEAmyloid beta-proteinEnfermedad de AlzheimerIones de hierroEstrés oxidativoAgentes multifuncionalesDFTxTB-GFN2Alzheimer’s diseaseIron ionsOxidative stressMultifunctional agents