Reconocimiento 4.0 InternacionalSierra Díaz, Diana CarolinaOspina Lagos, Sandra YanethSilva Igua, Liliana Esperanza2025-09-052025-09-052025-08-04https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/88630ilustraciones a color, diagramasObjetivo: Identificar variantes germinales en 63 genes de susceptibilidad al cáncer en mujeres con carcinoma epitelial invasivo de mama, analizar su correlación con los subtipos tumorales y las vías de señalización o procesos biológicos relacionados. Diseño: Estudio observacional. Pacientes: Mujeres con carcinoma epitelial invasivo de mama, reclutadas entre 2019 y 2022. Lugar: Hospitales de Bogotá, Medellín, Cali, Bucaramanga, Valledupar y ciudades del Eje Cafetero. Metodología: Mediante secuenciación de exoma completo (Whole Exome Sequencing-WES), se estudiaron 400 mujeres con cáncer de mama, analizando variantes germinales con frecuencias alélicas poblacionales entre 1 % y 5 %, en 63 genes de susceptibilidad al cáncer. Se empleó Weighted Gene Correlation Network Analysis (WGCNA), así como pruebas estadísticas, para analizar y evaluar la correlación genotipo-fenotipo. Resultados: Se identificaron 73 variantes germinales en 29 genes, presentes en el 99,25% de las pacientes. El análisis WGCNA agrupó estos genes en módulos con variantes recurrentes implicadas en vías tumorigénicas. Se identificaron seis grupos, cada uno correlacionado con un subtipo molecular: Luminal A, Luminal B, HER2 enriquecido y triple negativo. Se encontraron correlaciones con significancia estadística entre variantes germinales y subtipos tumorales (valor p = 0,0470). La prueba de Chi-cuadrado de Pearson evidenció una relación estadísticamente significativa entre módulos y subtipos tumorales (valor p = 0,0009995). Conclusiones: Las variantes germinales en diversas vías tumorigénicas se correlacionan con los subtipos moleculares del cáncer de mama, lo que evidencia la influencia del componente poligénico en su heterogeneidad. WGCNA permitió una mejor comprensión de esta relación y facilitó la identificación de correlaciones genotipo-fenotipo. Esta metodología, poco utilizada, ofreció ventajas significativas sobre métodos tradicionales para el análisis de los datos genómicos (Texto tomado de la fuente).Objective: To identify germline variants in 63 cancer susceptibility genes in women with invasive epithelial breast carcinoma, analyze their correlation with tumor subtypes and related signaling pathways or biological processes. Design: Observational study. Patients: Women with invasive epithelial breast carcinoma, recruited between 2019 and 2022. Location: Hospitals in Bogotá, Medellín, Cali, Bucaramanga, Valledupar, and cities in the Coffee Axis region. Methodology: Using whole-exome sequencing (WES), 400 women with breast cancer were studied, analyzing germline variants with population allele frequencies between 1% and 5% across 63 cancer susceptibility genes. Weighted Gene Correlation Network Analysis (WGCNA) was employed to analyze the correlation between genetic variants and statistical tests were used to evaluate the genotype-phenotype correlation. Results: Seventy-three germline variants were identified in 29 genes, present in 99.25% of patients. The WGCNA analysis grouped these genes into modules with recurrent variants involved in tumorigenic pathways. Six groups were identified, each correlated with a molecular subtype: Luminal A, Luminal B, HER2-enriched, and triple-negative. Statistically significant correlations were found between germline variants and tumor subtypes (p values = 0.0470). The Pearson chi-squared test showed a statistically significant relationship between modules and tumor subtypes (p = 0.0009995). Conclusions: Germline variants in various tumorigenic pathways correlate with molecular subtypes of breast cancer, highlighting the influence of the polygenic component on its heterogeneity. WGCNA allowed for a better understanding of this relationship and facilitated the identification of genotype-phenotype correlations. This methodology, underutilized, offered significant advantages over traditional methods for analyzing these data.127 páginasapplication/pdfspahttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/610 - Medicina y salud::615 - Farmacología y terapéutica610 - Medicina y salud::616 - EnfermedadesTrabajo de grado - MaestríaUniversidad Nacional de ColombiaRepositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiahttps://repositorio.unal.edu.co/info:eu-repo/semantics/openAccessNeoplasias de la MamaBreast NeoplasmsSecuenciación del ExomaExome SequencingSecuenciación Completa del GenomaWhole Genome SequencingAnálisis Mutacional de ADNDNA Mutational AnalysisVariaciones en el Número de Copia de ADNDNA Copy Number VariationsVariantes germinalesSusceptibilidad al cáncerSecuenciación de exoma completo (WES)Subtipos moleculares de cáncer de mamaWeighted Gene Correlation Network Analysis (WGCNA)Germline variantsCancer susceptibilityWhole exome sequencing (WES)Breast cancer molecular subtypes