Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 InternacionalCombita Rojas, Alba LucíaLópez-Kleine, LilianaGuevara Nieto, Hedda Michelle2025-10-222025-10-222025-04-21https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/89055ilustraciones, diagramas, fotografíasEsta tesis doctoral investiga los mecanismos moleculares de resistencia a la quimioterapia neoadyuvante (QNA) en mujeres colombianas con cáncer de mama en estadios II y III, mediante tres enfoques complementarios. El primer enfoque analizó muestras emparejadas pre y post-tratamiento de pacientes no respondedores mediante secuenciación de ARN. Se identificaron genes diferencialmente expresados clave como FOS y NR4A1 en todos los subtipos moleculares (Luminal A, Luminal B/HER2+, Luminal B/HER2- y Triple Negativo). El análisis reveló que la QNA modula vías moleculares asociadas con la resistencia, incluyendo la respuesta inmunológica, señalización celular, biosíntesis de estrógenos y organización de la matriz extracelular. Se observó además un aumento en la infiltración de células inmunitarias específicas en el microambiente tumoral post-tratamiento. El segundo enfoque comparó muestras pre-tratamiento entre respondedores y no respondedores, identificando genes como APOD, CCL19, GPR132, FGF10 y HBB. Destacó APOD como biomarcador potencial con efecto protector en pacientes Luminal B/HER2-. Las vías inmunológicas aparecieron enriquecidas en no respondedores, sugiriendo su papel crítico en los resultados del tratamiento. El tercer enfoque examinó la ascendencia genética, encontrando que, aunque globalmente no hubo asociación significativa con la respuesta, existieron variaciones específicas en las proporciones de ascendencia africana e indígena americana en subtipos particulares. Se validaron FGF10, WT1 y HLF como biomarcadores pronósticos. La investigación enfatiza la importancia de integrar análisis transcriptómico, dinámica del microambiente tumoral y ascendencia genética para desarrollar estrategias terapéuticas personalizadas que mejoren los resultados clínicos en poblaciones diversas. (Texto tomado de la fuente).This doctoral thesis investigates the molecular mechanisms of resistance to neoadjuvant chemotherapy (NAC) in Colombian women with stage II and III breast cancer through three complementary approaches. The first approach analyzed paired pre- and post-treatment samples from non-responder patients using RNA sequencing. Key differentially expressed genes such as FOS and NR4A1 were identified across all molecular subtypes (Luminal A, Luminal B/HER2+, Luminal B/HER2-, and Triple Negative). The analysis revealed that NAC modulates molecular pathways associated with resistance, including immune response, cell signaling, estrogen biosynthesis, and extracellular matrix organization. An increase in specific immune cell infiltration in the tumor microenvironment was also observed post-treatment. The second approach compared pre-treatment samples between responders and non-responders, identifying genes such as APOD, CCL19, GPR132, FGF10, and HBB. APOD stood out as a potential biomarker with a protective effect in Luminal B/HER2- patients. Immune pathways appeared enriched in non-responders, suggesting their critical role in treatment outcomes. The third approach examined genetic ancestry, finding that while there was no significant global association with response, specific variations existed in African and Native American ancestry proportions in particular subtypes. FGF10, WT1, and HLF were validated as prognostic biomarkers. The research emphasizes the importance of integrating transcriptomic analysis, tumor microenvironment dynamics, and genetic ancestry to develop personalized therapeutic strategies that improve clinical outcomes in diverse populations.xvii, 135 páginasapplication/pdfenghttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/610 - Medicina y salud::616 - EnfermedadesTrabajo de grado - DoctoradoUniversidad Nacional de ColombiaRepositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiahttps://repositorio.unal.edu.co/info:eu-repo/semantics/openAccessReceptor ErbB-2Receptor, ErbB-2BiomarcadoresBiomarkersNeoplasias de la MamaBreast NeoplasmsCáncer de mama invasivoQuimioterapia neoadyuvanteSubtipos molecularesRespuesta patológica completaMicroambiente tumoralBiomarcadores predictivosPerfiles de expresión génicaInvasive breast cancerNeoadjuvant chemotherapyMolecular subtypesPathological complete responseTumor microenvironmentPredictive biomarkersGene expression profiles