Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalLópez Álvarez, Diana CarolinaGimode, WinnieMarín Lenis, Diana Victoria2025-01-232025-01-232025-06-06https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/87359Ilustraciones, fotografías, tablasLa biotecnología cumple un papel de gran importancia en el mejoramiento de cultivos, para Manihot esculenta comúnmente conocida como yuca, los avances en mejoramiento genético en plantas han ido incrementando, a la fecha, se han realizado estudios de asociación de genoma completo (GWAS), para caracterizar la diversidad fenotípica del germoplasma con respecto a varios caracteres agronómicos. Por ello y basándose en estudios anteriores el objetivo de esta investigación fue identificar marcadores tipo SNPs (Polimorfismo puntual o variación en la secuencia de DNA) asociados a características de interés agronómico como porcentaje de materia seca gravimétrica (%MSG), tipo de planta (EP) y rendimiento t/ha (Rend) en un panel de 399 accesiones de yuca. Los datos fueron analizados a través de la metodología GWAS, el control de calidad de los datos se llevó a cabo utilizando GAPIT mediante el paquete lme4 en el software R. 4. Se identificaron 9 SNPs en rendimiento, 19 en porcentaje de materia seca, y ningún SNPs para tipo de planta, cada SNPs fue anotado e investigado en cada una de las plataformas bioinformáticas (NCBI, Panther, gramene, Uniprot, Interpro y Phytozome) para correlacionarlos directamente con los genes y proteínas codificantes, para posteriormente relacionarlas con las características de interés agronómico y más adelanté ser tenidas en cuenta en futuras investigaciones y proyectos en los programas de mejoramiento del programa de yuca en CIAT. (Texto tomado de la fuente)Biotechnology plays a crucial role in crop improvement, particularly for Manihot esculenta, commonly known as cassava. Advances in genetic improvement in plants have been steadily increasing. To date, genome-wide association studies (GWAS) have been conducted to characterize the phenotypic diversity of germplasm associated with various agronomic traits. Therefore, building on previous studies, the objective of this research was to identify Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers associated with agronomically significant traits such as dry matter content, plant type (EP), and yield in a panel of 399 cassava accessions. Data were analyzed through GWAS methodology, and data quality control was performed using GAPIT through the lme4 package in R software. Nine SNPs were identified for yield, nineteen for dry matter percentage, and no SNPs for plant type. Each SNP was annotated and investigated using various bioinformatics platforms (NCBI, Panther, Gramene, Uniprot, Interpro, and Phytozome) o directly correlate them with the coding genes and proteins. Subsequently, these correlations were linked to the agronomically significant traits and will be considered in future research and projects within the cassava improvement programs at CIAT.xv, 94 páginas + anexosapplication/pdfspahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/630 - Agricultura y tecnologías relacionadasTrabajo de grado - MaestríaUniversidad Nacional de ColombiaRepositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiahttps://repositorio.unal.edu.co/info:eu-repo/semantics/closedAccessMapeo de asociaciónAssociation mappingTécnica genéticaGenetic techniquesGenómicaGenomicsMejoramiento genéticoGenetic improvementMarcador genéticoGenetic markersFenotipadoPhénotypageYucaGWASSNPsPolimorfismoCassavaPolymorphism