Implementación de una metodología in silico usando el modelo oculto de Markov para la identificación de proteínas involucradas en el mecanismo de señalización con Ubiquitina en el sistema Uubiquitina-Proteosoma en el parásito Giardia intestinalis

Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalWasserman Lerner, Moises (Thesis advisor)Castellanos, Isabel Cristina2019-07-032019-07-032009https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/70430Nosotros desarrollamos un LINUX Bash Script para la identificación del sistema de Ubiquitinación usando el HMM. Identificamos 256 secuencias del sistema de Ubiquitinación en Giardia y seleccionamos una de estas secuencias para su estudio experimental; el ortólogo OTU. La actividad OTU de esta secuencia fue confirmada por primera vez en Giardia y en un organismo protozoario, siendo este el soporte de la pertinencia de nuestra aproximación bioinformática. / Abstract. We developed a LINUX Bash Scrip for the identification the Ubiquitin system using HMM. We identified 256 sequences of the Ubiquitin System in Giardia and one sequence was studied experimentally; it is a OUT ortolog. The OUT activity was confirmed for first time in Giardia and in a one Protozoan organism. This evidence is a supporting the usefulness of this bioinformatics.application/pdfspaDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology54 Química y ciencias afines / ChemistryImplementación de una metodología in silico usando el modelo oculto de Markov para la identificación de proteínas involucradas en el mecanismo de señalización con Ubiquitina en el sistema Uubiquitina-Proteosoma en el parásito Giardia intestinalisTrabajo de grado - Maestríahttp://bdigital.unal.edu.co/2695/info:eu-repo/semantics/openAccessGiardia intestinalisBioinformáticaModelo oculto de Markov (HMM)UbiquitinaciónBioinformaticsHidden Markov model (HMM)UbiquitinationOTUImplementation of a methodology in silico using hidden Markov model for identification of proteins involved in the system of signaling system with Ubiquitin in the Ubiquitin-proteasome in the parasite Giardia intestinalis