Caracterización de miRNAs involucrados en respuesta a infección por bacterias del género Xanthomonas en arroz y yuca

Abstract

Los microRNAs (miRNAs) son moléculas de RNAs pequeñas que juegan un papel importante en la regulación de la expresión génica en eucariotas mediante el silenciamiento de mRNAs complementarios (targets). En este trabajo se estudió su papel en interacciones con bacterias del género Xanthomonas en arroz y yuca. Mediante análisis bioinformático de librerías de RNAs pequeños se identificaron y cuantificaron miRNAs, y se estudió la expresión de los posibles targets. Se encontró que en yuca la respuesta mediada por miRNAs está caracterizada por la inducción de miRNAs que reprimen señalización por auxinas y por la represión de miRNAs involucrados en el control de genes de resistencia. Mientras que en arroz los miRNAs no parecen tener un papel crucial en defensa aunque la expresión de miRNAs varía en respuesta a distintas cepas bacterianas. Y se identificaron también posibles mecanismos de regulación transcripcional de miRNAs mediados por factores de transcripción vegetales y bacterianos.

Abstract. microRNAs (miRNAs) are small RNA molecules involved in the control of gene expression in eukaryotes through the silencing of complementary mRNAs (targets). This work addresses their role in interactions with bacteria from the genus Xanthomonas in rice and cassava. miRNAs were identified and quantified through the bioinformatic analyses of sRNA libraries and the expression of the possible targets was also studied. It was found that in cassava the response mediated by miRNAs is characterized mainly by the induction of miRNAs that repress auxin silencing and by the repression of miRNAs involved in the control of resistance genes. While in rice miRNAs seemed not to have a crucial role in defense even though the expression of miRNAs was variable in response to different bacterial strains. This work also addresses the identification of possible mechanisms of transcriptional regulation of miRNAs mediated by vegetal and bacterial transcription factors.