Intra and interspecific genetic diversity of yam (dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by aflp markers

Abstract

Knowing the genetic variability of yams, Dioscorea spp., supports the development of breeding and conservation strategies of this genetic resource. The aim of this study was to carry out the molecular characterization of 20 accessions of Dioscorea spp. using the AFLP molecular technique to determine the distribution of their intra and interspecific genetic variation. Using multiple correspondence analysis and level of reliability of the genetic groups by resampling, the results showed high genetic variability among the accessions studied giving as a result four genetic groups: D. alata L., D. rotundata Poir., D. esculenta (Lour.) Burkill and D. trifida L.f., which confirmed a correspondence between the morphological and molecular characterization. The average similarity values ranged from 41.81% in D. alata and D. rotundata, and 33.51% in D. trifida and D. esculenta. These data are consistent with previous morphological characterizations and systematics of the species in relation to their botanical sections. The analysis also revealed the heterogeneous composition of D. alata in the Colombian Caribbean region; these studies will help to define an adequate strategy for conservation to support future efforts in breeding programs.

Conocer la variabilidad genética del ñame, Dioscorea spp., permite apoyar estrategias de mejoramiento y conservación de este recurso fitogenético. El objetivo de este estudio fue la caracterización molecular de 20 accesiones de Dioscorea spp. mediante la técnica molecular de AFLP para determinar cómo se distribuye la variabilidad genética de manera intra e inter-específica. Los datos fueron analizados mediante los métodos de agrupación de correspondencia múltiple y análisis de similaridad de Dice, estableciendo los niveles de confiabilidad de los grupos genéticos mediante remuestreos. En términos de diversidad interespecífica, los valores promedios de similitud variaron entre 41.81% entre D. alata L. y D. rotundata Poir., y 33.51% entre D. trifida L.f. y D. esculenta (Lour.) Burkill, lo que sugiere alta diversidad genética entre las accesiones estudiadas, que formaron cuatro grupos genéticos: D. alata, D. rotundata, D. esculenta y D. trifida, confirmando correspondencia entre la caracterización morfológica, clasificación botánica y la caracterización molecular. En términos de diversidad intraespecífica para la especie D. alata, el análisis también reveló una composición heterogénea en la región Caribe colombiana. Estos estudios ayudarán a definir una estrategia adecuada para fines de conservación y apoyar los esfuerzos futuros en los programas de mejoramiento genético.