Clasificación genética de Streptococcus pneumoniae serotipo 3 de aislamientos invasores de Colombia

Abstract

Streptococcus pneumoniae serotipo 3 es una causa importante de neumonía, bacteriemia, meningitis y otras enfermedades invasivas en niños y adultos. En Colombia la frecuencia de este tipo capsular ha aumentado de 1,8% en el año 1994 a 11,3% en el año 2015. El objetivo de este estudio es establecer los genotipos circulantes de S. pneumoniae con tipo capsular 3 en aislamientos colombianos recuperados durante los años 1994 a 2015. Del total de 385 aislamientos de S. pneumoniae serotipo 3 recuperados a través de la vigilancia por el laboratorio de meningitis realizada por el Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud, se estimó un tamaño muestral de 121 aislamientos, tomando como prevalencia esperada la obtenida en el año 2013 de 11,2%, Para la identificación de los genotipos se utilizó Electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), Los patrones electroforéticos se analizaron según los criterios de Tenover y el programa Gel Comprar y la tipificación de tipos de secuencia de multilocus (MLST) se determinó en cinco aislamientos representativos. El 91.7% se agruparon en el patrón electroforético A, presentando un porcentaje de similaridad genética mayor del 77% relacionándose con el clon Netherlands3-31-ST180; cuatro aislamientos se relacionaron genéticamente con el tipo de secuencia ST180, un aislamiento es variante del ST180, presentando una variante en el alelo aroE con el ST9162. Estos resultados muestran la circulación continua en el país y la homogeneidad clonal de aislamientos de S. pneumoniae serotipo 3 relacionados genéticamente con el clon internacional Netherlands3-31-ST180 y aportan información para comprender la epidemiología de S. pneumoniae en Colombia y el mundo.

Abstract: Streptococcus pneumoniae serotype 3 is an important cause of pneumonia, bacteremia, meningitis and other invasive diseases in children and adults. In Colombia, the frequency of this capsular type has increased from 1.8% in 1994 to 11.3% in 2015. The aim of this study was to establish the circulating genotypes of S. pneumoniae with capsular type 3 in Colombian isolates recovered between 1994 to 2015. Of the total of 385 isolates of S. pneumoniae serotype 3 recovered through surveillance by the laboratory of meningitis by the Microbiology Group of the National Institute of Health, a sample size of 121 isolates was estimated, taking the prevalence of the year 2013 (11.2%). Identification of the genotypes was made by Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), The electrophoretic patterns were oriented according to the Tenover criteria and the program and the multilocus typing of sequence (MLST) was determined in five representative isolates. 91.7% were grouped in the electrophoretic pattern A, presenting a percentage of genetic similarity greater than 77% related to the clone Netherlands3-31-ST180; Four isolates are genetically related to the sequence type ST180, one isolate is variant of the ST180, presenting a variant in the allele ring with the ST9162. These results show the continuous circulation in the country and the clonal homogeneity of isolates of S. pneumoniae serotype 3 genetically related to the international clone Netherlands3-31-ST180 and provide information to understand the epidemiology of S. pneumoniae in Colombia and the world.