Impacto de la diversificación de variantes del SARS-CoV-2 durante la pandemia de COVID-19 en Colombia frente al escape de anticuerpos neutralizantes generados por inmunidad natural y vacunal

Abstract

La vigilancia genómica del SARS-CoV-2 en Colombia permitió identificar la importación y emergencia autóctona de variantes de preocupación (VOC) o de interés (VOI) del SARS-CoV-2 con mutaciones asociadas al escape inmunológico o resistencia a la acción de los anticuerpos neutralizantes (nAbs) generados por infección natural o vacunación. Las vacunas contra el COVID-19 autorizadas en Colombia fueron diseñadas antes de la emergencia de las VOC/VOI, por lo que este estudio se enfocó en evaluar la capacidad de las variantes locales para escapar a los nAbs inducidos por la vacunación. Se realizaron aislamientos de linajes del SARS-CoV-2 que circularon durante los años 2020-2022 en Colombia. Se evaluaron las respuestas de los nAbs en individuos convalecientes, individuos no expuestos al SARS-CoV-2 (naïve) con esquemas primarios de CoronaVac, BNT162b2, ChAdOx1 o Ad26.COV2.S, en individuos con refuerzo homólogo, heterólogo e individuos con inmunidad híbrida-heteróloga. Las respuestas de los nAbs se evaluaron mediante ensayos de neutralización y el título medio de neutralización (MN50) se calculó por el método de Reed-Muench. Finalmente, se evaluaron anticuerpos totales IgM/IgG contra los antígenos S1, S2, RBD y contra la proteína N del SARS-CoV-2, en individuos con inmunidad heteróloga e híbrida-heteróloga mediante paneles Luminex. El linaje B.1 con la mutación E484K demostró capacidad moderada de escape a nAbs de sueros convalecientes, mientras que los niveles de nAbs fueron entre 3,3 a 55 veces menores contra Mu, Delta y Ómicron, comparado con B.1.111 y Gamma en individuos naïve con vacunación primaria. Además, las respuestas de los nAbs contra Mu y Ómicron fueron significativamente mayores tras el refuerzo heterólogo comparado con el esquema primario u homólogo. Finalmente, no se observaron diferencias en los niveles de nAbs contra Ómicron y anticuerpos IgG contra la subunidad S1 y el RBD entre individuos con inmunidad heteróloga e híbrida-heteróloga. Los resultados sugieren que el refuerzo heterólogo rescata las respuestas neutralizantes contra VOI/VOCs a niveles comparables con individuos que presentan inmunidad híbrida. (Texto tomado de la fuente)

Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Colombia allowed us to identify the importation and autochthonous emergence of variants of concern (VOC) or of interest" (VOI) of SARS-CoV-2 with mutations associated with the escape of neutralizing antibodies (nAbs) generated by natural infection or vaccination Vaccines against COVID-19 authorized in Colombia were designed before the emergence of VOCs/VOIs, so this study sought to assess the ability of local variants to escape vaccination-induced nAbs. Isolations of SARS-CoV-2 lineages circulating in Colombia were performed between 2020 and 2022. The nAbs responses were evaluated in convalescent individuals, individuals with no history of previous SARS-CoV-2 infection (naïve), individuals with primary schemes of CoronaVac, BNT162b2, ChAdOx1, or Ad26.COV2.S, individuals with homologous, heterologous boost, and individuals with hybrid-heterologous immunity. nAbs responses were assessed by neutralization assays and the mean neutralization titer (MN50) was calculated by the Reed-Muench method. Finally, total IgM/IgG antibodies against the S1, S2, RBD, and N antigens of SARS-CoV-2 were evaluated in individuals with heterologous and hybrid-heterologous immunity using Luminex panels. The B.1 lineage with the E484K mutation demonstrated moderate escape capacity to nAbs from convalescent sera, while nAbs levels were 3.3 to 55-fold lower against Mu, Delta, and Omicron, compared to B.1.111 and Gamma in naïve individuals with primary vaccination. In addition, nAb responses against Mu and Omicron were significantly higher after heterologous boost compared to the primary or homologous regimen. Finally, no differences were observed in the levels of nAbs against Omicron and IgG antibodies against the S1 and the RBD antigens between individuals with heterologous and hybrid-heterologous immunity. The results suggest that heterologous boosting rescues neutralizing responses against VOI/VOCs at levels comparable to individuals with hybrid immunity.