Caracterización molecular de patógenos asociados a casos de enfermedad febril aguda indiferenciada en Leticia y Villavicencio

Abstract

El síndrome febril agudo indiferenciado (EFAI) se refiere a un conjunto de enfermedades que, además de fiebre, se manifiestan con síntomas como dolor de cabeza, malestar general, falta de apetito, entre otras, lo que dificulta el diagnóstico. Estas enfermedades pueden estar asociadas a infecciones virales, bacterianas y parasitarias, por lo que su diferenciación requiere el uso de técnicas especializadas que son poco accesibles en las regiones más vulnerables. En este trabajo se diseñaron y validaron estrategias de detección molecular con PCR múltiplex para virus como dengue, zika, chikunguña y oropouche, bacterias como Leptospira spp, Rickettsia spp, Borrelia spp, Anaplasma spp, Brucella spp y Bartonella spp y parásitos Plasmodium spp. Se tamizaron muestras de pacientes febriles de Leticia y Villavicencio entre enero de 2021 y mayo de 2022, usando una estrategia de pools. Se logró la validación exitosa de las técnicas PCR multiplex con eficiencias mayores a 90% y coeficientes de variación (CV) menores al 10%, sin perder sensibilidad respecto a la PCR singleplex. Se detectó la presencia de dengue (2.24% y 13.81%) y malaria (1.2% y 1.29%) en Villavicencio y Leticia respectivamente, pero sólo en Leticia se detectó oropouche (0.22%). Sin embargo, un alto porcentaje de casos fueron no identificados, lo cual demuestra el reto que representan las EFAI en nuestro país, pues sólo teniendo estrategias accesibles, confiables y rápidas, será posible identificar de forma oportuna las causas para ofrecer el tratamiento más adecuado, prevenir futuros brotes o epidemias por patógenos nuevos o poco estudiados. (Tomado de la fuente)

Acute undifferentiated febrile syndrome (AIFS) refers to a group of diseases that, in addition to fever, manifest with symptoms such as headache, general malaise, and lack of appetite, among others, which makes diagnosis difficult. These diseases can be associated with viral, bacterial, and parasitic infections, so their differentiation requires the use of specialized techniques that are not accessible in the most vulnerable regions. In this work, multiplex PCR molecular strategies were designed and validated for the detection of viruses such as dengue, zika, chikunguña, and oropouche, bacteria such as Leptospira spp, Rickettsia spp, Borrelia spp, Anaplasma spp, Brucella spp, and Bartonella spp, and parasites Plasmodium spp. Using a pooled strategy, samples of febrile patients from Leticia and Villavicencio were screened between January 2021 and May 2022. Successful validation of multiplex PCR tests was achieved with efficiencies greater than 90% and coefficients of variation (CV) less than 10%, without losing sensitivity with respect to singleplex PCR. The presence of dengue (2.24% and 13.27%) and malaria (1.2% and 1.4%) was detected in Villavicencio and Leticia respectively, but only in Leticia was oropouche detected (0.22%). However, a high percentage of cases were not identified, which demonstrates the challenge that EFAI represents in our country, since only by having accessible, reliable, and rapid strategies, it will be possible to identify the causes in a timely manner to identify the most appropriate treatment, prevent future outbreaks or epidemics by new or poorly studied pathogens.