Listar Maestría en Bioinformática por título
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Análisis automatizado de Dominios ancestrales asociados al sistema inmune en cordados basales dentro de un contexto evolutivo
Esta tesis tiene como objetivo la construcción de un flujo automatizado de trabajo que integre diferentes procesos, la información de bases de datos y los modelos computacionales requeridos para identificar dominios asociados ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Análisis de metodologías estadísticas en RNA-seq, con aplicación a cáncer de pulmón
La identificación de genes expresados diferencialmente en un grupo de pacientes que padezcan una enfermedad, es un primer paso en el desarrollo de procedimientos para la detección temprana de dicha enfermedad en los pacientes ... -
Análisis del efecto de la cafeína en un modelo computacional de neurona dopaminérgica, en relación a la enfermedad de Parkinson
La enfermedad de Parkinson es la segunda enfermedad neurodegenerativa de mayor importancia en el mundo después de la enfermedad de Alzheimer, afectando entre el 1% de los adultos mayores de 65 años y el 2% de los adultos ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Asociación de variantes en regiones codificantes de genes con datos clı́nicos en pacientes colombianos usando minerı́a de datos
En esta tesis de maestrı́a se propone un modelo para el análisis de variantes en regiones codificantes de genes en pacientes colombianos. Los datos corresponden a 227 pacientes a los cuales se les secuenciaron 4813 genes ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial Ingeniería de Sistemas. -
Búsqueda de compuestos inhibidores de la enzima dihidroorotato deshidrogenasa de Leishmania spp a través de estrategias de mecánica molecular
La leishmaniasis es una enfermedad infecciosa causada por protozoos del genero Leishmania, los cuales son parásitos intracelulares obligados, siendo endémica en zonas tropicales y subtropicales. Esta patología se presenta ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial Ingeniería de Sistemas. -
Comparación de genes que codifican resistencia antibiótica en Mycobacterium avium Complex y Mycobacterium tuberculosis Complex
En la actualidad, los complejos M. avium (MAC) y M. tuberculosis (MTBC) son considerados como agentes etiológicos en enfermedades como la tuberculosis humana, una de las 10 principales causas de mortalidad en el mundo. ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Construcción de una plataforma computacional para la identificación de relaciones sinténicas entre subregiones genómicas asociadas al sistema inmune innato del organismo D. vexillum y otros tunicados
This works presents protocols and results associated to identify sintenic relationships between subgenomics regions associated with the innate immune system of the organism Didemnum vexillum and other Tunicates. In order ... -
Detección automatizada de pequeños fragmentos derivados de RNAs no-codificantes expresados diferencialmente frente a la infección del virus Dengue
En los últimos años, el uso cada vez mayor de las tecnologías de secuenciación de nueva generación para el estudio del transcriptoma ha llevado al descubrimiento de un nuevo fenómeno biológico llamado fragmentación ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial Ingeniería de Sistemas. -
Diseño, modelamiento y evaluación in silico de péptidos que reconocen antígeno Tn
El antígeno Tn (GalNac α-Ser / Thr) fue descrito por primera vez en pacientes con una rara enfermedad hemolítica (síndrome Tn), y desde que se descubrió su presencia en el 90 % de los carcinomas a mediados de la década de ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Estrategia computacional para detección y caracterización de bloques microsíntenicos relacionados a regiones genómicas asociadas a domesticación en frijol Lima
El frijol Lima (Phaseolus lunatus L.) es la segunda especie domesticada más importante del género Phaseolus y es de interés desde el punto de vista agronómico y ecológico por el amplio rango de adaptaciones agro-ecológicas ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Estudio computacional del recambio de genes y pseudogenes de microRNAs en genomas del subphylum Tunicata
En el presente trabajo se describen los principales conceptos, métodos, desarrollos y aplicaciones requeridos para estudiar computacionalmente el recambio de genes y pseudogenes de microRNAs en genomas del subphylum ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Evaluación de herramientas bioinformáticas útiles en la tipificación de Klebsiella pneumoniae y Pseudomonas aeruginosa a partir de datos de secuenciación de genomas completos
La Secuencia del Genoma Completo se obtiene mediante las tecnologías de secuenciación, especialmente las de próxima generación (NGS). Gracias a su alto poder discriminatorio, simplicidad, precisión, velocidad y flexibilidad, ... -
Evaluación de métodos de comparación de redes biológicas y su capacidad para detectar estructuras similares
Las redes biológicas son una herramienta muy útil para poder analizar cómo interactúan diferentes moléculas para llevar a cabo procesos celulares. Para un mismo conjunto de genes o proteínas, y diferentes organismos se ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Herramienta de software para identificación y tipificación de bacterias a partir de información genómica
El objetivo principal de este trabajo se basa en la premisa que, si tuviéramos un paciente que presente una IAAS, del cual se ha podido extraer y aislar la bacteria que genera la infección, pero no sabemos nada sobre ella ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial. -
Identificación de reacciones controladoras en un modelo computacional multi-ómico astrocitario de lipotoxicidad inducida por ácido palmítico
Los astrocitos juegan un papel importante en varios procesos en el cerebro, incluidas condiciones patológicas como las enfermedades neurodegenerativas. Estudios recientes han demostrado que el aumento de ácidos grasos ... -
Identificación y clasificación de las rutas metabólicas de las especies de Leptospira spp
El aislamiento de Leptospira spp. es considerado como la prueba de laboratorio de mayor fiabilidad para el diagnostico de leptospirosis. Sin embargo, las limitaciones del cultivo impiden su implementación para el diagnostico ... -
Identifying proteins and metabolic pathways associated with the neuroprotective response mediated by tibolone in astrocytes under an induced inflammatory model
En este trabajo, se identificaron las proteínas y rutas metabólicas asociadas a la respuesta neuroprotectora mediada por el neuroesteroide sintético tibolona bajo un modelo inflamatorio inducido por palmitato usando análisis ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial Ingeniería de Sistemas. -
Método computacional para establecer un esquema de identificación de Mycobacterium tuberculosis a partir de secuencias genómicas
El complejo Mycobacterium tuberculosis es un grupo de agentes patógenicos caracterizados principalmente por causar tuberculosis en distintos animales. En la actualidad métodos más eficientes y efectivos para identificar ... -
Modelado computacional de astrocito humano usando datos de transcriptómica y proteómica
Aunque la astrogliosis está relacionada con eventos neuroprotectores; su neurotoxicidad se ha correlacionado con enfermedades neurodegenerativas y otros desórdenes (Sofroniew & Vinters, 2010). Lo que ha aumentado la ... -
Modelado computacional de redes multinivel para la identificación del conjunto de factores, procesos y asociaciones moleculares comunes en diferentes redes biológicas
La biología de redes ha permitido el estudio de complejas relaciones moleculares dentro de una célula por medio de datos obtenidos a partir de técnicas de alto rendimiento, con ello algunas hipótesis acerca ...Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e Industrial.