Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU

Abstract

Resumen: La presente tesis de Maestría en Ingeniería de Sistemas se centra en el seguimiento 4D de microorganismos a velocidad de video. Por medio de la microscopía holográfica digital sin lentes se adquiere la información del sistema microscópico y con técnicas de reconocimiento de patrones en el procesamiento digital de imágenes se lleva a cabo su seguimiento 4D (espacio 3D y tiempo). Ambas técnicas son implementadas con soporte en la arquitectura GPGPU para su operación a velocidad de video. La validez científica y tecnológica de la tesis subyace en el hecho que el seguimiento de microorganismos a ratas de video potencializará distintas aplicaciones en áreas como la salud, el monitoreo del medio ambiente y el combate del terrorismo biológico, entre otros. La metodología desarrollada en esta tesis permite seguir en 4D microorganismos de dimensiones en el orden de los 100 μm en volúmenes de muestra de 1mm3, a una velocidad máxima de 8 cuadros por segundo.

Abstract: This Master’s thesis in Systems Engineering focuses on the monitoring of microorganisms in 4D at video rate. By using digital lensless holographic microscopy the microscopic information of the system is acquired and with pattern recognition techniques in digital image processing it is carried out the tracking in 4D (3D in space and time). Both techniques are implemented in the GPGPU architecture for operation at video rate. The technological and scientific validity of the thesis lies on the fact that the monitoring of microorganisms at video rate will potentiate different applications in areas such as health, environmental monitoring and combating bioterrorism, among others. The methodology developed in this thesis can track in 4D microorganisms of dimensions in the order of 100 μm, in 1 mm3 sample volumes, at a maximum rate of 8 frames per second.