Filogeografía y estructura genética del chigüiro Hydrochoerus hydrochaeris (RODENTIA: HYDROCHOERIDAE) en los llanos orientales de Colombia

Abstract

Este estudio evaluó la estructura de la población de Hydrochoerus hydrochaeris en los llanos orientales colombianos y evaluó si las características geográficas de la región influencian la estructura observada. El estudio incluyó 104 secuencias de fragmentos de genes mitocondriales de chigüiro (67 secuencias del gen D-loop y 37 de citocromo B) y un conjunto de 8 microsatélites para 34 muestras de los departamentos de Arauca, Casanare y Meta. El uso conjunto de marcadores mitocondriales y nucleares permitió observar que las poblaciones de H. hydrochoerus presentan una diversidad genética baja y no presentan estructura genética a lo largo de la región. Al comparar con otras poblaciones suramericanas, se encontró que la población colombiana es la que presenta menor estructuración genética y la menor diversidad genética después de las poblaciones venezolanas. Los resultados sugieren que la población colombiana pasó recientemente por un evento de cuello de botella y que en los llanos venezolanos existe un mayor efecto de la cacería furtiva sobre la estructura poblacional de la especie. Sin embargo, para comprobarlo es necesario realizar un análisis de estas poblaciones con marcadores microsatelitales que permitan obtener información de la historia reciente de la población. Finalmente, recientes eventos de expansión de poblaciones fueron observados en poblaciones colombianas. Eventos similares han sido observados también en Paraguay y la especie H. isthmius, los cuales parecen estar asociados a eventos climáticos (Texto tomado de la fuente).

This study aimed to characterize the population structure of Hydrochaeris hydrochoerus in the Eastern plains of Colombia, and to evaluate whether the geographical characteristics of the region influence the observed structure. The study included 104 mitochondrial sequences (67 of Dloop and 37 of cytochrome B) and a set of 8 microsatellites for 34 individuals from Arauca, Casanare, and Meta (Colombia). Overall, using this set of mitochondrial and nuclear genes, populations exhibited a low genetic diversity and did not show a genetic structure across the region. Colombian populations have the lowest genetic structure and the second lowest genetic diversity in South America, and the Venezuelan populations are the least diverse. These results suggest a greater effect of furtive hunting on the genetic structure of capybara populations from Colombia and Venezuelan plains. Nevertheless, further studies of Venezuela populations using microsatellites are required to better understand the actual effect of this anthropic activity. Finally, recent events of population expansion were observed in Colombian populations. Similar events have been also observed in Paraguay and H. isthmius populations; these events seem to be associated to past climatic events.