Diversidad de hongos y bacterias presentes en suelos de bosques tropicales de la Cordillera Occidental-Valle del Cauca en respuesta a un gradiente altitudinal

Abstract

Se realizó una caracterización taxonómica bacteriana (16S) y fúngica (ITS) utilizando metabarcoding sobre un gradiente altitudinal en la cordillera occidental del Valle del Cauca, Colombia, que incluyó ecosistemas de Bosques Andino, Seco Tropical y Páramo en las localidades de Laguna de Sonso (LS) (900 msnm), Yotoco (Yt) (1800 msnm), Bosque del Duende (BD) (2400 msnm) y páramo del Duende (PDU) (3200 msnm). Los análisis fisicoquímicos mostraron suelos con materia orgánica alta (>10%), sin problemas de compactación, pHs extremadamente ácidos (4,4) para zonas con mayor altitud, ligera y fuertemente ácidos en zonas bajas (5,5-6,1). Se identificaron 59 familias de plantas en las zonas de muestreo, siendo las más abundantes Araceae, Lauraceae y Fabaceae. Las asignaciones taxonómicas bacterianas fueron dominadas por los phyla Acidobacteriota (33,1%) y Proteobacteria (23,9%), para hongos dominaron Ascomycota (38,6%,) y Basidiomycota (11,3%). En general los análisis diversidad alfa mostraron alta diversidad, riqueza y baja dominancia, demostrando que las comunidades son altamente diversas, mientras la diversidad beta reflejó las diferencias de la composición en las localidades y la heterogeneidad de estas. Las predicciones funcionales reflejaron que la abundancia absoluta más alta para bacterias presentó actividad quimioheterotrofa y se relaciona con diferentes componentes del ciclo del nitrógeno mientras en hongos se clasifica por gremios ecológicos, donde los relacionados con actividad patogénica tanto en animales como en plantas, endofitismo, saprofitismo y epifitos fueron más representativos. Los resultados encontrados demuestran una variabilidad genética ecológica de los microorganismos entre las zonas de muestreo, además, respondieron a los cambios fisicoquímicos y de vegetación propios del gradiente altitudinal. (Texto tomado de la fuente)

A bacterial (16S) and fungal (ITS) taxonomic characterization was carried out using metabarcoding over an altitudinal gradient in the western mountain range of Valle del Cauca, Colombia, which included ecosystems of Andean, Tropical Dry and Paramo Forests in the localities of Laguna de Sonso (LS) (900 masl), Yotoco (Yt) (1800 masl), Bosque del Duende (BD) (2400 masl) and paramo of Duende (PDU) (3200 masl). The physicochemical analyses showed soils with high organic matter (>10%), no compaction problems, extremely acidic pHs (4.4) for higher altitude zones, and slightly and strongly acidic in lower zones (5.5-6.1). Fifty-nine plant families were identified in the sampling areas, the most abundant being Araceae, Lauraceae, and Fabaceae. Bacterial taxonomic assignments were dominated by the phyla Acidobacteriota (33.1%) and Proteobacteria (23.9%), for fungi Ascomycota (38.6%) and Basidiomycota (11.3%). In general, alpha diversity analyses showed high diversity, richness, and low dominance, demonstrating that the communities are highly diverse. In contrast, beta diversity reflected the differences in the composition of the localities and their heterogeneity. Functional predictions reflected that the highest absolute abundance for bacteria presented chemoheterotrophic activity and was related to different components of the nitrogen cycle. At the same time, fungi were classified by ecological guilds, where those related to pathogenic activity in animals and plants, endophytes, saprophytes, and epiphytes were more representative. The results show an ecological genetic variability of the microorganisms among the sampling zones, in addition, they responded to the physicochemical and vegetation changes characteristic of the altitudinal gradient.