Identificación de genes que se expresan en la lámina foliar de plantas de arroz (Oryza sativa L)

Abstract

Con el fin de identificar genes de expresión específica en hojas de plantas de arroz de la variedad colombiana Fedearroz 60, cuyas regiones promotoras pudieran ser aisladas y utilizadas a futuro en los procesos transformación genética cultivares colombianos, se realizó una búsqueda en bases de datos de artículos, del genoma del arroz y de resultados de expresión diferencial. Para un total de 24 genes encontrados en dicha búsqueda, se capturo la secuencia y se revisó su estado de propiedad intelectual, en bases de datos de patentes. Teniendo en cuenta lo anterior se seleccionó nueve genes de posible expresión específica en hojas y libres de patentes. Para la verificación de la presencia de los se utilizó PCR. La expresión del RNA mensajero de los nueve genes se evaluó mediante RT-PCR en hojas, tallos, raíces, inflorescencias y semillas de las plantas, en seis estados fenológicos y en dos condiciones de cultivo diferentes. Para tales efectos, se establecieron las condiciones para la extracción de DNA y RNA de todas las muestras. El gen Actina1 de expresión constitutiva, se usó como control en cada uno de los pasos de la verificación. Los genes denominados como OsAhip y OsXTH24 tuvieron un patrón de expresión diferente al presentado por los otros siete genes OsXTH22, OsCatA, OsCatC, OsXTH24, OsRSSU, OsRNAbp y OsPPDK, teniendo en cuenta la expresión Actina1. Sin embargo, se encontró que ninguno de los nueve genes tiene expresión específica en las hojas de plantas de arroz de la variedad Fedearroz 60. / Abstract: Articles, genome sequence and differential expression results searches were made for the identification of leaf specific expressed genes from rice plants of the variety Fedearroz 60, whose promoter regions could be isolated and used in plant transformation processes of Colombian rice cultivars. 24 genes were identified, their sequences were captured and intellectual property state was checked in patents databases. Nine genes with possible leaf specific expression and patent free were selected. PCR was used to verify genes presence. Messenger RNA expression from the nine genes was evaluated through RT-PCR in leaves, stems, roots, inflorescences and seeds from plants, into six phonological states and two different culture types. DNA and RNA extraction conditions were established in all the samples. Actin1 gene with constitutive expression was used as gene control for the verification and evaluation reactions. OsAhip and OsXTH24 showed a different expression pattern from the other genes OsXTH22, OsCatA, OsCatC, OsXTH24, OsRSSU, OsRNAbp and OsPPDK, taking into account Actin1 expression. However, none of the nine genes had leaf specific expression in Fedearroz 60 plants.