• Correo ElectrónicoCorreo Electrónico
  • Dirección Nacional de Información AcadémicaDNINFOA - SIA
  • BibliotecaBibliotecas
  • ConvocatoriasConvocatorias
  • Identidad U.N.Identidad U.N.
Escudo de la República de ColombiaEscudo de la República de Colombia
  • English 
    • español
    • English
    • português (Brasil)
  • Aspirantes
  • Estudiantes
  • Egresados
  • Docentes
  • Administrativos
repositorio.unal.edu.co
Bibliotecas
  • Mapa de sedes
  • Amazonía
  • Bogotá
  • Caribe
  • Manizales
  • Medellín
  • Orinoquía
  • Palmira
Biblioteca Digital
  • Repositorio Institucional
  • Entrega de tesis y publicación en línea
  • Digitalización de documentos
  • Normatividad publicación en línea
  • Portal de Revistas UN
  • Suscripción a contenidos UN
  • Contáctenos
Recursos Bibliográficos
  • Recursos electrónicos
  • Catálogo UN
  • Diccionarios y enciclopedias
  • Herramientas bibliográficas
  • Libros electrónicos
  • Descubridor
  • Índices bibliográficos
  • Adquisicion de material bibliografico
Formación
  • Agenda de formación
  • Solicitud de nuevo taller
  • Guía de autoarchivo de documentos
Acerca de
  • Misión y visión
  • Dirección Nacional de Bibliotecas
  • Convenios y redes
  • Video del Sinab
  • Preguntas frecuentes
Sedes
  • Amazonia
  • Bogotá
  • Caribe
  • De La Paz
  • Manizales
  • Medellín
  • Orinoquia
  • Palmira
  • Tumaco
Servicios
Perfiles
Home
    • español
    • English
    • português (Brasil)
  • Login
View Item 
  •   Institutional Repository of Universidad Nacional
  • 1- Tesis y Disertaciones
  • Sede Palmira
  • Departamento Facultad de Ciencias Agropecuarias
  • Maestría en Ciencias Biológicas
  • View Item
  •   Institutional Repository of Universidad Nacional
  • 1- Tesis y Disertaciones
  • Sede Palmira
  • Departamento Facultad de Ciencias Agropecuarias
  • Maestría en Ciencias Biológicas
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Búsqueda y caracterización de promotores de begomovirus endémicos de Colombia con potencial biotecnológico.

Thumbnail
2022-Viviana_Catalina_Corredor_Saenz.pdf (1.916Mb)
Date published
2018
Author
Corredor Saenz, Viviana Catalina
Metadata
Show full item record

Summary
Los begomovirus tienen genoma de DNA circular cadena sencilla, son transmitidos por mosca blanca Bemisia tabaci y afectan plantas dicotiledóneas de importancia económica. Las regiones promotoras de éstos virus fusionados a genes reporteros han mostrado una fuerte expresión tejido-específica en mesófilo y tejido vascular vegetal, lo que los convierte en excelente fuente de promotores que permitan la expresión biotecnológica diferencial de proteínas en plantas. El objetivo del presente trabajo fue buscar y caracterizar a nivel molecular, in silico y biológico la región promotora del gen de la proteína de la cápside (AR1) de begomovirus endémicos de Colombia con potencial biotecnológico. Se colectaron arvenses y se detectó por PCR la presencia de begomovirus. Se clonaron, secuenciaron y analizaron con herramientas bioinformáticas fragmentos virales que portan la región promotora del gen AR1. Finalmente, mediante ensayos de expresión transitoria sobre hojas de tabaco, se evaluó la expresión del promotor del gen AR1 del virus del mosaico amarillo de la papa (PYMV) en presencia y ausencia de un transactivador (TrAp). Se detectó la presencia de begomovirus en 19 arvenses, de las cuales, Sida acuta y Acalypha sp, constituyen un reporte nuevo a nivel de Colombia y Latinoamérica como hospedero begomoviral. Se identificaron dos nuevos begomovirus aislados de las arvenses Rivina humilis y Malvastrum sp. El análisis de las regiones promotoras de AR1 de los begomovirus aislados de arvenses y PYMV permitió identificar 12 elementos cis regulatorios: Cajas I, Cajas P, cajas G, cajas W, elemento C-Repeat-DRE, elemento ABRE, elemento ERE, elemento TGACG, elemento AS-1, motivo TCT, motivo TGA y CLEs. La organización de éstos elementos cis regulatorios podría explicar la regulación en el tropismo de tejido observado en el gen AR1 de PYMV, la cual es especifica de mesofilo y en presencia de su propia fuente de TrAP este es capaz de invadir células vasculares.
 
//Abstract: Begomoviruses have a single-stranded circular DNA genome, are transmitted by whitefly Bemisia tabaci and affect dicotyledonous plants of economic importance. The promoter regions of these viruses fused to reporter genes have shown strong tissue-specific expression in mesophyll and vascular plant tissue, which makes them an excellent source of promoters that allow the differential biotechnological expression of proteins in plants. The objective of the present work was to search and characterize at the molecular, in silico and biological level the promoter region of the capsid protein gene (AR1) of Colombian endemic begomoviruses with biotechnological potential. Weeds were collected and the presence of begomovirus was detected by PCR. Viral fragments carrying the promoter region of the AR1 gene were cloned, sequenced and analyzed with bioinformatics tools. Finally, through transient expression assays on tobacco leaves, the expression of the promoter of the AR1 gene of potato yellow mosaic virus (PYMV) was evaluated in the presence and absence of a transactivator (TrAp). The presence of begomovirus was detected in 19 weeds, of which, Sida acuta and Acalypha sp, a new level of Colombia and Latin America was reported as a begomoviral host. Two new begomoviruses was isolated from the weeds Rivina humilis and Malvastrum sp. The analysis of the AR1 promoter regions of the begomoviruses isolated from weeds and PYMV allowed the identification of 12 cis regulatory elements: Boxes I, Boxes P, Boxes G, Boxes W, element C-Repeat-DRE, element ABRE, Element ERE, element TGACG, element AS-1, motif TCT, motif TGA and CLEs. The organization of these cis regulatory elements could explain the regulation in tissue tropism observed in the AR1 gene of PYMV, which is mesophilic specific and in the presence of its own source of TrAP it is capable of invading vascular cells.
 
Subject
Arvenses ; Begomovirus ; Biobalística ; Expresión transitoria ; Promotores ; PYMV ; Transactivacion homóloga ; Weeds ; Begomovirus ; Biolistic ; Promoters ; PYMV ; Transient Expression ; Homologous transactivation ;
URI
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/68934
Collections
  • Maestría en Ciencias Biológicas [61]

Browse

All of DSpaceCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesKnowledge AreasThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesKnowledge Areas

My Account

LoginRegister

Statistics

View Google Analytics Statistics
Régimen Legal
Talento humano
Contratación
Ofertas de empleo
Rendición de cuentas
Concurso docente
Pago Virtual
Control interno
Calidad
Buzón de notificaciones
Correo institucional
Mapa del sitio
Redes Sociales
FAQ
Quejas y reclamos
Atención en línea
Encuesta
Contáctenos
Estadísticas
Glosario

Contacto página web:
Carrera 45 # 26-85
Edif. Uriel Gutiérrez
Bogotá D.C., ; Colombia
(+57 1) 316 5000

© Copyright 2014
Algunos derechos reservados.
mediosdigitales@unal.edu.co
Acerca de este sitio web

Actualización: 04/10/19

Orgullo UNOrgullo UNAgencia de noticiasAgencia de noticias
Trámites en líneaContaduría General de la República