Estudio de cepas de Mycobacterium leprae colombiano causantes de múltiples episodios sintomáticos de lepra post poliquimioterapia
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Type
Trabajo de grado - Doctorado
Document language
EspañolPublication Date
2021-07-26Metadata
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La lepra es una enfermedad dermato-neurológica crónica, causada por Mycobacterium leprae, que en Colombia causa cerca de 400 casos nuevos cada año. La lepra se trata con una poliquimioterapia (PQT) y su eficacia es establecida por el seguimiento de casos recurrentes de la enfermedad. Debido a que la recurrencia no puede ser diferenciada en recaída o reinfección clínicamente, en el presente estudio, usamos técnicas de secuenciación total de ADN (genoma) y ARN (transcriptoma), con el fin de conocer algunas características genómicas y transcriptómicas de cepas de M. leprae asociadas con múltiples episodios de lepra post-PQT en Colombia. A partir de biopsias provenientes del diagnóstico inicial y durante la recurrencia de la enfermedad, se aisló ADN y se realizó la secuenciación total de genomas de M. leprae causantes de cada evento y se analizaron in silico los conjuntos de secuencias resultantes. Los análisis de genómica comparativa de las cepas de M. leprae causantes de eventos recurrentes permitieron establecer tres hallazgos importantes: i) encontrar ciertas características genómicas que podrían diferenciar una recaída de una recaída y reinfección, ii) la relación genética entre cepas colombianas y cepas antiguas y modernas , además de cepas aisladas en otros hospederos, como el armadillo de nueve bandas y ardillas de cola roja y iii) establecer posibles efectos de las mutaciones identificadas en los genomas analizados. Por otra parte, también se pudo establecer la capacidad infectiva de cepas de M. leprae relacionadas con un evento inicial en comparación con cepas asociadas a eventos recurrentes en un modelo in vitro de infección de células de Schwann. Se pudo observar que la entrada inicial de M. leprae a las células de Schwann no depende de las características inherentes de las cepas (vivas o muertas, de pacientes de eventos recurrentes o nuevos) ni de la carga bacteriana usada para la infección; pero la capacidad de infectar más células a través del tiempo si depende de la viabilidad del bacilo. Los análisis transcripcionales muestran la actividad de genes involucrados en la virulencia y supervivencia, además de los genes codificantes de proteínas de choque térmico, los cuales favorecen la supervivencia de M. leprae en condiciones de estrés o durante el cultivo in vitro. Como un marcador de patogenicidad, mediante qPCR, se evaluaron los niveles de expresión de siete genes implicados en la síntesis de PGL-1 durante la infección de células de Schwann. Los resultados mostraron una expresión diferencial de ciertos genes que se sugieren una capacidad metabólica disminuida en el caso de M. leprae provenientes de pacientes con recaída. (Texto tomado de la fuente)Abstract
Leprosy is a chronic dermato-neurological disease caused by Mycobacterium leprae, which in Colombia causes about 400 new cases each year. Leprosy is treated with multidrug therapy (MDT) or polychemotherapy (PQT), and its efficacy is established by monitoring recurrent cases of the disease. Because recurrence cannot be clinically differentiated into relapse or reinfection, in the present study, we used total DNA (genome) and RNA (transcriptome) sequencing technique, in order to know some genomic and transcriptomic characteristics of M. leprae strains associated with multiple episodes of post-PQT leprosy in Colombia. From biopsies of initial diagnosis and during disease recurrence, DNA was isolated, and total genomes of M. leprae causing each event were sequence. The resulting sets of sequences were analyzed in silico. The comparative genomic analyzes of the M. leprae strains causing recurrent events allowed to us stablish three important findings: i) find certain genomic characteristics that could differentiate between relapse and reinfection, ii) the genetic relationship between Colombian strains and ancient, modern strains and strains isolated in other hosts, non-humans and iii) establish possible effects of the mutations identified in the genomes analyzed. An in vitro model of Schwann cell infection could establish the infective capacity of M. leprae strains from initial events compared to strains associated with recurrent events. It could be observed that the initial entry of M. leprae into Schwann cells does not depend on the inherent characteristics of the strains of patients with recurrent or new events or the bacterial load used for infection; but the ability to infect more cells over time depends on the genomic or metabolic characteristics of the bacillus. Transcriptional analyzes show the activity of genes involved in survival, in addition to genes encoding heat shock proteins, which favor the survival of M. leprae under stress conditions or during in vitro culture. As a marker of pathogenicity, by means of qPCR, the expression levels of seven genes involved in the synthesis of PGL-1 during the infection of Schwann cells were evaluated. The results showed a differential expression of certain genes that suggest a decreased metabolic capacity in the case of M. leprae from patients with relapse.Keywords
Genotipo ; Células de Schwann ; Recaída ; Reinfección ; Genotype ; Schwann Cells ; Relapse ; Reinfection ;
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