El herbario MEDEL es una colección de especímenes botánicos disecados siguiendo estándares internacionales para la organización, curaduría y preservación del material almacenado. En el Herbario se encuentran depositadas a final del 2015 cerca de 70.000 ejemplares botánicos comprendiendo alrededor de 9.000 especies que documentan una importante porción de la diversidad de flora de Colombia con especial énfasis en el departamento de Antioquia. El herbario posee alrededor de 400 especímenes tipo catalogados entre holotipos, isotipos y lectotipos y adicionalmente más de 500 paratipos no completamente catalogados. Estos especímenes son las principales referencias físicas que respaldan la existencia y significado de los nombres científicos y dan cuenta del aporte de la colección en la descripción de nuevas especies. También posee cerca de 23.000 ejemplares históricos, colectados entre 1919 y 1970 que tienen un valor especial ya que contienen información sobre la flora original de áreas hoy completamente transformadas. El Herbario MEDEL tiene como propósito principal generar conocimiento sobre la diversidad florística de Colombia y especialmente del noroccidente del país, con base en el enriquecimiento, curaduría y preservación de una colección de ejemplares botánicos y bibliografía especializada que contribuya con la misión universitaria de enseñar, investigar y prestar servicios a la comunidad. El Herbario MEDEL pretende contribuir significativamente al conocimiento de la flora nacional y consolidar la mejor colección de ejemplares del occidente, sur-occidente y páramos de Antioquia y la principal colección nacional de importancia agrícola. De este modo espera posicionarse a nivel nacional como uno de los principales centros de investigación en flora alto-andina, en flora del bosque seco y en botánica agrícola y económica.