Análisis filogenético del venado cola blanca Odocoileus virginianus en Colombia mediante ADN mitocondrial
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Resumen
El venado cola blanca (Odocoileus virginianus) presenta una amplia distribución, desde el sur de Canadá hasta el norte de la Amazonia brasileña, Perú, Ecuador y el noreste de Bolivia. Dada su amplia distribución y la presencia de variaciones fenotípicas en el tamaño y el color del pelaje, se han propuesto 38 subespecies. La región control del ADN mitocondrial se ha usado ampliamente en estudios genéticos de la especie; sin embargo, no existen tales para las poblaciones colombianas. Debido a las dificultades que conlleva el muestreo de individuos de cérvidos en vida silvestre, los recursos de las colecciones biológicas resultan cruciales para los estudios genéticos. En este estudio se analizó la diversidad genética de la especie en Colombia a partir de la región de control del ADNmt y se evaluaron las relaciones filogenéticas entre especímenes colombianos y otros venados a lo largo de su distribución. También se reportó la estructura de las repeticiones de la región RS2 de la región control para la especie en Colombia. Por último, se discute la importancia de los ejemplares de museo en el estudio de la diversidad biológica y las condiciones necesarias para obtener ADN para tal fin. El venado cola blanca en Colombia presenta una alta diversidad haplotipica y nucleotídica. Las reconstrucciones filogenéticas de IB y MV recuperaron una topología congruente, identificando un clado sudamericano diferenciado de los linajes norteamericanos. Dentro del grupo sudamericano se evidenció una estructuración geográfica de los grupos comparable con la literatura, mientras que el grupo norteamericano mostró un patrón parafilético con dos clústeres principales y linajes basales. Este estudio constituye la primera aproximación filogenética de O. virginianus en Colombia, con el mayor número de muestras a lo largo de su distribución en el país. (Texto tomado de la fuente)
Abstract
The white-tailed deer (Odocoileus virginianus) has a wide distribution, from southern Canada to northern Amazonia, Peru, Ecuador, and northeastern Bolivia. Due to its extensive range and phenotypic variation in size and pelage color, 38 subspecies have been proposed. The mitochondrial DNA control region has been widely used in genetic studies of the species; however, such studies have not been conducted for Colombian populations. Because of the difficulties involved in sampling live cervid individuals in the wild, biological collection resources are crucial for genetic research. In this study, the genetic diversity of the species in Colombia was analyzed based on the mitochondrial DNA control region, and the phylogenetic relationships of Colombian specimens with other deer across their distribution were evaluated. The structure of the repeats in the RS2 region of the D-loop for the species in Colombia was also reported. Finally, the importance of museum specimens in studying biological diversity and the conditions necessary to obtain DNA for such purposes are discussed. The white-tailed deer in Colombia exhibits high haplotype and nucleotide diversity. Phylogenetic reconstructions using IB and MV yielded a consistent topology, identifying a South American clade distinct from North American lineages. Within the South American group, a geographic structure of the groups was evident, consistent with the literature, while the North American group showed a paraphyletic pattern with two main clusters and basal lineages. This study constitutes the first phylogenetic analysis of O. virginianus in Colombia, with the largest
number of samples collected across its range in the country.
Descripción
ilustraciones, diagramas, fotografías, mapas, tablas
Palabras clave propuestas
ADN mitocondrial; Región control; Odocoileus virginianus; Venado cola blanca; Variación fenotípica; Filogenética; Repeticiones de la región RS2; Muestras de museo; Mitochondrial DNA; Control region; White-tailed deer; Odocoileus virginianus; Phenotypic variation; Phylogenetics; RS2 repeat region; Museum samples