Caracterización metabólica de tres mutantes sólidos de la variedad Colombia de Solanum tuberosum Gr. Phureja, por medio de modelado computacional e integración de datos ómicos
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Resumen
Caracterización in silico del metabolismo foliar de un control y tres mutantes sólidos de S. tuberosum Gr. Phureja var. Colombia como posible indicador del rendimiento de la tuberización. Con el marco COBRA se integraron datos transcriptómicos foliares bajo floración en un GEM y se estimó el flujo metabólico de cada genotipo. Los resultados revelan posibles estrategias de partición del C: Colombia presentó rendimiento intermedio-bajo y alta actividad metabólica inclinada hacia la ganancia de biomasa y almacenamiento transitorio, lo cual pudo limitar la exportación de fotoasimilados. Flor Blanca presentó rendimiento intermedio-alto y baja actividad metabólica, lo que podría priorizar la exportación de fotoasimilados sobre el uso local. Clon 39 presentó rendimiento alto y alta actividad metabólica con alta expresión de enzimas glucanasas, lo que sugiere una eficiente conversión y exportación de carbono. Clon 17 presentó rendimiento bajo y baja actividad metabólica con baja expresión, sugiriendo un manejo ineficiente del C. El rendimiento depende del metabolismo del C foliar. (Texto tomado de la fuente)
Abstract
In silico characterization of leaf metabolism in a control and three solid mutants of S. tuberosum Gr. Phureja var. Colombia as a potential indicator of tuberization yield. Using
the COBRA framework, leaf transcriptomic data under flowering were integrated into a
GEM, and the metabolic flux of each genotype was estimated. Results reveal possible Cpartitioning strategies: Colombia showed intermediate-low yield and high metabolic activity
tilted towards biomass gain and transient storage, which may have limited photoassimilate
export. Flor Blanca showed intermediate-high yield and low metabolic activity, possibly prioritizing photoassimilate export over local use. Clone 39 showed high yield and high metabolic
activity with high expression of glucanase enzymes, suggesting efficient carbon conversion
and export. Clone 17 showed low yield and low metabolic activity with low expression, suggesting inefficient C management. Yield depends on leaf C metabolism.
Descripción
ilustraciones, diagramas, tablas
Palabras clave propuestas
Términos Normalizados
Mutante; mutants; Metabolismo de las plantas; plant metabolism; Modelo matemático; mathematical models; 000 - Ciencias de la computación, información y obras generales::005 - Programación, programas, datos de computación; 630 - Agricultura y tecnologías relacionadas::631 - Técnicas específicas, aparatos, equipos, materiales