Caracterización morfológica y molecular de fitonematodos asociados a Musa spp., en el Valle del Cauca y el eje cafetero
Autores
Riascos Ortiz, Donald
Director
Tipo de contenido
Trabajo de grado - Doctorado
Idioma del documento
EspañolFecha de publicación
2019-10-20
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Resumen
Resumen: Con el propósito de ampliar la información taxonómica de los fitonemátodos asociados a cultivos de Musa spp., en el Valle del Cauca y el eje cafetero, en el presente estudio fueron colectadas muestras compuestas de raíces y suelo rizosférico en cultivos de plátano y banano de diferentes municipios del Valle del Cauca, Quindío, Risaralda y Caldas. A las muestras se les realizó la extracción, cuantificación e identificación de fitonemátodos hasta nivel de género. Posteriormente, a los géneros con mayor distribución geográfica y densidad poblacional se les realizó la identificación de especies mediante análisis morfológico como patrón perineal, morfométrico como mediciones de caracteres diagnósticos, bioquímico como perfil electroforético de esterasa y molecular como amplificación y secuenciación del segmento D2-D3 del ARN ribosomal, Citocromo oxidasa subunidad I y Nad5 del ADN mitocondrial. Se encontró que los géneros de fitonemátodos con mayor prominencia en raíces fueron Meloidogyne, Helicotylenchus, Radopholus, Pratylenchus y Rotylenchulus, con valores de 3869, 2396, 877, 65 y 10; mientras que en suelo rizosférico fueron Helicotylenchus, Meloidogyne, Rotylenchulus y Radopholus, con valores de 600, 373, 71 y 47, respectivamente. Con los análisis morfológicos, morfométricos, bioquímicos y moleculares se identificaron nueve especies de fitonemátodos, así: cuatro de Meloidogyne (M. incognita, M. incognita var. acrita, M. arenaria y M. hispanica), cuatro de Helicotylenchus (H. multicinctus, H. dihystera, H. cf. erythrinae y H. cf. californicus) y una de Rotylenchulus (R. reniformis).
//Abstract: For to amply the taxonomic information of the plant-parasitic nematodes associated with Musa spp. crops in the department of the Valle del Cauca and “eje cafetero”, in the present research were taken compound samples of roots and soil in plantain and banana crops of different municipalities of Valle del Cauca, Quindío, Risaralda and Caldas. Of the samples collected, were isolated, identified to the level genus and quantified the plant-parasitic nematodes. Posteriorly, the plant-parasitic nematodes of the genus with major geographic distribution and population density were identified to the level of specie through of morphological (perineal patterns), morphometric (measurements of diagnostic characters), biochemical (electrophoretic profile of esterase isozyme) and molecular (amplification and secuenciation of D2-D3 expantion segment of RNAr and Citochrome oxidase subunit I-COI and NAD5 of DNAmt) analysis. According with the results, the plant-parasitic nematodes genus with major prominence in roots were Meloidogyne, Helicotylenchus, Radopholus, Pratylenchus y Rotylenchulus, with value of 3869, 2396, 877, 65 y 10, while in soil were Helicotylenchus, Meloidogyne, Rotylenchulus y Radopholus with 600, 373, 71 y 47, respectively. According with morphological, morphometrical, biochemical and molecular data, nine plant-parasitic nematodes species were identified in plantain and banana, four of Meloidogyne (M. incognita, M. incognita var. acrita, M. arenaria y M. hispanica), four of Helicotylenchus (H. multicinctus, H. dihystera, H. cf. erythrinae y H. cf. californicus) and one of Rotylenchulus (R. reniformis).
//Abstract: For to amply the taxonomic information of the plant-parasitic nematodes associated with Musa spp. crops in the department of the Valle del Cauca and “eje cafetero”, in the present research were taken compound samples of roots and soil in plantain and banana crops of different municipalities of Valle del Cauca, Quindío, Risaralda and Caldas. Of the samples collected, were isolated, identified to the level genus and quantified the plant-parasitic nematodes. Posteriorly, the plant-parasitic nematodes of the genus with major geographic distribution and population density were identified to the level of specie through of morphological (perineal patterns), morphometric (measurements of diagnostic characters), biochemical (electrophoretic profile of esterase isozyme) and molecular (amplification and secuenciation of D2-D3 expantion segment of RNAr and Citochrome oxidase subunit I-COI and NAD5 of DNAmt) analysis. According with the results, the plant-parasitic nematodes genus with major prominence in roots were Meloidogyne, Helicotylenchus, Radopholus, Pratylenchus y Rotylenchulus, with value of 3869, 2396, 877, 65 y 10, while in soil were Helicotylenchus, Meloidogyne, Rotylenchulus y Radopholus with 600, 373, 71 y 47, respectively. According with morphological, morphometrical, biochemical and molecular data, nine plant-parasitic nematodes species were identified in plantain and banana, four of Meloidogyne (M. incognita, M. incognita var. acrita, M. arenaria y M. hispanica), four of Helicotylenchus (H. multicinctus, H. dihystera, H. cf. erythrinae y H. cf. californicus) and one of Rotylenchulus (R. reniformis).