Análisis de Polimorfismos en los genes ADAM10, BACE1, NCSTN y APOE en pacientes con enfermedad de Alzheimer de tipo esporádico en Antioquia (2011-2013)

Abstract

Este es un estudio preliminar de tipo exploratorio por factibilidad en el cual se genotipificaron, en el período comprendido entre el 2011 y 2013, 10 polimorfismos en los genes ADAM10, BACE1, NCSTN y APOE en pacientes con Enfermedad de Alzheimer de tipo esporádico e individuos control, pertenecientes a la región de Antioquia, teniendo en cuenta una hipótesis funcional en la cual, variaciones en estos genes, relacionados con el procesamiento y aclaramiento de la proteína precursora amiloide (APP, amyloid precursor protein) podrían estar relacionados con la susceptibilidad frente a la enfermedad. Se obtuvieron las frecuencias alélicas y genotípicas de los polimorfismos en pacientes con enfermedad de Alzheimer de tipo esporádico e individuos control y se determinaron los OR para cada uno. El análisis de asociación alélica permite determinar un OR de 2.09 (CI 1.20-3.62, p 0.0083) para el alelo C del marcador rs514049 de ADAM10 y un OR de 6.29 (CI 3.09-12.82, p 4.4x10-5) para el alelo C del marcador rs429358 de APOE. En el análisis de asociación genotípica se determinó un OR de 0.45 (CI 0.22-0.94, p 0.031) para el heterocigoto C/G del marcador rs638405 en el gen BACE1. El análisis de haplotipos permite determinar que para el gen APOE (haplotipo formado por los marcadores rs405509, rs429358 y rs7412) el ATC presenta un OR de 0.48 (CI 0.28-0.83) y el ACC presenta un OR de 5.5 (CI 2.57-11.87), eventos que deben ser confirmados en una muestra con mayor poder.

Abstract. This is a feasibility preliminar study on sporadic patients with Alzheimer disease and healthy controls from Antioquia. They were genotypified, between 2011 and 2013, for 10 SNPs in the ADAM10, BACE1, NCSTN and APOE genes. Based upon functional hypothesis, i.e. that variation in genes that process and clean Amyloid Precursor Protein (APP) could be related to susceptibility to AD, we obtain allelic and genotypic frequencies and OR for each one. This analysis produces an OR of 2.09 (CI 1.20-3.62, p 0.0083) for rs514049 (C allele) from ADAM10, OR of 6.29 (CI 3.09-12.82, p 4.4x10-5) for rs429358 (C allele) from APOE, an OR of 0.45 (CI 0.22-0.94, p 0.031) for rs638405 (C/G) from BACE1. Two haplotypes (ATC and ACC) from rs405509, rs429358 and rs7412 polymorphisms at APOE have an OR of 0.48 (CI 0.28-0.83) (ATC) and an OR of 5.5 (CI 2.57-11.87) (ACC). However this results should be studied in a bigger sample with power enough to produce conclusive results.