Estudio y análisis de un modelo determinístico SIQR para la transmisión del cólera

dc.contributor.advisorBlanco-Castañeda, Liliana
dc.contributor.authorCórdoba Rodríguez, Camila Alejandra
dc.date.accessioned2023-08-03T15:06:46Z
dc.date.available2023-08-03T15:06:46Z
dc.date.issued2023
dc.descriptiongraficas, tablasspa
dc.description.abstractLa pandemia de Covid-19 es reflejo de las consecuencias de las enfermedades infecciosas. Parte de la respuesta ante tales riesgos para la salud pública, incluye la posibilidad de entender y predecir la dinámica de los contagios y, a partir de ello, tomar decisiones oportunas. Es aquí donde las matemáticas aplicadas a la epidemiología destacan como una herramienta fundamental. Una forma de entender la evolución de una epidemia es mediante la aplicación de modelos compartimentales, ajustados a las características propias de cada enfermedad. Estos agrupan a la población en varios compartimientos, dependiendo de su condición médica. Modelos epidemiológicos como el SIQR pueden ser adaptados para predecir el comportamiento de enfermedades como el cólera, que, como lo evidencian los acontecimientos más recientes vividos en Siria y Haití, pueden llegar rápidamente a pasar de un brote a una epidemia difícil de controlar, si no se toman las medidas de control adecuadas. En vista de lo anterior, este trabajo estudia y analiza un modelo determinístico SIQR para la transmisión del cólera. Además, se realiza simulación numérica usando el lenguaje de programación Python, que permita observar la dinámica de la enfermedad desde la evolución de los diferentes grupos poblacionales en el tiempo. Se realiza el análisis de sensibilidad al número reproductivo básico, el cual permite evaluar estrategias de control. También se diseña una interfaz web, utilizando la librería Streamlit, que permite evidenciar la respuesta de la dinámica del modelo, en función de los parámetros. Esta sirve como insumo para estudios posteriores. el análisis de sensibilidad al número reproductivo básico (Texto tomado de la fuente)spa
dc.description.abstractThe Covid-19 pandemic is a reflection of the consequences that infectious diseases can generate. Part of the response to these risks for public health includes the possibility of understanding and predicting the dynamics of infections and, on this basis, taking opportune decisions. Here is where mathematics applied to epidemiology stands out as a fundamental tool. One way of understanding the evolution of an epidemic is through the application of compartmental models, adjusted to the specific characteristics of each disease. These divide the population into various compartments, depending on their medical condition. Epidemiological models like SIQR can be adapted to predict the behavior of diseases as cholera, that, as evidenced by the most recent events in Syria and Haiti, can quickly progress from an outbreak to an epidemic difficult to control, if adequate control measures are not taken. In consideration of the above, this work studies and analyzes a deterministic SIQR model for cholera transmission. In addition, numerical simulation using Python programming language is performed to observe the dynamics of the disease from the evolution of different population groups over time. Sensitivity analysis to the basic reproductive number is developed, which allows the evaluation of control strategies. A web interface is also designed, using Streamlit library, which allows to evidence the response of the dynamics of the model, depending on the parameters. This will serve as an instrument for further studies.eng
dc.description.curricularareaMatemáticas Y Estadística.Sede Manizalesspa
dc.description.degreelevelMaestríaspa
dc.description.degreenameMagíster en Ciencias - Matemática Aplicadaspa
dc.format.extent85 páginasspa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.instnameUniversidad Nacional de Colombiaspa
dc.identifier.reponameRepositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiaspa
dc.identifier.repourlhttps://repositorio.unal.edu.co/spa
dc.identifier.urihttps://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/84432
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad Nacional de Colombiaspa
dc.publisher.branchUniversidad Nacional de Colombia - Sede Manizalesspa
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Exactas y Naturalesspa
dc.publisher.placeManizales, Colombiaspa
dc.publisher.programManizales - Ciencias Exactas y Naturales - Maestría en Ciencias - Matemática Aplicadaspa
dc.relation.referencesCristhian Eduardo Hernández Flórez y Flór de María Cáceres Manrique. “Cólera, ¿se aproxima una nueva pandemia?” En: Medicas UIS 27 (ene. de 2014), págs. 67-83. issn: 0121-0319. url: http : / / www . scielo . org . co / scielo . php ? script = sci _ arttext&pid=S0121-03192014000200008&nrm=iso.spa
dc.relation.referencesSergio López-Moreno, Francisco Garrido-Latorre y Mauricio Hernández- Avila. “Desarrollo histórico de la epidemiología: su formación como disciplina científica”. En: Salud Pública de México 42 (2 mar. de 2000), págs. 133-143. url: https://www.saludpublica. mx/index.php/spm/article/view/6221.spa
dc.relation.referencesPablo Amster. “La Matemática de las Epidemias”. En: Revista de Educación Matemática 35 (2 jul. de 2020), págs. 5-20. url: https://revistas.unc.edu.ar/index.php/REM/article/ view/29726.spa
dc.relation.referencesDaniel Bernoulli. “Essai d’une nouvelle analyse de la mortalitée causée par la petite vérole et des avantages de l’inoculation pour la prévenir”. En: Mém. Math. Phys. Acad. Roy.Sci. Paris (1766). url: https://gallica.bnf.fr/ark:/%2012148/bpt6k3558n/ f220.image.r=daniel%20bernoulli.spa
dc.relation.referencesWilliam Ogilvy Kermack y A. G. McKendrick. “A contribution to the mathematical theory of epidemics”. En: Proceedings of the Royal Society of London. Series A, Containing Papers of a Mathematical and Physical Character 115 (772 ago. de 1927), págs. 700-721. issn: 0950-1207. doi: 10.1098/rspa.1927.0118.spa
dc.relation.referencesFred Brauer, Pauline van den Driessche y Jianhong Wu, eds. Mathematical Epidemiology. Vol. 1945. Springer Berlin Heidelberg, 2008. isbn: 978-3-540-78910-9. doi: 10.1007/978-3-540- 78911-6.spa
dc.relation.referencesMaia Martcheva. An Introduction to Mathematical Epidemiology. Vol. 61. Springer US, 2015. isbn: 978-1-4899-7611-6. doi: 10. 1007/978-1-4899-7612-3.spa
dc.relation.referencesGabriel García-Márquez. El amor en los tiempos del cólera. 1.a ed. Grupo Editorial Norma, 1985, págs. 1-409.spa
dc.relation.referencesDavid Vásquez Awad, Luis María Murillo y Antonio Iglesias Gamarra. “HISTORIA DE PLAGAS Y PANDEMIAS”. En: EL CÓ- LERA 42 ((2) 226-239 jul. de 2020), págs. 226-239. url: https: //revistamedicina.net/ojsanm/index.php/Medicina/article/ view/1517.spa
dc.relation.referencesACAPS. SYRIA Cholera outbreak in the northeastern regions. Sep. de 2022.spa
dc.relation.referencesActualización epidemiológica Resurgimiento de cólera en Haití. Organización Panamericana de la Salud (OPS), oct. de 2022. url: https : / / www . paho . org / es / documentos / actualizacion - epidemiologica-resurgimiento-colera-haiti-14-octubre- 2022.spa
dc.relation.referencesH. O. Nyaberi y D. M. Malonza. “Mathematical Model of Cholera Transmission with Education Campaign and Treatment Through Quarantine”. En: Journal of Advances in Mathematics and Computer Science (mayo de 2019), págs. 1-12. issn: 2456-9968. doi: 10.9734/jamcs/2019/v32i330145.spa
dc.relation.referencesSandro Azaele et al. “Stochastic dynamics of cholera epidemics”. En: Physical Review E 81 (5 mayo de 2010), pág. 051901. issn: 1539-3755. doi: 10.1103/PhysRevE.81.051901.spa
dc.relation.referencesJ. GANI y R. J. SWIFT. “Deterministic and Stochastic Models for the Spread of Cholera”. En: The ANZIAM Journal 51 (2 oct. de 2009), págs. 234-240. issn: 1446-1811. doi: 10 . 1017 / S1446181110000027.spa
dc.relation.referencesChayu Yang. “Mathematical Modeling, Analysis, and Simulation of Cholera Dynamics”. The University of Tennessee at Chattanooga, ago. de 2020.spa
dc.relation.referencesBogale Assefa Belayneh y Purnachandra Rao Koya. “A Mathematical Model Analysis for the Transmission Dynamics of Cholera with Control Strategy”. En: Mathematical Modelling and Applications 6 (3 2021), pág. 56. issn: 2575-1786. doi: 10.11648/j. mma.20210603.11.spa
dc.relation.referencesFlavio Finger et al. “The potential impact of case-area targeted interventions in response to cholera outbreaks: A modeling study”. En: PLOS Medicine 15 (2 feb. de 2018), e1002509. issn: 1549-1676. doi: 10.1371/journal.pmed.1002509.spa
dc.relation.referencesLauren D’Mello-Guyett et al. “Prevention and control of cholera with household and community water, sanitation and hygiene (WASH) interventions: A scoping review of current international guidelines”. En: PLOS ONE 15 (1 ene. de 2020), e0226549-. url: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0226549.spa
dc.relation.referencesK.F. Gurski. “A sexually transmitted infection model with longterm partnerships in homogeneous and heterogenous populations”. En: Infectious Disease Modelling 4 (2019), págs. 142-160. issn: 24680427. doi: 10.1016/j.idm.2019.05.002.spa
dc.relation.referencesHisashi Inaba e Hisashi Sekine. “A mathematical model for Chagas disease with infection-age-dependent infectivity”. En: Mathematical Biosciences 190 (1 jul. de 2004), págs. 39-69. issn: 00255564. doi: 10.1016/j.mbs.2004.02.004.spa
dc.relation.referencesAna Lajmanovich y James A. Yorke. “A deterministic model for gonorrhea in a nonhomogeneous population”. En: Mathematical Biosciences 28 (3-4 ene. de 1976), págs. 221-236. issn: 00255564. doi: 10.1016/0025-5564(76)90125-5.spa
dc.relation.referencesChristian L. Althaus et al. “Transmission dynamics of Chlamydia trachomatis affect the impact of screening programmes”. En: Epidemics 2 (3 sep. de 2010), págs. 123-131. issn: 17554365. doi: 10.1016/j.epidem.2010.04.002.spa
dc.relation.referencesQurrota A’yuni Ar Ruhimat1 e Imam Solekhudin2. “An Epidemic Model of Varicella with Vaccination”. En: ed. por Fuad Bahrul Ulum et al. University of Jember, sep. de 2016, págs. 351-355.spa
dc.relation.referencesFred Brauer, Carlos Castillo-Chavez y Zhilan Feng. Mathematical Models in Epidemiology. Vol. 69. Springer New York, 2019. isbn: 978-1-4939-9826-5. doi: 10.1007/978-1-4939-9828-9.spa
dc.relation.referencesPratchaya Chanprasopchai, I. Ming Tang y Puntani Pongsumpun. “SIR Model for Dengue Disease with Effect of Dengue Vaccination”. En: Computational and Mathematical Methods in Medicine 2018 (ago. de 2018), págs. 1-14. issn: 1748-670X. doi: 10.1155/2018/9861572.spa
dc.relation.referencesIsack E. Kibona y Cuihong Yang. “SIR Model of Spread of Zika Virus Infections: ZIKV Linked to Microcephaly Simulations”. En: Health 09 (08 2017), págs. 1190-1210. issn: 1949-4998. doi: 10. 4236/health.2017.98086.spa
dc.relation.referencesHerbert Hethcote, Ma Zhien y Liao Shengbing. “Effects of quarantine in six endemic models for infectious diseases”. En: Mathematical Biosciences 180 (1-2 nov. de 2002), págs. 141-160. issn: 00255564. doi: 10.1016/S0025-5564(02)00111-6.spa
dc.relation.referencesCarlos [et.al] Castillo Chavez. Modelos de la propagación de enfermedades infecciosas. 2015.a ed. Universidad Autonoma de Occidente, 2015, págs. 7-12.spa
dc.relation.referencesTakashi Odagaki. “Analysis of the outbreak of COVID-19 in Japan by SIQR model”. En: Infectious Disease Modelling 5 (2020), págs. 691-698. issn: 24680427. doi: 10.1016/j.idm.2020.08. 013.spa
dc.relation.referencesHongfan Lu et al. “Mathematical modeling and dynamic analysis of SIQR model with delay for pandemic COVID-19”. En: Mathematical Biosciences and Engineering 18 (4 2021), págs. 3197-3214. issn: 1551-0018. doi: 10.3934/mbe.2021159.spa
dc.relation.referencesCarla M. A. Pinto, J. A. Tenreiro Machado y Clara Burgos- Simón. “Modified SIQR model for the COVID-19 outbreak in several countries”. En: Mathematical Methods in the Applied Sciences (ene. de 2022). issn: 0170-4214. doi: 10.1002/mma.8082.spa
dc.relation.referencesSubrata Paul et al. “Dynamics of SIQR epidemic model with fractional order derivative”. En: Partial Differential Equations in Applied Mathematics 5 (jun. de 2022), pág. 100216. issn: 26668181. doi: 10.1016/j.padiff.2021.100216.spa
dc.relation.referencesNicolas Bacaër. A Short History of Mathematical Population Dynamics. Springer London, 2011. isbn: 978-0-85729-114-1. doi: 10.1007/978-0-85729-115-8.spa
dc.relation.referencesGeorge Macdonald. The Epidemiology and Control of Malaria. Oxford University Press, 1957.spa
dc.relation.referencesFred Brauer. “Mathematical epidemiology: Past, present, and future”. En: Infectious Disease Modelling 2 (2 mayo de 2017), págs. 113-127. issn: 24680427. doi: 10.1016/j.idm.2017.02. 001.spa
dc.relation.referencesAntoine Perasso. “An Introduction to The Basic Reproduction Number in Mathematical Epidemiology”. En: ESAIM: Proceedings and Surveys 62 (oct. de 2018), págs. 123-138. issn: 2267- 3059. doi: 10.1051/proc/201862123.spa
dc.relation.referencesO. Diekmann y J.A.P. Heesterbeek. Mathematical Epidemiology of Infectious Diseases: Model Building, Analysis and Interpretation. Vol. 5. John Wile, 2000.spa
dc.relation.referencesO. Diekmann, J.A.P. Heesterbeek y J.A.J. Metz. “On the definition and the computation of the basic reproduction ratio R 0 in models for infectious diseases in heterogeneous populations”. En: Journal of Mathematical Biology 28 (4 jun. de 1990). issn: 0303-6812. doi: 10.1007/BF00178324.spa
dc.relation.referencesP. Van den Driessche y James Watmough. “Reproduction numbers and sub-threshold endemic equilibria for compartmental models of disease transmission”. En: Mathematical Biosciences 180 (1-2 nov. de 2002), págs. 29-48. issn: 00255564. doi: 10.1016/ S0025-5564(02)00108-6.spa
dc.relation.referencesMorris W Hirsch, Robert L Devaney y Stephen Smale. Differential Equations, Dynamical Systems, and an Introduction to Chaos. Elsevier, 2013. isbn: 9780123820105. doi: 10.1016/C2009- 0-61160-0.spa
dc.relation.referencesLawrence Perko. Differential equations and dynamical systems. Ed. por J.E. Marsden, L. Sirovich y M. Golubitsky. 3a. Springer, 2000.spa
dc.relation.referencesShah M. Faruque, M. John Albert y John J. Mekalanos. “Epidemiology, Genetics, and Ecology of Toxigenic <i>Vibrio cholerae</ i>”. En: Microbiology and Molecular Biology Reviews 62 (4 dic. de 1998), págs. 1301-1314. issn: 1092-2172. doi: 10.1128/ MMBR.62.4.1301-1314.1998.spa
dc.relation.referencesRonnie G. Gavilán y Jaime Martínez-Urtaza. “Factores ambientales vinculados con la aparición y dispersión de las epidemias de Vibrio en América del Sur”. En: Revista Peruana de Medicina Experimental y Salud Publica 28 (1 2011), págs. 109-115.spa
dc.relation.referencesJosé A López-Portolés et al. “Identificación de una cepa de Vibrio cholerae O1como responsable de casos de enfermedad diarréica aguda de sucesivos brotes de cólera en Guinea Ecuatorial”. En: Enfermedades emergentes 9 (3 2007), págs. 125-129.spa
dc.relation.referencesLoune Viaud et al. A Cholera Outbreak in a Haitian Prison Threatens to Kill Hundreds Within Days. Oct. de 2022. url: https://www.thenation.com/article/world/haiti-prisoncholera- outbreak/.spa
dc.relation.referencesActualización epidemiológica - Cólera. Organización Panamericana de la Salud, dic. de 2022. url: https://www.paho.org/ es/documentos/actualizacion-epidemiologica-colera-13- diciembre-2022.spa
dc.relation.referencesFernando Serpa Flórez. “Historia del cólera en Colombia”. En: Biomédica 12 (3-4 dic. de 1992), pág. 95. issn: 0120-4157. doi: 10.7705/biomedica.v12i3-4.2031.spa
dc.relation.referencesFabio Rivas Muñoz. “Cólera en Colombia. Descripción de algunos aspectos epidemiológicos a un año de diagnosticado el primer caso”. En: Biomédica 12 (3-4 dic. de 1992), pág. 109. issn: 0120- 4157. doi: 10.7705/biomedica.v12i3-4.2033.spa
dc.relation.referencesCarlos Castillo-Chavez, Zhilan Feng y Wenzhang Huang. On the Computation of R 0 and its Role on Global Stability. 2002. doi: 10.1007/978-1-4757-3667-0_13.spa
dc.relation.referencesPauli Virtanen et al. “SciPy 1.0: Fundamental Algorithms for Scientific Computing in Python”. En: Nature Methods 17 (2020), págs. 261-272. doi: 10.1038/s41592-019-0686-2.spa
dc.relation.referencesDANE. Estadísticas Vitales. Oct. de 2022. url: https://www. dane.gov.co/index.php/estadisticas-por-tema/demografiay- poblacion/nacimientos-y-defunciones.spa
dc.relation.referencesH. O. Nyaberi y D. M. Malonza. “Mathematical Model of Cholera Transmission with Education Campaign and Treatment Through Quarantine”. En: Journal of Advances in Mathematics and Computer Science (mayo de 2019), págs. 1-12. issn: 2456-9968. doi: 10.9734/jamcs/2019/v32i330145.spa
dc.relation.referencesCláudia Torres Codeço. “Endemic and epidemic dynamics of cholera: the role of the aquatic reservoir”. En: BMC Infectious Diseases 1 (1 dic. de 2001), pág. 1. issn: 1471-2334. doi: 10.1186/ 1471-2334-1-1.spa
dc.relation.referencesL. Mari et al. “Modelling cholera epidemics: the role of waterways, human mobility and sanitation”. En: Journal of The Royal Society Interface 9 (67 feb. de 2012), págs. 376-388. issn: 1742- 5689. doi: 10.1098/rsif.2011.0304.spa
dc.relation.referencesJin Wang y Chairat Modnak. “MODELING CHOLERA DYNAMICS WITH CONTROLS”. En: CANADIAN APPLIED MATHEMATICS QUARTERLY 19 (3 2011), págs. 255-273.spa
dc.relation.referencesY.M. Rangkuti, Firmansyah y A. Landong. “Sensitivity analysis of SEIR epidemic model of Covid 19 spread in Indonesia”. En: Journal of Physics: Conference Series 2193 (1 feb. de 2022), pág. 012092. issn: 1742-6588. doi: 10.1088/1742-6596/2193/ 1/012092.spa
dc.relation.referencesSümeyye ÇAKAN. “Local Asymptotic Stability and Sensitivity Analysis of a New Mathematical Epidemic Model Without Immunity”. En: Mathematical Sciences and Applications E-Notes (mar. de 2022), págs. 50-62. issn: 2147-6268. doi: 10.36753/ mathenot.935016.spa
dc.relation.referencesXia Yang, Lansun Chen y Jufang Chen. “Permanence and positive periodic solution for the single-species nonautonomous delay diffusive models”. En: Computers Mathematics with Applications 32 (4 ago. de 1996), págs. 109-116. issn: 08981221. doi: 10.1016/0898-1221(96)00129-0.spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.licenseReconocimiento 4.0 Internacionalspa
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/spa
dc.subject.ddc510 - Matemáticas::519 - Probabilidades y matemáticas aplicadasspa
dc.subject.proposalModelo epidemiológico compartimentalspa
dc.subject.proposalCóleraspa
dc.subject.proposalModelo SIQRspa
dc.subject.proposalSimulación numéricaspa
dc.subject.proposalCompartmental epidemic modeleng
dc.subject.proposalCholeraeng
dc.subject.proposalSIQR modeleng
dc.subject.proposalNumerical simulationeng
dc.titleEstudio y análisis de un modelo determinístico SIQR para la transmisión del cóleraspa
dc.title.translatedStudy and analysis of a deteriministic model SIQR for the transmission of choleraeng
dc.typeTrabajo de grado - Maestríaspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccspa
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaspa
dc.type.contentImagespa
dc.type.contentTextspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/masterThesisspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionspa
dcterms.audience.professionaldevelopmentEstudiantesspa
dcterms.audience.professionaldevelopmentInvestigadoresspa
dcterms.audience.professionaldevelopmentMaestrosspa
dcterms.audience.professionaldevelopmentPúblico generalspa
dcterms.audience.professionaldevelopmentResponsables políticosspa
oaire.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa

Archivos

Bloque original

Mostrando 1 - 1 de 1
Cargando...
Miniatura
Nombre:
1053838790.2023.pdf
Tamaño:
1.69 MB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descripción:
Tesis de Maestría en Ciencias - Matemática Aplicada

Bloque de licencias

Mostrando 1 - 1 de 1
No hay miniatura disponible
Nombre:
license.txt
Tamaño:
5.74 KB
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descripción: