Comparación morfo-agronómica y molecular de catorce variedades de arroz (Oryza sativa L.) y de las líneas que dieron su origen

Abstract

Con el objetivo de determinar las diferencias morfo-agronómicas y establecer la diversidad genética entre 14 variedades de arroz y sus respectivas líneas de origen, se hizo un estudio en condiciones de campo, y posteriormente un análisis molecular en el Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT). El diseño de campo fue el de alfa látice con 28 tratamientos, 25 variables, tres repeticiones y dos siembras en el tiempo. El análisis molecular se hizo mediante un arreglo de 96 marcadores SNP de alta discriminación para arroces tipo indica. El análisis estadístico de los datos de campo se hizo combinando las dos siembras porque no hubo diferencias estadísticas entre ellas. Además, se analizaron en conjunto los datos moleculares con los morfo-agronómicos por medio del índice de Gower para capturar mejor la variabilidad. Todos los análisis se hicieron mediante el programa estadístico SAS. Los resultados mostraron que de las 14 variedades solo ocho coincidieron con su línea origen, hubo una variedad que coincidió con la línea hermana de su ancestro. Los resultados fueron consistentes cuando el análisis de datos se hizo independientemente o combinado

//Abstract: In order to determine morpho-agronomic differences and establish genetic diversity among 14 rice varieties and their respective lines of origin, a study was made under field conditions, and later a molecular analysis at the International Center for Tropical Agriculture (CIAT). The field design was the alpha lattice with 28 treatments, 25 variables, three repetitions and two sowings in time. Molecular analysis was done through an array of 96 high-discrimination SNP markers for Indica-type rices. The statistical analysis of the field data was done by combining the two sowings because, there were no statistical differences between them. Moreover, the molecular data were analyzed together with the morpho-agronomic data by means of the Gower index to have a better capture the variability. All analyzes were made using the SAS statistical program. The results showed that out of the 14 varieties only eight coincided with their origin line, there was a variety that coincided with the sister line of its ancestor. The results were consistent when the data analysis was done independently or combined