Evaluación de la expresión del proteoma intracelular de una cepa nativa colombiana de Clostridium sp. en condiciones de producción de 1,3-propanodiol

Abstract

En este trabajo se evaluó la expresión de las proteínas intracelulares, en la cepa nativa Clostridium sp. IBUN 158 B y en la cepa Clostridium butyricum DSM 2478, en dos fases del crecimiento bacteriano y en condiciones de producción de 1,3- propanodiol (1,3-PD), mediante análisis proteómicos por electroforesis bidimensional y espectrometría de masas. Los análisis efectuados permitieron encontrar diferencias en la expresión de proteínas entre las fases y cepas evaluadas. De los spots diferencialmente expresados, diez fueron identificados a través de análisis por espectrometría de masas en tandem, utilizando el método de mapeo peptídico. Se identificaron las enzimas: aspartatosemialdehído deshidrogenasa, aconiato hidratasa, glutamina sintetasa, triosafosfato isomerasa, inosin5’-monofosfato deshidrogenasa, las proteínas ribosomales S2 y L10 y las enzimas: 1,3- propanodiol deshidrogenasa y 3- hidroxibutiril- coA- deshidrogenasa implicadas en la ruta metabólica de producción de 1,3-PD. / Abstract. In this study was determine the expression of intracellular proteins in the native strain Clostridium sp. IBUN 158 B and in the strain Clostridium butyricum DSM 2478, in two phases of bacterial growth, in production conditions of 1,3-Propanediol (1,3-PD). Proteoma expression was analyzed by two-dimensional electrophoresis and mass spectrometry. Differences were found in the proteome expression between strains and phases. 10 spots differentially expressed in stages were identified with analysis in tandem mass spectrometry by the peptide mapping method. This results recorded the presence of enzymes: aspartate semialdehyde dehydrogenase, aconitate hydratase, glutamine synthetase, triosephosphate isomerase, inosine 5'-monophosphate dehydrogenase, ribosomal proteins S2 and L10, and the enzymes: 1,3-propanediol dehydrogenase and 3– hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase, involved in the production of the solvent of interest (1,3-PD).