PCR múltiple para neumonía en pacientes hospitalizados en el Instituto Nacional de Cancerología durante el periodo 2023 - 2024, caracterización epidemiológica, clínica y microbiológica

Abstract

Introducción La neumonía es la principal causa de sepsis, muerte por infección e ingreso a cuidado crítico, el paciente oncológico representa mayor riesgo. La identificación microbiológica es un reto, pero técnicas genómicas recientes de PCR son altamente sensibles y específicas. Se describe frecuencia y perfil de resistencia por PCR, y otras variables en neumonía de paciente oncológico. Materiales y Métodos Estudio observacional descriptivo retrospectivo, pacientes oncológicos adultos hospitalizados por neumonía. Periodo: Enero 2023 a Marzo 2024, prueba PCR positiva. Resultados PCR positiva y neumonía: 87 casos (83 pacientes), Hombres 55%. Klebsiella pneumoniae 37%, Enterobacter cloacae 21%, Staphylococcus aureus 20%, Echerichia coli 15%, Pseudomonas aeruginosa 10% Resistencia bacteriana 40,2%: KPC 29%, NDM 21%, mecA/C 9%. Neumonía asociada a la atención en salud: 94,3% Neoplasias hematológicas 55%, Gastrointestinales 12%, mama 6%, pulmón 5% Antibiótico inicial: Piperacilina/Tazobactam 37%, Vancomicina 34%, Cefepime 26%, Meropenem 26% Final: Meropenem 47%, Vancomicina 23%, Ceftazidima/Avibactam 12%, Piperacilina/Tazobactam 9% Falla ventilatoria 57,5%, Choque séptico 51,7%, Mortalidad hospitalaria 44% Mortalidad, análisis exploratorio bivariado: Klebsiella pneumoniae OR 2,558 (IC 1,046 a 6,254) p 0,04, KPC OR 3 (IC 1,15 a 8) p 0,025, Estancia en UCI OR 45,8 (IC 5,8 a 342) p< 0,001, Neoplasia No Hematológica OR 4 (IC 1,6 a 10) p 0,003 Análisis multivariado asociación significativa con mortalidad únicamente para falla ventilatoria Conclusiones Klebsiella pneumoniae y otras enterobacterias resistentes fueron las más frecuentes por PCR, utilizada en casos severos. Se sugiere su uso temprano, optimización de antibióticos, prevención de infecciones asociadas a la atención en salud. Se requieren estudios de mayor nivel para evaluar las hipótesis (Texto tomado de la fuente).

Introduction Pneumonia is the leading cause of sepsis, infection-related mortality, and admission to critical care. Oncology patients are at higher risk. Microbiological identification remains a challenge; however, recent genomic PCR techniques are highly sensitive and specific. This study describes the frequency and resistance profile identified by PCR, along with other variables in pneumonia among oncology patients. Materials and Methods A retrospective, descriptive, observational study was conducted in hospitalized adult oncology patients diagnosed with pneumonia. Study period: January 2023 to March 2024. Inclusion criterion: positive PCR test. Results A total of 87 pneumonia cases (83 patients) with positive PCR results were analyzed; 55% were male. Pathogen distribution: Klebsiella pneumoniae (37%), Enterobacter cloacae (21%), Staphylococcus aureus (20%), Escherichia coli (15%), Pseudomonas aeruginosa (10%). Bacterial resistance (40.2%): KPC (29%), NDM (21%), mecA/C (9%). Healthcare-associated pneumonia: 94.3%. Primary malignancies: Hematological (55%), gastrointestinal (12%), breast (6%), lung (5%). Initial antibiotic therapy: Piperacillin/Tazobactam (37%), Vancomycin (34%), Cefepime (26%), Meropenem (26%). Final antibiotic therapy: Meropenem (47%), Vancomycin (23%), Ceftazidime/Avibactam (12%), Piperacillin/Tazobactam (9%) Clinical outcomes: Respiratory failure (57.5%), septic shock (51.7%), in-hospital mortality (44%). Exploratory bivariate analysis (mortality predictors): Klebsiella pneumoniae: OR 2.558 (95% CI: 1.046–6.254), p = 0.04 KPC resistance: OR 3 (95% CI: 1.15–8), p = 0.025 ICU stay: OR 45.8 (95% CI: 5.8–342), p < 0.001 Non-hematological malignancy: OR 4 (95% CI: 1.6–10), p = 0.003 Multivariate analysis: Only respiratory failure showed a significant association with mortality. Conclusions Klebsiella pneumoniae and other resistant Enterobacteriaceae were the most frequently detected pathogens by PCR in severe cases. Early PCR use, antibiotic optimization, and healthcare-associated infection prevention strategies are recommended. Higher-level studies are needed to validate these findings.