Asociación de los alelos de HLA con la persistencia, depuración y reinfección de tipos de Virus del Papiloma Humano de alto riesgo

Abstract

Este trabajo tuvo como objetivo identificar los alelos y haplotipos HLA-DRB1 y DQB1 relacionados con la persistencia, depuración y redetección de 6 tipos de VPH de alto riesgo (VPH-AR) (-16, -18, -31, -33, -45 y -58) en una cohorte de mujeres colombianas. A partir de muestras de cérvix de 276 mujeres, se realizó la tipificación de los loci DRB1 y DQB1 mediante el sistema MiSeq-Illumina. Se estimó la probabilidad de depuración y redetección en función del tiempo para cada uno de los 6 tipos de VPH-AR, con el método de Kaplan Meier. Se ajustaron modelos de supervivencia para identificar los alelos y haplotipos relacionados con la depuración y redetección teniendo en cuenta otras covariables. Se encontraron, para DRB1, 47 asociaciones (20 alelos), para DQB1, 6 asociaciones (3 alelos) y para los haplotipos, 87 asociaciones (34 haplotipos) con la depuración/persistencia de VPH. Con respecto a la redetección, 45 asociaciones de alelos DRB1 (23 alelos), 6 asociaciones para DQB1 (3 alelos) y 64 asociaciones, de 36 haplotipos, fueron identificadas. Se encontraron asociaciones tanto a favor como en contra de los eventos analizados, siendo algunas consistentes entre los tipos de VPH infectantes y otras diferentes. El efecto de los alelos y haplotipos de HLA sobre el curso clínico de las infecciones de VPH (depuración, persistencia y redetección viral) es dependiente del tipo de VPH responsable de la infección. El efecto independiente de algunos alelos fue consistente al configurar los haplotipos, mientras que para otros se observó una modificación del efecto.

Abstract: The objective of this work was to identify HLA-DRB1 and DQB1 alleles and haplotypes related to the persistence, clearance and redetection of 6 high-risk HPV types (HR-HPV) (- 16, -18, -31, -33, - 45 and -58) in a cohort of Colombian women. From cervical samples of 276 women, DRB1 and DQB1 typing was performed using the MiSeq-Illumina system. The likelihood of clearance and redetection was estimated as a function of time for each of the 6 HR-HPV types with the Kaplan Meier method. Survival models were adjusted to identify alleles and haplotypes related to clearance and redetection, taking into account other covariates. We found, for DRB1, 47 associations (20 alleles), for DQB1, 6 associations (3 alleles) and for haplotypes, 87 associations (34 haplotypes) with clearance/persistence of HPV. With regard to redetection, 45 associations for DRB1 (23 alleles), 6 associations for DQB1 (3 alleles) and 64 associations for 36 haplotypes, were identified. Associations were found both in favor and against the events analyzed, with some being consistent between the infecting HPV types and others different. The effect of HLA alleles and haplotypes on the clinical course of HPV infections (clearance, persistence and viral redetection) is dependent on the HPV type responsible for the infection. The independent effect of some alleles was consistent when configuring the haplotypes, while for others a modification of the effect was observed.