Detección de Orthomyxovirus en quirópteros colombianos

Abstract

La gran relevancia ecológica y epidemiológica que poseen los quirópteros, en parte gracias a características funcionales que los hacen reservorios de multiplicidad de agentes virales, dentro de estos los recientemente reportados Orthomyxovirus de los subtipos H17N10 y H18N11 en las especies Sturnira lilium, Artibeus planirostris y Artibeus obscurus en el territorio nacional de Guatemala, Perú y Bolivia respectivamente. Teniendo en cuenta que a la fecha no se sabe a ciencia cierta el papel que puedan jugar estos individuos en la compleja dinámica viral y adicionalmente no se tiene conocimiento alguno de la presencia de Orthomyxovirus en murciélagos, por fuera de las localidades donde se reportaron por primera vez (Guatemala, Perú o Bolivia), es de vital importancia establecer su presencia en murciélagos neotropicales. Teniendo en cuenta lo anterior, esta investigación, busca determinar la presencia de Orthomyxovirus en quirópteros del territorio nacional colombiano mediante la implementación de diversos métodos moleculares, aportando así al conocimiento en un área en la cual existe una necesidad sentida de información, fundamental para la implementación de programas de conservación de especies silvestres y de impacto para la salud humana y animal. El estudio pretende igualmente evaluar diferentes tipos de muestras y comparar sistemas de preservación de las mismas, con el fin de crear un banco de muestras de quirópteros que permitirá llevar a cabo análisis posteriores de diferente índole, optimizando así el uso de los especímenes capturados en campo, aportando nueva información que permitirá evidenciar la importancia biótica y microbiológica de este particular orden de mamíferos. De otra parte, durante el desarrollo de esta investigación, se evaluaron y establecieron métodos de obtención y procesamiento de muestras para la detección molecular de agentes virales. Como resultado de lo anterior, mediante la implementación de pruebas de qRT-PCR y PCR de punto final con diferentes blancos génicos, se estableció por primera vez en el país la presencia de virus de influenza tipo A (IAV) en quirópteros, incluyendo su detección en 6 especies que a la fecha no han sido reportadas previamente como hospedadoras efectivas de IAV. Otro importante aporte del presente estudio es la detección molecular efectiva, igualmente por primera vez, de IAV en hisopados orofaríngeos de murciélagos. Así mismo, no se encontró evidencia de los subtipos influenza A-like en los murciélagos colombianos evaluados. . Este es el primer estudio realizado en el país, que se focaliza en la detección de agentes virales pertenecientes a la familia Orthomyxoviridae en poblaciones de murciélagos en el territorio colombiano, y los hallazgos encontrados abren la posibilidad de una distribución endémica de estos agentes virales en la ecozona neotropical. Palabras clave: Quirópteros neotrópicales, Orthomyxovirus, Influenzavirus tipo A, qRT-PCR, Citocromo B.

Resumo: Grande importância ecológica e epidemiológica possuindo chiroptera, em parte devido às características funcionais que fazem reservatórios multiplicidade de agentes virais dentro destes relatou recentemente Orthomyxovirus de H17N10 e H18N11 subtipos espécies Sturnira lilium, Artibeus planirostris e Artibeus obscurus no território nacional da Guatemala, Peru e Bolívia, respectivamente. Dado que a data não se sabe ao certo o papel que podem desempenhar esses caras na dinâmica virais complexas e além disso não tem qualquer conhecimento da presença de morcegos Orthomyxovirus, fora das cidades onde foram relatados primeiro Uma vez (Guatemala, Peru ou Bolívia), é vital estabelecer sua presença em morcegos neotropicais. Face ao exposto, esta investigação procura determinar a presença de Orthomyxovirus em quirópteros o território nacional colombiana através da implementação de vários métodos moleculares, contribuindo assim para o conhecimento em uma área em que há uma necessidade sentida de informação, essencial para a implementação de programas de conservação para espécies selvagens e impacto na saúde humana e animal. O estudo também tem como objectivo avaliar diferentes tipos de amostras e comparar sistemas de conservação-los a fim de criar um banco quirópteros amostra que vai realizar uma análise mais aprofundada de diversos tipos, optimizando a utilização de amostras tomadas a partir de campo , fornecendo novas informações que permitam demonstrar a importância biótica e microbiológica desta ordem particular de mamíferos. Por outro lado, durante o desenvolvimento desta pesquisa, métodos de obtenção e processamento de amostras para a detecção molecular de agentes virais foram avaliados e estabelecidos. Como resultado, através da implementação de testes de qRT-PCR e ponto final de PCR com alvos diferentes do gene, a presença de vírus de tipo A (IAV) quirópteros influenza foi estabelecido pela primeira vez no país, incluindo a sua detecção em 6 espécies que até o momento não foram relatadas anteriormente como hospedeiros eficazes de IAV. Outra importante contribuição do presente estudo é a detecção molecular efetiva, igualmente pela primeira vez, de IAV nos swabs orofaríngeos de morcegos. Da mesma forma, nenhuma evidência de subtipos semelhantes à gripe A foi encontrada nos morcegos colombianos avaliados. . Este é o primeiro estudo no país que incide sobre a detecção de agentes virais pertencentes à família Orthomyxoviridae em populações de morcegos em território colombiano, e os resultados abrem a possibilidade de uma distribuição endêmica desses agentes virais em Ecozona neotropical. Palavras-chave: Quiroptera neotropical, Orthomyxovirus, Influenzavírus tipo A, qRT-PCR, Citocromo B.

Abstract: The great ecological and epidemiological relevance of chiroptera, in part thanks to functional characteristics that make them reservoirs of multiple viral agents, within these the recently reported Orthomyxoviruses of the subtypes H17N10 and H18N11 in the species Sturnira lilium, Artibeus planirostris and Artibeus obscurus in the national territory of Guatemala, Peru and Bolivia respectively. Bearing in mind that to date, the role that these individuals can play in the complex viral dynamics is unknown and in addition there is no knowledge of the presence of Orthomyxovirus in bats, outside of the localities where they were reported for the first time Once (Guatemala, Peru or Bolivia), it is vital to establish its presence in Neotropical bats. Taking into account the above, this research seeks to determine the presence of Orthomyxovirus in chiroptera of the Colombian national territory through the implementation of various molecular methods, thus contributing to knowledge in an area in which there is a felt need for information, essential for implementation of conservation programs for wild species and impact on human and animal health. The study also aims to evaluate different types of samples and compare systems for their preservation, in order to create a bank of chiropter samples that will allow carrying out further analyzes of different kinds, thus optimizing the use of specimens captured in the field. , providing new information that will allow to demonstrate the biotic and microbiological importance of this particular order of mammals. On the other hand, during the development of this research, methods of obtaining and processing samples for the molecular detection of viral agents were evaluated and established. As a result of the above, through the implementation of qRT-PCR and end-point PCR tests with different gene targets, the presence of influenza A virus (IAV) in chiroptera was established for the first time in the country, including its detection. in 6 species that to date have not been previously reported as effective IAV hosts. Another important contribution of the present study is the effective molecular detection, equally for the first time, of IAV in the oropharyngeal swabs of bats. Likewise, no evidence of influenza A-like subtypes was found in the evaluated Colombian bats. . This is the first study conducted in the country, which focuses on the detection of viral agents belonging to the Orthomyxoviridae family in bat populations in the Colombian territory, and the findings found open the possibility of an endemic distribution of these viral agents in the Neotropical ecozone. Keywords: Neotropical bats, Orthomyxovirus, Influenzavirus type A, qRT-PCR, Cytochrome B.