Estudio de indels autosómicos de uso forense en una muestra de la población de la región del Pacífico colombiano

Abstract

El multiplex de marcadores genéticos de inserción/ deleción (Indels) se aprovecha como una herramienta complementaria a los STR para identificación humana. En el comercio el kit de la casa comercial Qiagen DIPplex® Investigator contiene un múltiplex de 30 Indels bialélicos autosómicos y el marcador de la Amelogenina, útiles para el desarrollo de la práctica forense. Se realizó un estudio genético con un total de 201 muestras de individuos no relacionados hombres y mujeres en cuatro departamentos de la población del Pacífico colombiano: Nariño (64 Individuos), Cauca (50 Individuos), Chocó (56 Individuos) y valle del Cauca (31 Individuos) utilizando el kit DIPplex®. No se encontraron desvíos del equilibrio de Hardy-Weinberg en la mayoría de Indels para las cuatro poblaciones. Las Probabilidades de Coincidencia (PC) estaban en los rangos (0.3354-0,5683) para Nariño, (0.3361-0.5740) para Cauca, (0.3466-0.4910) para Chocó y (0.3338-0.4828) para Valle del Cauca respectivamente, y el Poder de Exclusión (PE) fue 0.99. La PCR multiplex se optimizó para una solución a mitad de volumen final de 12,5 µl en muestras indubitadas, se obtuvieron perfiles completos en todos los casos con un rendimiento excelente. El kit DIPplex® se puso a prueba en muestras de tipo forense (Restos óseos) con fines de identificación de las cuales no se habían obtenido resultados concluyentes con STRs de rutina, obteniéndose 26 de los 30 Indels por tanto este estudio demuestra que el multiplex de Indel es un método eficaz para complementar los STR en casos de aplicación forense para la población de la región del Pacífico colombiano.

Abstract: The multiplex insertion / deletio n markers (Indels) is used as complementary tool to STRs for human identification. The kit Qiagen DIPplex® Investigato r cont ains a multiplex of 30 bialelic Indels autosomal and the marker of Amelogenin, is useful for the development of the forensic practice. A genetic study was carried out with 201 samples from unrelated men and women in four departments of the Colombian population of the Pacific: Nariño (64 individuals), Cauca (50 individuals), Chocó (56 individuals) and Valle del Cauca (31 Individuals) using the DIPplex® kit. No deviations from the Hardy - Weinberg equilibrium were found in most Indels for the four popul ations. The Probabilities of Coincidence (PC) were in the ranges (0.3354 - 0.5683) for Nariño, (0.3361 - 0.5740) for Cauca, (0.3466 - 0.4910) for Chocó and (0.3338 - 0.4828) for Valle del Cauca respectively, and the Power of Exclusion (PE) was 0.99. The PCR multi plex was optimized at half final volume 12.5 μ l in the samples, complete profiles were obtained in all cases with excellent performance. The DIPplex® kit was tested in forensic samples (bone remnants) for identification purposes for which conclusive resul ts were not obtained with routine STRs, ob taining 26 of the 30 Indels, this study shows the multiplex Indel is a effective method to complement STRs in cases of forensic application in the population o f the Colombian Pacific Region.