Análisis genómico de características de crecimiento muscular y de calidad de la canal en poblaciones ovinas de pelo

Abstract

Los ovinos de pelo colombiano son un recurso genético de gran importancia, que se encuentran adaptados a las diferentes condiciones medio ambientales del país; sin embargo, actualmente no se cuenta con la información suficiente acerca de sus parámetros productivos y sólidos estudios genómicos que permitan conocer a fondo las variedades raciales criollas existentes. Los estudios de asociación genómica (GWASs) son una herramienta que permite detectar genes que influyen en las características productivas. El objetivo de esta investigación fue identificar SNPs asociados a caracteres de crecimiento muscular y calidad de la canal, en ovinos de pelo colombiano, Etíope (OPCE), Sudán (OPCS) y criollo abosorbido por Pelibuey (OPCP), en los departamentos de Cesar, Córdoba y Valle del Cauca. Se evaluaron 167 animales a través de ocho caracteres para crecimiento y ocho para calidad de canal, con el fin de obtener información fenotípica contrarrestada con informacion genómica obtenida del microarreglo OvineSNP50 BeadChip de Illumina. El GWAS realizado para los caracteres de crecimiento y de calidad de canal, permitió inferir ocho genes candidatos (SLC44A3, PAM, CEP135, EMCN, PRDM13, BEND3, CHAMP1 y PIAS2), la funcionalidad de los genes involucrados se encontró relacionada con crecimiento celular, apoptosis y angiogénesis, principalmente. Además, la asociación permitió encontrar diferencias entre las variedades raciales, a pesar de que en el país los OPCE y los OPCS no se encuentran reconocidos como razas.

//Abstract: The Colombian hair sheep are a genetic resource of great importance, which are adapted to the different environmental conditions of the country; however, currently there is not enough information about their productive parameters and solid genomic studies that let to know in depth the existing creole racial varieties. The genomic association studies (GWAS) are a tool that permits the detection of genes that influence the productive characteristics. The objective of this research was to identify SNPs associated with muscle growth characteristics and carcass quality, in Colombian hair sheep, Etíope (OPCE), Sudán (OPCS) and hair creole absorbed by Pelibuey (OPCP), in the departments of Cesar, Córdoba and Valle del Cauca. 167 animals were evaluated through eight characters for growth and eight for carcass quality, in order to correlate phenotypic information with genomic information from the OvineSNP50 BeadChip microarray of Illumina. The GWAS carried out for the characters of growth and quality of carcass, allowed to infer eight candidate genes (SLC44A3, PAM, CEP135, EMCN, PRDM13, BEND3, CHAMP1 and PIAS2), the functionality of the genes involved was related to cell growth, apoptosis and angiogenesis, mainly. In addition, the association made it possible to find differences among racial varieties, although OPCE and OPCS are not recognized as breeds in the country.