Comparación de resultados por microscopía vs. qPCR y caracterización molecular de parásitos intestinales en menores de 15 años de una comunidad indígena del Amazonas (Colombia)

Abstract

Las infecciones por parásitos intestinales tienen amplia distribución y elevada frecuencia en algunas regiones afectando individuos de toda edad y género. En países en desarrollo, están relacionadas a factores económicos y sociales, condicionados por características geográficas y ecológicas; su incidencia en niños es común, debido a las diferencias en comportamientos y hábitos. Tanto protozoos como geohelmintos son frecuentes en diferente proporción en algunas poblaciones; personas que viven en áreas tropicales como el Amazonas (poblaciones indígenas) tienen regular calidad de vida, favoreciendo las infecciones de transmisión fecal-oral. El objetivo de este trabajo fue identificar la frecuencia de parásitos intestinales mediante PCR en tiempo real (qPCR), comparar los resultados obtenidos con q PCR, examen directo y Kato katz con el fin de conocer el porcentaje de positividad obtenido con cada técnica; y describir las subpoblaciones parasitarias presentes en cuatro comunidades indígenas del Amazonas. Se analizaron 261 muestras de niños menores de 15 años; se observó alta frecuencia de infección por qPCR de Blastocystis sp 89,7% (n=234), seguido por Giardia duodenalis 65,9% (n=172), Entamoeba histolytica 7,3% (n=19), los helmintos el más frecuente Ascaris lumbricoides 52,3% (n=138) y Trichuris trichiura 48,7% (n= 127), Ancylostoma duodenale 5% (n=13) y Necator americanus 51% (n=133). Para los genotipos, G. duodenalis con el marcador (gdh) se ecnontraron ensamblajes AI, BIII y BIV, con (tpi) ensambles AI, AII, BIII y BIV. Los subtipos (STs) de Blastocystis sp. fueron 1, 2, 3, 4 y 6; y finalmente, se identificaron para Cryptosporidium sp las especies C. viatorum, C. hominis y C. parvum. Se observó un alto perfil de transmisión zoonótica en relación con los ensamblajes de G. duodenalis y STs / alelos Blastocystis sp. También una elevada frecuencia de infección, lo que sugiere una transmisión activa en el área. Esto refuerza la necesidad de implementar mejores sistemas de vigilancia epidemiológica para patógenos entéricos, que aportan información para conocer el potencial zoonótico e identificar las comunidades en riesgo, con el fin de mejorar las medidas de control. Palabras clave: Parásitos, zoonosis, protozoos, helmintos, indígenas, epidemiología molecular.

Abstract. Intestinal parasite infections have wide distribution and high frequency in some regions affecting individuals of all ages and gender. In developing countries, they are related to economic and social factors, conditioned by geographical and ecological characteristics; Its incidence in children is common, due to differences in behaviors and habits. Both protozoa and geohelminths are frequent in different proportions in some populations; People living in tropical areas such as the Amazon (indigenous populations) have a regular quality of life, favoring fecal-oral transmission infections. The objective of this work was to identify the frequency of intestinal parasites by real-time PCR (qPCR), compare the results obtained with q PCR, direct examination and Kato katz in order to know the percentage of positivity obtained with each technique; And describe the parasitic subpopulations present in four indigenous communities of the Amazon. We analyzed 261 samples of children younger than 15 years; (N = 234), followed by Giardia duodenalis 65.9% (n = 172), Entamoeba histolytica 7.3% (n = 19), helminths More frequent Ascaris lumbricoides 52.3% (n = 138) and Trichuris trichiura 48.7% (n = 127), Ancylostoma duodenale 5% (n = 13) and Necator americanus 51% (n = 133). For the genotypes, G. duodenalis with the marker (gdh) AI, BIII and BIV assemblies were isolated with (tpi) assemblies AI, AII, BIII and BIV. The subtypes (STs) of Blastocystis sp. Were 1, 2, 3, 4 and 6; And finally, C. viatorum, C. hominis and C. parvum were identified for Cryptosporidium sp. A high zoonotic transmission profile was observed in relation to the assemblages of G. duodenalis and STs / alleles Blastocystis sp. Also a high frequency of infection, suggesting an active transmission in the area. This reinforces the need to implement better epidemiological surveillance systems for enteric pathogens, which provide information to know zoonotic potential and identify communities at risk, in order to improve control measures.