Estudio de la diversidad molecular de Fusarium oxysporum f. sp. cubense presente en Colombia

Abstract

Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), es el agente causal de la enfermedad conocida como Marchitamiento por Fusarium en cultivos de musáceas. Es una de las mayores limitantes en la producción mundial de banano y plátano. En Colombia, es escasa la información genética sobre el fitopatógeno y tras la problemática presentada en los años 50 que afecto la variedad de cultivar Gros Michel, este trabajo tuvo como objeto hacer una caracterización morfológica y genética de diversos aislamientos de Fusarium adquiridos a partir de un muestreo de cultivos de banano y plátano en 11 departamentos de Colombia. Para ello, se procesaron 121 muestras sintomáticas de las que se obtuvieron 89 aislamientos que conformaron un banco de cepas, que se caracterizó morfológica y genéticamente, amplificando y secuenciando los genes (Espaciador Transcripto Interno) ITS, (Factor de Elongación 1 α) EF 1α y (Segunda subunidad larga de la RNA polimerasa) RPB2. De estos aislamientos, 88 presentaron estructuras de reproducción y resistencia, típicas del género Fusarium y la identidad genética de las cepas, se corroboro mediante la amplificación de un fragmento específico de la región ITS, con los cebadores ITS FU para el género de interés y simultáneamente, 54 aislamientos se determinaron como Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc). Además, las amplificaciones de los marcadores moleculares confirmaron que los hongos estaban relacionados con el género y el complejo de especie Fusarium oxysporum (FOSC) e incluso se encontraron los complejos de especie Fusarium fujikuroi (FFSC), Fusarium solani (FSSC) y Fusarium incarnatum-equiseti (FIESC). En el estudio solo se alcanzó a diferenciar entre complejos de especies comúnmente hallados en los cultivos de musáceas, debido a que los cebadores no son lo suficientemente informativos para discernir entre las razas referidas para la forma especial cubense, pero si para rastrear la presencia de 6 haplotipos de Foc genéticamentente diferentes distribuidos en Colombia, los cuales deberán ser evaluados mediante infección en plantas para establecer su patogenicidad. (Texto tomado de la fuente)

Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), is the causal agent of the disease known as Fusarium wilt in musaceous crops. It is one of the major limiting factors in the world production of banana and plantain. In Colombia, genetic information on the phytopathogen is scarce and after the problem presented in the 1950s that affected the cultivar Gros Michel, this work was aimed at making a morphological and genetic characterization of various isolates of Fusarium acquired from a sampling of banana and plantain crops in 11 departments of Colombia. For this purpose, 121 symptomatic samples were processed from which 89 isolates were obtained to form a bank of strains, which were morphologically and genetically characterized, amplifying and sequencing the genes (Internal Transcribed Spacer Internal Transcript) ITS, (Elongation Factor 1 α) EF 1α and (Second long subunit of RNA polymerase) RPB2. Of these isolates, 88 showed breeding and resistance structures typical of the genus Fusarium and the genetic identity of the strains was corroborated by amplification of a specific fragment of the ITS region with the ITS FU primers for the genus of interest and simultaneously, 54 isolates were determined as Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc). In addition, amplifications of the molecular markers confirmed that the fungi were related to the genus and the esecie complex Fusarium oxysporum (FOSC) and even the species complexes Fusarium fujikuroi (FFSC), Fusarium solani (FSSC) and Fusarium incarnatum-equiseti (FIESC) were found. The study was only able to differentiate between species complexes commonly found in musacaea cultures, because the primers are not sufficiently informative to discern between the races referred to for the cubense special form, but to trace the presence of 6 genetically different Foc haplotypes distributed in Colombia, which should be evaluated by infection in plants to establish their pathogenicity.