Maestría en Ciencias - Biotecnología
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Item type: Ítem , Producción de bioetanol de segunda generación a partir de residuos de aserrío de madera de pino (Pinus patula)(Universidad Nacional de Colombia, 2026-10-01) Gómez Suta, Sandy Alejandra; Zapata Zapata, Arley David; Gómez Suta, Sandy Alejandra [0001633146]; Gómez Suta, Sandy Alejandra [0009000504162255]; Zapata Zapata, Arley David [000000026557772X]; Biotecnología IndustrialLos biocombustibles de segunda generación (2G) representan una alternativa sostenible frente a los combustibles fósiles asociados a emisiones de gases de efecto invernadero. Este estudio evaluó la producción de bioetanol 2G a partir de aserrín de Pinus patula, residuo forestal abundante en plantaciones de Angostura, Antioquia. Para la producción del bioetanol se siguieron tres etapas: (1) pretratamientos, (2) hidrólisis enzimática y (3) fermentación. Se aplicaron pretratamientos alcalinos (NaOH 1–5 %), hidrotérmicos (85–121 °C), enzimáticos con lacasa (0.144–0.178 mU) y combinados, evaluando la desnaturalización de lignina mediante el método CASA. El pretratamiento combinado NaOH 5 % + lacasa 0.144 mU obtuvo la mayor liberación de lignina (hasta 5.79 %), mientras que el tratamiento hidrotérmico a 121 °C permitió la mayor accesibilidad para la etapa de hidrólisis. En la hidrólisis enzimática con celulasa (15 FPU/g), el sustrato pretratado a 121 °C generó la mayor concentración de azúcares reductores (≈ 5.1 g/L en 96 h), seguido del tratamiento combinado alcalino–enzimático. En la fermentación con Saccharomyces cerevisiae, solo la fermentación clásica con hidrolizado al 100 % produjo etanol (≈0.5 g/L), indicando que se requiere una concentración inicial mínima de azúcares para obtener conversión fermentativa. En los procesos de sacarificación y fermentación simultanea (SSF) no se detectó etanol debido a la probable presencia de inhibidores y a la incompatibilidad entre condiciones óptimas de hidrólisis y fermentación. En conclusión, Pinus patula es una biomasa viable para producir bioetanol 2G, especialmente cuando se emplean pretratamientos combinados y condiciones térmicas moderadas altas. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Evaluación in silico de la interacción de la enzima Gamma-secretasa humana con sus sustratos, y su posible mecanismo de reconocimiento(Universidad Nacional de Colombia, 2026-09-28) Muñoz Perdomo, Javier Felipe; Arango Isaza, Rafael Eduardo; Soto Ospina, Alejandro; Muñoz Perdomo, Javier Felipe [0009000713466685]; Arango Isaza, Rafael Eduardo [0000000272766035]; Soto Ospina, Alejandro [0000000323827038]; Villegas Lanau Carlos Andrés; Biotecnología Vegetal Unalmed Cib; Grupo de Neurociencias de Antioquia; GIPDTALa enfermedad de Alzheimer (EA) es la enfermedad neurodegenerativa más prevalente y se asocia con la producción de péptidos amiloide-β (Aβ) por γ-secretasa (GS). Aunque su inhibición farmacológica ha fracasado por toxicidad derivada del procesamiento de múltiples sustratos, el mecanismo de reconocimiento por GS sigue sin esclarecerse. Este estudio caracterizó in silico los determinantes de reconocimiento de GS humana. Se compiló una lista actualizada de 167 sustratos y 22 no sustratos y se analizaron sus regiones transmembrana (TM) y yuxtamembrana (JM) mediante alineamientos múltiples, descubrimiento de motivos con MEME y modelos ocultos de Markov. En un subconjunto Gold-estándar validado experimentalmente, se compararon estructuras predichas con AlphaFold3 y se modelaron las interacciones GS-sustrato mediante dinámica molecular dirigida (SMD). Los análisis de secuencia convergieron en el límite TM-C/JMD-C como la región más discriminante, con enriquecimiento en Arg/Lys. Los sustratos presentaron mayor carga neta, punto isoeléctrico e índice de Boman, y una hidrofobicidad C-terminal más negativa que los no sustratos (p<0,005). La hidrofobicidad global, el momento hidrofóbico y la conformación tridimensional no discriminaron entre grupos. En SMD, ningún descriptor dinámico aislado fue discriminante; la discriminación emergió de la coincidencia entre un registro recíproco específico del esqueleto peptídico y una geometría compatible con catálisis, asociada a un acoplamiento persistente mediante cadena principal de Gln112 de PS1 y a flexibilidad TM. En conjunto, el reconocimiento de GS depende de características integradas de secuencia, estructura y dinámica, concentradas mayoritariamente en TM-C/JMD-C, constituyendo candidatos mecanísticos para diseñar moduladores selectivos y reducir la toxicidad de las terapias anti-EA. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Desarrollo de un prototipo funcional compuesto de microorganismos con capacidad biofertilizante con uso potencial en la producción sostenible de aguacate en el departamento del Tolima(Universidad Nacional de Colombia, 2025) Zapata Yepes, Valentina; Calle Henao, Cristina; Morales Osorio, Juan Gonzalo; Biotecnología Vegetal Unalmed CibEl cultivo de aguacate (Persea americana Mill.) es de gran importancia para Colombia; sin embargo, el incremento en la intensidad agrícola y el uso de insumos químicos plantea desafíos significativos para la sostenibilidad ambiental y productiva del sistema. En este contexto, los biofertilizantes microbianos emergen como una alternativa viable para mitigar dichos impactos y mejorar la productividad. En consecuencia, esta investigación se enfocó en el desarrollo y validación de un prototipo funcional de biofertilizante basado en la bacteria promotora del crecimiento vegetal (PGPR) Paenibacillus polymyxa RAB004, con el objetivo de contribuir a una producción más sostenible. El estudio se estructuró en fases de laboratorio y ensayos in vivo en plántulas de tomate y aguacate, bajo condiciones de casa-malla y vivero, respectivamente. Se evidenció la compatibilidad y el efecto sinérgico de P. polymyxa RAB004 en consorcio con Trichoderma virens y hongos micorrízicos arbusculares (HMA), lo cual promovió un crecimiento superior en comparación con las inoculaciones individuales. En la etapa de pre-formulación, la evaluación de diferentes matrices demostró que la combinación polimérica de CMC/PVA fue la más eficiente para mantener la viabilidad y pureza de la bacteria (∼1 × 10⁷ UFC/mL) durante al menos 6 meses a 25 °C. La pre-formulación líquida CMC/PVA de P. polymyxa RAB004 conservó las capacidades biofertilizantes del microorganismo (solubilización de fosfatos, fijación de nitrógeno, producción de fitohormonas, control de patógenos, etc.) y no presentó efectos fitotóxicos en las dosis evaluadas. Adicionalmente, se observaron incrementos de al menos 25 % en la biomasa aérea de plántulas de tomate en comparación con el control químico, lo que respalda su eficacia. Estos resultados demuestran que el prototipo desarrollado a partir del aislamiento P. polymyxa RAB004 constituye una alternativa biológica estable, funcional y segura, con potencial para reducir la dependencia de fertilizantes sintéticos. No obstante, su transferencia a la industria y adopción a nivel productivo requiere etapas adicionales de optimización, escalamiento y validación en condiciones de campo. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Desarrollo de una formulación a base de un hongo entomopatógeno para el control de ácaros de la familia Tetranychidae, plaga de importancia económica en cultivos agrícolas del departamento de Tolima(Universidad Nacional de Colombia, 2026-09-11) Gil Rodriguez, Vanessa Sirley; Bedoya Pérez, Juan Carlos; Durango Restrepo, Diego Luis; https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0002100022; Gil Rodriguez, Vanessa Sirley [0009000535866132]; Bedoya Pérez, Juan Carlos [0000000337769190}; Durango Restrepo, Diego Luis [0000000335751253]; Agrobiodiversidad y BiotecnologíaTetranychus urticae es una de las principales plagas agrícolas a nivel mundial debido a su alta tasa de reproducción, corto ciclo de vida y capacidad para desarrollar resistencia a los acaricidas químicos. Los hongos entomopatógenos ofrecen una alternativa sostenible para su manejo. El objetivo de este estudio fue seleccionar cepas fúngicas promisorias y desarrollar un bioproducto mediante fermentación sumergida, optimizando un medio de cultivo de bajo costo y evaluando formulaciones a base de aceite. Se evaluaron doce aislamientos de los géneros Akanthomyces, Beauveria, Metarhizium y Purpureocillium mediante bioensayos in vitro. Akanthomyces lecanii C-S1, Beauveria bassiana Hass 2.2, Metarhizium anisopliae UT y Purpureocillium sp. CSC4 presentaron las mayores tasas de mortalidad. Entre estas cepas, B. bassiana Hass 2.2 fue seleccionada para los análisis posteriores debido a su alta virulencia y desempeño consistente. El medio optimizado, compuesto por melaza (10 g·L⁻¹), urea (0,5 g·L⁻¹) y sales inorgánicas, permitió obtener 6,31 × 10⁹ conidias·mL⁻¹ y 1,0 × 10¹² UFC·mL⁻¹, lo que representó incrementos del 271 % y 751 %, respectivamente, en comparación con el medio comercial. El análisis mediante UHPLC-Orbitrap permitió identificar tentativamente bassianólida en la biomasa fúngica. El aceite mineral fue la formulación más adecuada, ya que mantuvo reducciones de viabilidad inferiores al 16 % y porcentajes de germinación superiores al 80 % después de 30 días de almacenamiento. Los ensayos en vivero, realizados con plántulas de Lippia alba, mostraron reducciones poblacionales superiores al 60 %, mientras que la microscopía electrónica de barrido confirmó la adhesión, germinación y colonización de T. urticae por el hongo. Estos resultados demuestran la viabilidad técnica y el potencial del bioproducto basado en B. bassiana como una alternativa sostenible para el manejo de T. urticae y otros ácaros de la familia Tetranychidae en sistemas agrícolas del departamento del Tolima. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Obtención de compuestos bioactivos de la cáscara del café a través de métodos de extracción verdes(Universidad Nacional de Colombia, 2026-08-19) Gaitán Oyola, Jorge Armando; Rojano, Benjamín Alberto; Murillo Arango, Walter; Gaitán Oyola, Jorge Armando [0000000216910557]; Rojano, Benjamín Alberto [0000000335908046]; Murillo Arango, Walter [000000021482070X]; Química de Los Productos Naturales y Los AlimentosEl estudio tuvo como objetivo obtener compuestos bioactivos antioxidantes a partir de la cáscara de café mediante métodos de extracción verdes. Se recolectaron muestras de Coffea arabica var. caturra chiroso (Tolima) y var. castillo (Antioquia), las cuales fueron secadas, molidas y caracterizadas químicamente. Se evaluaron cuatro técnicas: extracción acuosa (AQU), asistida por ultrasonido (UAE), microondas (MAE) y enzimática (EAE). Se midieron polifenoles, flavonoides, cafeína y ácidos hidroxicinámicos mediante HPLC y métodos espectrofotométricos, además de la capacidad antioxidante por los métodos ABTS, DPPH, FRAP y ORAC. Los resultados mostraron que AQU alcanzó hasta 831.63 mg GAE/100 g y 473.66 mg CE/100 g, con capacidad antioxidante máxima de 14036.27 μmol Trolox/100 g (ABTS). MAE logró 588.37 mg GAE/100 g y 376.77 mg CE/100 g, con valores de 4534.42 μmol Trolox/100 g (ABTS). UAE presentó rendimientos intermedios, mientras que EAE fue la menos eficiente. En pruebas de inhibición de peroxidación lipídica en aceite de linaza, los extractos AQU retrasaron la formación de hidroperóxidos y compuestos polares, mientras que MAE mostró efecto limitado. Se concluye que la cáscara de café es una importante fuente de antioxidantes, que pueden ser extraídos mediante técnicas prometedoras como AQU y MAE para aplicaciones en alimentos funcionales y cosméticos, contribuyendo a la economía circular de residuos agroindustriales. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Estudio e identificación de tres cepas levaduras de importancia en la fermentación del café(Universidad Nacional de Colombia, 2025) Corrales Restrepo, Ana María; Romero Tabarez, Magally; Orozco Sánchez, Fernando; Romero-Tabarez, Magally [0000000340467660]; Orozco-Sanchez, Fernando [0000000245770557]En la presente investigación se identificaron y evaluaron tres cepas de levaduras aisladas de fermentaciones espontáneas ocurridas durante el procesamiento pos-cosecha de frutos de Coffea arabica, con miras a su aplicación en procesos fermentativos controlados. Para ello, se realizó un análisis molecular basado en secuencias ITS y filogenia, mediante el cual se identificaron las cepas como Hanseniaspora uvarum, Starmerella davenportii y Starmerella sorbosivorans. Se evaluó su crecimiento en medios sintético (YGC) y en medios alternativos a base de mucílago de café (MC3 y MC5), aunque YGC mostró el mayor crecimiento, MC3 se presentó como una opción viable por su bajo costo y sostenibilidad. Las cepas se cultivaron en placas de 96 pozos, matraces agitados y un biorreactor de tanque agitado de 7 L. Las curvas de crecimiento fueron modeladas con el modelo logístico de Areny. Las placas promovieron tasas de crecimiento específicas más altas (µ_max), aunque en los matraces se obtuvo mayor biomasa final (X_f). En el biorreactor, S. davenportii mostró el mejor desempeño (µ_max 0.21 ± 0.01 h⁻¹, X_f 0.82 ± 0.04 unid OD_600), asociado a una alta tasa de consumo de oxígeno. En contraste, H. uvarum evidenció un menor consumo de oxígeno. La liofilización con distintos crioprotectores mostró una supervivencia inicial con glutamato sódico (S. davenportii, 27.8%) y leche descremada (H. uvarum, 4.0%), pero ninguna cepa mantuvo viabilidad a los 60 o 120 días. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Valoración del enriquecimiento de ácidos grasos poliinsaturados en huevos de gallinas ponedoras Hy- Line Brown con la suplementación de torta de sacha inchi (Plukenetia volubilis Linneo) en la Amazonia Colombiana(Universidad Nacional de Colombia, 2025-06-29) Prieto Torres, Anderson; Barahona Rosales, Rolando; Chaves Moreno, Luis Carlos; ; Barahona Rosales, Rolando [0000000242467835]; Chaves Moreno, Luis Carlos [0000000306418742]; Biodiversidad y Génetica Molecular "Biogem"El estudio evaluó el efecto de la suplementación con torta de sacha inchi (TSI) Plukenetia volubilis Linneo en la dieta de gallinas ponedoras Hy-Line Brown en la Amazonía colombiana, con el propósito de caracterizar su influencia sobre el perfil lipídico del huevo y analizar sus implicaciones productivas y sensoriales. La investigación se desarrolló en la Granja Experimental Santo Domingo de la Universidad de la Amazonia y en los laboratorios de análisis instrumental de la Universidad Nacional de Colombia, sede Medellín, mediante un diseño completamente al azar con cuatro niveles de inclusión de TSI (0 %, 5 %, 10 % y 15 %) durante ocho semanas de evaluación. Se analizaron variables zootécnicas, composicionales y sensoriales utilizando cromatografía de gases y un panel de cincuenta evaluadores no entrenados. Los resultados demostraron que la suplementación con TSI modificó de manera significativa la composición lipídica del huevo, destacándose el tratamiento T3 (10 %), el cual presentó el mayor enriquecimiento en ácido alfa-linolénico y una reducción marcada en la relación n6:n3, indicadores que evidencian un efecto positivo sobre la calidad nutricional del producto. Sin embargo, el análisis de los indicadores productivos y sensoriales mostró que el tratamiento T2 (5 %) alcanzó un desempeño más estable en cuanto a producción, eficiencia alimentaria y aceptación organoléptica, manteniendo niveles adecuados de textura, sabor y apariencia sin comprometer la estabilidad del huevo. En síntesis, la inclusión de TSI en dietas de gallinas ponedoras constituye una alternativa funcional para enriquecer el perfil lipídico del huevo, siendo el tratamiento T3 el más efectivo para incrementar los ácidos grasos poliinsaturados, mientras que el tratamiento T2 representa el nivel más equilibrado desde una perspectiva productiva y sensorial. Estos resultados permiten proponer el uso de la TSI como ingrediente funcional en sistemas avícolas de la Amazonía colombiana orientados a la producción de alimentos con valor nutricional agregado. Palabras clave: Suplementación, Gallinas ponedoras, sacha inchi, Ácidos grasos poliinsaturados, Enriquecimiento de huevos. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Co-cultivo de microorganismos con potencial biocontrolador frente a Pseudocercospora fijiensis y evaluación de su efecto sobre la obtención de metabolitos de interés(Universidad Nacional de Colombia, 2026) Montoya Vargas, María Paulina; Bedoya Pérez, Juan Carlos; Romero Tabarez, Magally; https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001826296 Montoya Vargas, María Paulina [0001826296]; https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001399814 Bedoya Pérez, Juan Carlos [0001399814]; https://scholar.google.com/citations?user=uc151MwAAAAJ&hl=es Juan Carlos Bedoya Pérez [uc151MwAAAAJ&hl]; Montoya Vargas, María Paulina [0009000472348628]; Bedoya Pérez, Juan Carlos ]0000000337769190]; Romero-Tabarez, Magally [0000000340467660]; Fitosanidad y Control BiológicoEl plátano es un cultivo básico para la seguridad alimentaria, los medios de vida rurales y la economía de exportación en Colombia. Sin embargo, su producción enfrenta limitaciones fitosanitarias, siendo la Sigatoka Negra, causada por Pseudocercospora fijiensis, una de las enfermedades más relevantes. El manejo convencional basado en el uso intensivo de fungicidas, ha generado la aparición de cepas resistentes, aumento en costos de producción y riesgos ambientales significativos. Estas limitaciones resaltan la necesidad de alternativas sostenibles que integren medidas culturales, genéticas y biológicas, destacando el control biológico como componente clave. En este contexto, los antagonistas microbianos y sus metabolitos han cobrado importancia como soluciones ecológicas capaces de reducir la incidencia de la enfermedad y, al mismo tiempo, contribuir a sistemas de producción ambientalmente responsables. Este estudio evaluó el potencial de sistemas de fermentación en co-cultivo de bacterias antagonistas frente a P. fijiensis. Se seleccionaron aislamientos capaces de producir sobrenadantes activos contra cepas del hongo patógeno con diferente sensibilidad a fungicidas. Los aislamientos más prometedores fueron evaluados en términos de compatibilidad y desempeño en co-cultivo bajo distintas estrategias de inoculación. Los resultados mostraron inhibiciones del crecimiento de P. fijiensis superiores al 50 %, en algunos casos superando el efecto de fungicidas convencionales. El análisis químico de sobrenadantes reveló metabolitos característicos de Bacillus sp. M21 y B. velezensis ECF20 en el co-cultivo, lo que confirmó su contribución al perfil metabólico combinado. Estos hallazgos respaldan el potencial del co-cultivo bacteriano como alternativa sostenible y eficaz para el manejo de la Sigatoka Negra. (Tomado de la fuente)Item type: Ítem , Bacterioma de aedes spp en Amazonas: criaderos artificiales, inmaduros, adultos y su relación con variables ambientales(Univesidad Nacional de Colombia, 2025-03-20) Castañeda Espinosa, Alejandro; Moreno Herrero, Claudia Ximena; Vivero Gómez, Rafael José ; ; Castañeda-Espinosa, Alejandro [0009000802961442]; Moreno Herrera, Claudia Ximena [0000000281325223]; Vivero Gómez, Rafael José [0000000167684097]; Duque Granda Daniela; Cadavid Restrepo Gloria Ester; ; Microbiodiversidad y BioprospecciónAedes aegypti and Aedes albopictus are the main vectors of arboviruses worldwide, responsible for more than 14.5 million of annual cases of dengue, Zika, chikungunya, and yellow fever. In the last decade, biological and abiotic factors such as bacterial communities and temperature have favored their adaptation to new environments, altering their vector competence and expanding transmission cycles in endemic and non-endemic areas. Furthermore, insecticide resistance, the limitations of current vector control strategies, and the adaptation of mosquitoes to new environments make it necessary to investigate alternative vector control strategies. This study analyzes biotic and abiotic factors with potential for integration into vector control. In Chapter 1, the microbiota of water bodies, larvae, pupae, and adults of Ae. aegypti, were characterized and correlated with physicochemical variables of the water. In Chapter 2, the temperature preferences of male and female Ae. aegypti and Ae. albopictus mosquitoes were evaluated, and bacterial diversity was analyzed according to preferred temperature. Physicochemical variables and water, larval, and pupal samples were collected from artificial breeding sites in Leticia, Amazonas. Mosquitoes for the thermal assay were obtained using ovitraps and reared to adults. Fifty individuals per species and sex were then exposed in six replicates within a thermal gradient (19–36°C) for one hour. For both chapters, whole-body DNA was extracted, and the V3-V4 region of the 16S rRNA gene was sequenced to analyze bacterial communities. In chapter 1, the most common breeding sites were buckets, plant pots, and tires, with similar physicochemical profiles, although with significant differences in temperature and salinity (ANOVA, p < 0.03). The dominant bacterial genera included Ottowia (82.00%), Xanthobacter (70.59%), and Rhodocyclaceae (92.78%) in the breeding water; Aquabacterium (61.07%), Dechloromonas (82.85%), and Flectobacillus (58.94%) in immature stages. These genera have been found in aquatic environments and in larval hosts, can aid mosquitoes in surviving in artificial breeding sites where pollution is widespread, due to capable of reducing water pollutants. In adults, Asaia (2.88%), Cedecea (45.80%), Elizabethkingia (77.78%), and Klebsiella (8.90%) were the most abundant genera in Ae. aegypti and Elizabethkingia (36.34%), Pseudomonas (95.08%), and Wolbachia (12.73%) in Ae. albopictus. Regarding temperature preference essays, Ae. aegypti females and males preferred mean temperatures of 25.27±1.00°C and 25.32±2.06°C, respectively, like females of Ae. albopictus, which presented an average of 25.70 ± 0.91 °C. In contrast, Ae. albopictus males showed a higher average temperature compared to the other groups, 27.95 ± 0.70, without a statistical difference (Kruskal-Wallis chi-squared, P>0.05). Moreover, the internal profile distribution analysis showed differences inside the thermal gradient after Tukey post hoc analysis Ae. aegypti and Ae. albopictus females preferred temperatures between 23–28°C, while Ae. albopictus males were found at higher temperatures, between 25–28°C, and Ae. aegypti males at 21–28°C (ANOVA, p<0.001). The abundance of Elizabethkingia, Pseudomonas, Cedecea, Klebsiella, Asaia, and Wolbachia varied by sex and temperature in both species, suggesting that the structure of bacterial communities was influenced by species, sex, and temperature. In conclusion, our results demonstrate the remarkable ability of Ae. aegypti to develop under diverse physicochemical conditions, highlighting the role of temperature and salinity variability and bacterial communities in shaping habitat suitability. We also found sex-specific differences in thermal preference in both Ae. aegypti and Ae. albopictus, with females selecting temperatures between 23–28°C, suggesting a potential thermoregulatory strategy linked to longevity. Additionally, key bacteria, including Asaia, Cedecea, Elizabethkingia, and Wolbachia, showed temperature-associated patterns, indicating that thermal preference may influence microbiota composition and, consequently, vector capacity. Together, these findings underscore the importance of integrating local environmental and microbiological conditions in the design of more effective control strategies.Item type: Ítem , Estudio de metagenomas de suelos amazónicos en áreas contiguas representativas del contraste ecosistémico preservado/deforestado en el departamento del Caquetá, Colombia(Universidad Nacional de Colombia, 2025) Nuñez Rodriguez, Laura Ximena; Moreo Herrera, Claudia Ximena; Junca Díaz, Howard Armando ; Ortíz Morea, Fausto Andrés ; Nuñez Rodriguez. Laura Ximena [0000000261013708]; Moreno Herrera. Claudia Ximena [0000000281325223]; Microbiodiversidad y BioprospecciónLa región amazónica, conocida por su rica biodiversidad, ha experimentado una rápida conversión de bosques en tierras ganaderas, lo que impacta negativamente sus ecosistemas por la pérdida de microorganismos esenciales para la salud del suelo y los ciclos biogeoquímicos. A pesar de la creciente cantidad de investigaciones sobre este tema en otras regiones amazónicas, el conocimiento sobre la diversidad y el papel funcional del microbioma del suelo en el departamento del Caquetá sigue siendo limitado. El presente proyecto tiene como objetivo evaluar el perfil taxonómico y funcional en metagenomas de suelos amazónicos y entender cómo las actividades humanas y las variables ambientales condicionan a las comunidades microbianas del suelo. Para este fin, utilizando datos de secuenciación metagenómica realizadas en suelos de bosque y pastura, y por medio de herramientas bioinformáticas se busca identificar las comunidades microbianas y las vías metabólicas más representativas del contraste ecosistémico estudiado. El proyecto busca además aumentar el conocimiento sobre la biodiversidad microbiana en el Caquetá, también formar recurso humano idóneo en el uso de conceptos de ecología microbiana y de herramientas bioinformáticas, así como promover y adicionar evidencia para la conservación de estos ecosistemas vitales. El conocimiento y la comprensión de la resiliencia de las comunidades microbianas frente a los cambios en el paisaje y las actividades humanas es fundamental para la conservación de la Amazonía colombiana y la sostenibilidad de los ecosistemas. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Caracterizar la microbiota funcional en suelos cultivados en un estudio de caso con Bixa orellana en el corregimiento de Chintadó, municipio del Atrato – Chocó - Colombia.(Universidad Nacional de Colombia, 2025) Mosquera Palacios, Leidy; Cardona Gallo, Santiago Alonso; Osorio Vega, Nelson Walter ; Mosquera Palacios, Leidy [https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0002097548]; Cardona Gallo, Santiago Alonso [https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000643653]; Mosquera Palacios, Leidy []0009-0001-0830-1479 ]; Cardona Gallo, Santiago Alonso [0000000218757330]; Osorio Vega, Nelson Walter [0000000206541399]; Posgrado en aprovechamiento de recursos hidráulicos- PARHEsta investigación, desarrollada como estudio de caso exploratorio, tuvo como objetivo caracterizar la microbiota funcional del suelo asociada al cultivo de Bixa orellana en el corregimiento de Chintadó (Chocó), comparando suelos con cultivos de tres y diez años. La investigación integro métodos dependientes e independientes de cultivo para describir la composición bacteriana, la actividad microbiana del suelo y la presencia de grupos funcionales e interés agrícola, con el propósito de aportar conocimiento sobre la relación suelo y microorganismo en un sistema agrícola productivo tropical poco documentado. El análisis metataxonomico evidencio diversas bacterias, dominadas por filos ampliamente reportados en suelos agrícolas, entre ellos Acidobacteriota y Proteobacteria, mientras que las técnicas de cultivo de microorganismos permitieron identificar grupos funcionales como fijadores de nitrógeno, solubilizadores de fósforo, microorganismos celulolíticos, proteolíticos, así como esporas micorrizales. La posible relevancia funcional de estos taxones fue interpretada a partir de la literatura científica, dado que el estudio no incluyo la verificación experimental directa del rol funcional. La actividad respiratoria del suelo mostró diferencias asociadas a la edad del cultivo de B. orellana, aportando información sobre la dinámica microbiana con distinto tiempo de establecimiento de la planta. Asimismo, se detectaron microorganismos que incluyen con potencial fitopatógeno, como el género Ralstonia, aunque en baja proporción pero que requiere de supervisión en la planta. La prueba de ecotoxicidad con E. foetida confirmo la inocuidad de los suelos tratados con compost, respaldando su uso como enmienda orgánica bajo las condiciones evaluadas. Además, los resultados indican que los mismos taxones de microorganismos están presentes en los suelos de tres y diez años, aunque con pocas variaciones en su abundancia, conforman una base de referencia para comprender la microbiota asociada a B. orellana en el corregimiento de Chintadó, así como un punto de partida para futuros estudios orientados a la validación funcional, el aprovechamiento de microorganismos autóctonos y el fortalecimiento de estrategias de manejo sostenible para el cultivo. (Texto tomado de la fuete)Item type: Ítem , La mitigación del envejecimiento del ovocito bovino a través del suministro de NMN durante la maduración in vitro(Universidad Nacional de Colombia, 2025) Carrillo Gómez, Andrea Carolina; Urrego Álvarez, Rodrigo Antonio; Vásquez Araque, Neil Aldrin; Carrillo Gómez, Andrea Carolina [0009000433310619]La disminución de NAD⁺ y el envejecimiento ovocitario se asocian con pérdida de competencia. La β-nicotinamida mononucleótido (NMN), precursor de NAD⁺, podría sostener el estado energético/redox durante la maduración in vitro (MIV). Evaluamos la suplementación con NMN en ovocitos bovinos bajo MIV estándar (22–24 h) y extendida (30 h, 48 h), comparando control (C), control envejecido (CE) y NMN 5, 1, 0,1, 0,01 μM. Se registraron tasas de clivaje y blastocistos; en ovocitos maduros se midieron ROS (H₂DCFDA) y GSH (CMF2HC) y un índice cortical/citoplasmático de F-actina. Para expresión génica, la qPCR se realizó en embriones (blastocistos D7–D8, expandidos) de C, CE y N0,01, analizando TP53, SIRT1, BAX, PARP1, DNMT3 y POU5F1/OCT4 (referencia: H2FZ). A 22–24 h, 0,01 μM incrementó la blastulación frente a C (40,7 % vs 28,9 %); el clivaje no cambió entre tratamientos. A 30 h, CE redujo clivaje (54,8 % vs 67,5 %) y blastocistos (18,6 % vs 28,0 %); 0,01 μM restauró ambos (68,5 % y 29,0 %), comparable a C y superior a CE; las otras dosis no mostraron diferencias. A 48 h, la blastulación cayó de 30,8 % (C) a 6,4 % (CE); NMN no revirtió (≈0–3 %). En ovocitos maduros, ROS aumentó en CE y se normalizó con 0,01 μM; GSH fue mayor en CE; el índice de F-actina se aproximó a 1 con 0,01 μM (equilibrio), mientras C/CE tendieron a >1. En qPCR, TP53 aumentó con 0,01 μM; SIRT1/BAX mostraron tendencias; PARP1, DNMT3 y POU5F1/OCT4 no cambiaron. (texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Producción de la enzima sacarosa isomerasa de Pectobacterium carotovorum en Pichia pastoris recombinante.(Universidad Nacional de Colombia, 2026-05-06) Collazos Duarte, Mónica del pilar; Zapata Zapata, Arley David; Zapata Zapata, Arley David [000000026557772X]; Biotecnología IndustrialLa sacarosa (α- D- glucopiranosil-1,2- D- fructofuranosa) es el disacárido más abundante del mundo, producido por todas las plantas donde tiene un papel vital como carbohidrato de transporte o como carbohidrato de almacenamiento y es el único disacárido no reductor del enlace glicosídico de glucosa y fructosa. Sin embargo, dada la creciente demanda en productos edulcorantes alternativos, los isómeros de sacarosa son una fuente natural y viable como sustituto de azúcar, sin causar efectos adversos a la salud humana. La obtención es posible a partir de enzimas microbianas que convierten la sacarosa a isómeros estructurales con propiedades químicas individuales que para algunas aplicaciones pueden tener ventajas sobre la sacarosa (Goulter et al., 2012). En la producción, usando sistemas de expresión de proteínas recombinantes, la proporción del producto depende principalmente de la cepa bacteriana, pero también de la temperatura, el pH y las condiciones de reacción (Ravaud et al., 2009). Estos factores deben ser optimizados para lograr la alta producción de la proteína deseada; como el medio de cultivo, la fuente de carbono y nitrógeno, tiempo y temperatura, que son condiciones críticas que pueden ser ajustadas individualmente (Zhang, K. et al., 2024). En este estudio se evaluó el efecto de las condiciones del cultivo en Pichia pastoris recombinante con enzima sacarosa isomerasa (SIasa), extraída del microorganismo Pectobacterium carotovorum, obteniendo valores óptimos de actividad enzimática en cultivos de 72 horas, con pH 7.0, temperatura de reacción de 45 °C y tiempo de incubación de 40 min. A su vez se estudió la cinética de producción para la enzima SIasa con una velocidad de crecimiento específica (μ) de 0.190 h¹, concentración de proteína de 0.808 mg/L. También se evaluó la producción de isómeros de sacarosa en un sistema de reacción a 30°C, concentración de enzima de 220 U/mL, usando sacarosa al 40% como sustrato. Como resultado se obtuvieron rendimientos de trehalulosa alrededor del 18% e isomaltulosa de 50 % a escala de matraz agitado. (texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Variación morfométrica de dos especies de Astyanax en la cuenca media y baja del río Cauca: efectos de la genética, el sexo, y el ambiente(Universidad Nacional de Colombia, 2025) Alvarez, Daniela; Márquez Fernández, Edna Judith; Ramírez-Álvarez, Daniela [0000000034761941X]; Marquez Fernandez, Edna Judith [0000000307603747]Astyanax, un género tradicionalmente asignado a la familia Characidae y recientemente propuesto para Acestrorhampidae, se caracteriza por su alta plasticidad fenotípica y adaptabilidad a diversos hábitats. En este estudio se evaluó la variación morfométrica de Astyanax caucanus y A. sp. "coli-roja" mediante morfometría geométrica, considerando la influencia de factores genéticos, el sexo y el ambiente (hábitat y periodo climático) sobre el tamaño y la conformación corporal en poblaciones de la cuenca media y baja del río Cauca. En A. caucanus, no se detectaron diferencias significativas entre grupos genéticos. En A. sp. "coli-roja", los individuos del grupo Asp2 fueron más pequeños y mostraron una conformación corporal más fusiforme que los del grupo Asp1. En cuanto al sexo, en A. caucanus las hembras presentaron mayor talla que los machos, mientras que en A. sp. "coli-roja" no se observaron diferencias de talla, pero sí un dimorfismo en la conformación corporal, con hembras más fusiformes. Ambas especies respondieron al régimen hidrológico: en hábitats lóticos desarrollaron morfologías más hidrodinámicas, y en lénticos, cuerpos más profundos y pedúnculos caudales anchos. Astyanax sp. "coli-roja" también presentó variación estacional asociada a fluctuaciones del caudal. Los resultados evidencian una interacción compleja entre factores genéticos, ecológicos y sexuales, y sugieren la posible existencia de un complejo de especies en A. sp. "coli-roja". Este estudio contribuye al entendimiento de los mecanismos de diferenciación morfológica y plasticidad fenotípica en peces neotropicales, con implicaciones para la taxonomía, la conservación y el manejo de ecosistemas dulceacuícolas. (Tomado de la fuente)Item type: Ítem , Diseño racional y validación in silico e in vitro de péptidos antimicrobianos sintéticos inspirados en proteomas de especies de la biodiversidad colombiana(Universidad Nacional de Colombia, Sede Medellín, 2025-11-20) Mesa Gómez, Andrea; Orduz Peralta, Sergio; Mesa, Andrea [0000000253873732]; Ordúz Peralta, Sergio [0000000175873816]; Biología FuncionalLa creciente resistencia de los microrganismos a los antibióticos y la baja eficacia de los antivirales representan una crisis de salud pública con un impacto significativo, estimándose que para 2050 esta problemática podría causar alrededor de 10 millones de muertes anuales. Ante esta situación, los péptidos antimicrobianos y antivirales han emergido como alternativas prometedoras debido a su alta especificidad y menor propensión a generar resistencia. Colombia por su biodiversidad ofrece un recurso valioso para la identificación de péptidos con potencial terapéutico. En este estudio, se utilizaron plataformas bioinformáticas para analizar el proteoma de 20 organismos, obteniendo 17,483,597 péptidos, de los cuales se seleccionaron ocho con alta predicción de actividad antimicrobiana (>95 %) y antiviral (>70 %), además de cumplir con parámetros favorables de bioseguridad y estabilidad biológica. Posteriormente, estos péptidos fueron optimizados mediante modificaciones estructurales para mejorar su estabilidad y bioseguridad. La validación in silico, mediante acoplamiento molecular con la proteína Spike del SARS-CoV-2, evidenció que los péptidos Vp-P1 y Pl-P4 establecen interacciones fuertes con el dominio viral, sugiriendo una posible inhibición de la entrada del virus en células huésped. Asimismo, los péptidos Pl-P4M y Am-P5 mostraron interacciones cercanas, estables y fuertes con la tríada catalítica del complejo NS2B-NS3 del virus del Dengue, indicando su potencial inhibitorio en el procesamiento de la poliproteína viral. Además, la evaluación in vitro contra microorganismos evidenció que siete de los diez péptidos presentaron actividad significativa (MIC <10 µM). Estos hallazgos resaltan su potencial para estudios preclínicos, reafirmando la importancia de las estrategias utilizadas en el desarrollo de nuevos compuestos contra patógenos de interés clínico. Palabras clave: Biodiversidad, Péptidos, Antivirales, Antimicrobianos, Acoplamiento molecular . (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Estandarización de un protocolo de cultivo in vitro de Smallanthus sonchifolius para el suministro de material de siembra en la cadena productiva de yacón del departamento de Cundinamarca - Colombia(Universidad Nacional de Colombia, 2025) Cardozo Niño, Laura Viviana; Buitrago Hurtado, Gustavo; Bustamante Rodríguez, Silvia Lizette; Cardozo Niño, Laura Viviana [0001597720]; Buitrago Hurtado, Gustavo [0000051098]; Bustamante Rodríguez, Silvia Lizette [0000169307]; Buitrago Hurtado, Gustavo [0000000343315646]; Bustamante Rodríguez, Silvia Lizette [0000000225959758]; Grupo de Investigación sobre El Cultivo del ÑameEl yacón, Smallanthus sonchifolius (Asteraceae: Smallanthus), representa un importante cultivo agrícola andino dotado de considerables atributos nutracéuticos y medicinales; sin embargo, su propagación convencional a través de rizomas se ve obstaculizada por diversas restricciones fitosanitarias. Este estudio tuvo como objetivo establecer un protocolo estandarizado de cultivo in vitro para facilitar la generación eficiente de material de siembra de calidad superior en el departamento de Cundinamarca - Colombia. Para ello, se evaluaron diferentes tratamientos a lo largo del proceso de micropropagación, desde la selección del material vegetal de origen hasta la aclimatación de las plántulas obtenidas. En la primera etapa de selección del material vegetal se desarrolló el establecimiento de un cultivo stock (in vivo) en invernadero donde evaluaron tres diferentes métodos de desinfección del material origen (secciones del rizoma), siendo el tratamiento hipoclorito de sodio (NaClO) al 0,5 % que permitió alcanzar una regeneración del 92,5 % en la propagación vegetativa bajo condiciones de invernadero, complementado con estrategias preventivas de manejo integrado de plagas. Durante el establecimiento a condiciones in vitro, se evaluó el efecto del ácido indolacético (AIA) y kinetina (KIN) en interacción con los protocolos de desinfección superficial elegidos, logrando el establecimiento in vitro con el protocolo modificado de Murashige y Skoog (MS), suplementado con carbón activado y libre de reguladores de crecimiento a partir de la evaluación de la combinación de tratamientos de desinfección y uso reguladores de crecimiento. En esta etapa también se evaluaron dos citoquininas: BAP (6-bencilaminopurina) y KIN, las cuales no promovieron el desarrollo adecuado de los explantes, induciendo la formación de callos sin diferenciación. En la fase de aclimatación y endurecimiento, se comparó el uso de cámara de intercambio gaseoso bajo dos condiciones: cámara climática y en invernadero, obteniendo mejor respuesta en la primera con una supervivencia del 44,8 %, evidenciando en esta fase un punto crítico del proceso. El protocolo estandarizado alcanzó una tasa de propagación de 4.0 y permitió identificar factores limitantes para el establecimiento del cultivo in vitro de S. sonchifolius. Esta herramienta biotecnológica contribuye a la producción de material de siembra de alta calidad y con un estándar fitosanitario acorde con las buenas prácticas agrícolas, fortaleciendo la capacidad productiva de los pequeños agricultores de Cundinamarca. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Procesos microbianos y fotocatalíticos para la degradación de glifosato y acetamiprid usados en cultivos de arroz del departamento del Tolima(Universidad Nacional de Colombia sede Medellín, 2025) Penagos Jaramillo, Nicolas Eduardo; Pabon Gelves, Elizabeth; Penagos-Jaramillo, Nicolas Eduardo [0001886937]; Pabón-Gelves, Elizabeth [0000628670]; Jaramillo-Paez, Cesar Augusto [0000386316]; Penagos-Jaramillo, Nicolas Eduardo [0000000291174748]; Pabón-Gelves, Elizabeth [0000000181087635]; Jaramillo-Paez, Cesar Augusto [0000000246228508]; Ciencia de Materiales AvanzadosEl uso intensivo de glifosato y acetamiprid en cultivos de arroz ha generado preocupación ambiental debido a su persistencia y toxicidad. Se evaluaron procesos de degradación fotocatalítica y microbiana para ambos compuestos, así como la toxicidad de sus productos de degradación. El TiO2 presentó fase anatasa, con una banda prohibida de 3,02 eV, absorbancia máxima a 369 nm, y un área superficial de 273 m²/g. El ZnO mostró fase wurtzita, absorbancia a 384 nm, morfología de nanoplacas de 200 nm y un área superficial de 187 m²/g. En condiciones óptimas, el TiO₂ degradó 96% del glifosato en su formulación comercial (Roundup) y 100% del estándar analítico. En el caso del acetamiprid se alcanzó una remoción del 62% para la formulación comercial (Rescate 200SP) y del 84% para el estándar analítico. Asimismo, el ZnO alcanzó una remoción del 44% y 73% para glifosato comercial y el estándar analítico respectivamente. En el caso del acetamiprid, se obtuvo un porcentaje de eliminación del 58% y del 87% para el estándar analítico, bajo condiciones específicas de operación. Las bacterias comerciales utilizadas (Bacillus cereus ATCC 14579, Bacillus subtilis 160 y Pseudomona aeruginosa ATCC 27853), solo Bacillus cereus mostró tolerancia, pero sin lograr una biodegradación efectiva. Los ensayos ecotoxicológicos revelaron que el glifosato fue fitotóxico en Lactuca sativa, que se redujo tras la fotocatálisis. El acetamiprid causó toxicidad aguda en Eisenia foetida, reducida al 30% con TiO₂ y al 50% con ZnO. Los resultados evidencian el potencial de la fotocatálisis en la remediación de aguas contaminadas y la necesidad de optimizar condiciones para la biodegradación. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Caracterización molecular mediante dos marcadores mitocondriales y detección de infección por Mycoplasma en loros y guacamayas recuperados del tráfico en tres zonas de Colombia(Universidad Nacional de Colombia, 2025-12) Marín Villa, Julián; Úsuga Monroy, Cristina; López Herrera, Albeiro; Marín Villa, Julián [0001709795]; Marín Villa, Julián [Q24nXQkAAAAJ]; Marín Villa, Julián [0009000649782949]; López Herrera, Albeiro [0000000314443470]; Úsuga Monroy, Cristina [0000000161012994]; Julián Marín Villa [Julian-Marin-Villa]; Biodiversidad y Génetica Molecular "Biogem"El tráfico ilegal de fauna silvestre representa una amenaza para la biodiversidad en Colombia, donde los psitácidos son uno de los grupos más afectados. Esta situación genera retos para identificar y evaluar sanitariamente a los individuos que ingresan a los Centros de Atención y Valoración de Fauna Silvestre para su rehabilitación y liberación. La ausencia de información sobre la circulación de patógenos como Mycoplasma gallisepticum (MG) y Mycoplasma synoviae (MS) en psitácidos del país, junto con la falta de datos genéticos de referencia, limita la toma de decisiones informadas. La información genética de base no solo permite identificar individuos completos, sino también subproductos difíciles de reconocer morfológicamente. En este estudio se caracterizaron molecularmente a 88 individuos de los géneros Amazona y Ara mediante los genes mitocondriales COI y 16S rRNA, y se evaluó la presencia de MG y MS mediante ELISA y PCR en tiempo real. Se generaron 61 secuencias nuevas del gen COI y 77 del 16S rRNA, con un total de 35 haplotipos para COI (20 en Amazona, 15 en Ara) y 28 para 16S rRNA (19 en Amazona, 9 en Ara). El gen COI mostró alta capacidad de discriminación taxonómica, evidenciando haplotipos únicos para cada especie y agrupaciones claras en las inferencias filogenéticas y análisis de componentes principales. En Amazona, las especies del complejo de loros de cabeza amarilla presentaron baja diferenciación genética, mientras que, en Ara, Ara militaris y Ara ambiguus mostraron alta similitud genética. No obstante, especies como Amazona amazonica, Ara severus y Ara ararauna mostraron alta diversidad genética intraespecífica, lo que sugiere la utilidad del gen COI para estudios de estructuración poblacional. En cuanto al gen 16S rRNA, si bien presentó menor resolución en los análisis de componentes principales y redes haplotípicas, la inferencia filogenética permitió separar adecuadamente la mayoría de las especies, excepto aquellas del complejo de loros de cabeza amarilla. Por otro lado, en la detección de MG y MS se encontró una seropositividad del 10.2 % para MG y del 2.3 % para MS, sin positividad molecular. El gen mitocondrial COI demostró ser una herramienta eficaz para la identificación molecular en psitácidos, mientras que el gen 16S rRNA presentó limitaciones por su menor variabilidad. La detección de anticuerpos frente a MG y MS, sin evidencia de infección activa, pone en evidencia la importancia de incorporar evaluaciones sanitarias en los procesos de rehabilitación y liberación. La integración de datos genéticos y sanitarios orienta decisiones responsables de manejo y liberación, minimizando el riesgo de introducir patógenos o alterar la estructura genética de las poblaciones silvestres receptoras. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Evaluación de la microbiota intestinal de Aedes aegypti del municipio de Florencia Caquetá y su capacidad de biodegradación de los insecticidas temefos y deltametrina(Universidad Nacional de Colombia, 2025-11-24) Viafara Campo, Jennifer Danitza; Cadavid Restrepo, Gloria Ester; Vivero Gómez, Rafael José; Moreno Herrera, Claudia Ximena; Viafara Campo, Jennifer Danitza [0002212156]; Viafara Campo, Jennifer Danitza [0009000372596595]; Cadavid Restrepo, Gloria Ester [0000000310266358]; Vivero Gómez, Rafael José [0000000167684097]; Moreno Herrea, Claudia Ximena [0000-0002-8132-5223]; Microbiodiversidad y BioprospecciónAedes aegypti es el principal vector de diversos arbovirus, como el dengue, Zika, chikungunya y fiebre amarilla. Su alta capacidad de adaptación a entornos urbanos representa un riesgo considerable para la salud pública. La creciente disminución de susceptibilidad de esta especie a insecticidas organofosforados y piretroides, como el temefos y la deltametrina, ha generado preocupación respecto a la eficacia de los programas de control vectorial. Estudios recientes sugieren que las bacterias intestinales de los insectos vectores podrían desempeñar un papel clave en la respuesta a los insecticidas y en la biodegradación de estos compuestos. Este estudio evaluó la susceptibilidad de Ae. aegypti de Florencia, Caquetá, al temefos y la deltametrina, así como la diversidad de su microbiota intestinal en larvas y hembras adultas expuestas a estos insecticidas. Las larvas mostraron susceptibilidad al temefos, con una razón de resistencia (RR) de 1,84, mientras que las hembras adultas exhibieron tolerancia, manifestada como una pérdida de susceptibilidad frente a la concentración discriminante de 10 μg/mL de deltametrina. Se observó una mayor carga bacteriana en intestinos de hembras expuestas a deltametrina (3,42 × 10⁶ UFC/mL), en comparación con larvas expuestas al temefos (9,4 × 10⁵ UFC/mL) y con las hembras no expuestas (8 × 10⁴ UFC/mL). En total, se obtuvieron 68 aislados bacterianos, de los cuales 31 fueron identificados mediante secuenciación del gen ARN 16S y 11 mediante el gen gyrB. Se identificaron géneros bacterianos exclusivos asociados a cada tratamiento: Bacillus en hembras no expuestas (12,55 %), Serratia en larvas expuestas (35,29 %) y Cedecea en hembras expuestas (66,67 %). Adicionalmente, se evaluó la tolerancia y el potencial de biodegradación in vitro de temefos y deltametrina de 13 cepas bacterianas intestinales aisladas de esta población. La cinética de crecimiento mostró que todas las cepas crecieron en medio LB, pero solo tres cepas Enterobacter asburiae (P2D2C1), Chryseobacterium gleum (P31D2) y Cedecea neteri (P2HD2) mostraron el mejor crecimiento en medio mínimo M9 utilizando los insecticidas como única fuente de carbono. La biodegradación se analizó mediante HPLC-MS/MS y GC-MS, identificando metabolitos en distintos tiempos de incubación. En particular, C. gleum (P31D2) generó cinco metabolitos durante la biodegradación de temefos en 72 horas: 4,4′-tiodifenol, 4,4′-sulfinildifenol, 4,4′-sulfonildifenol, temefos dioxon y sulfóxido de temefos. De manera similar, C. neteri (P2HD2) generó cuatro metabolitos durante la biodegradación de la deltametrina en un periodo de 24 horas: 3-(2,2-dibromoetenil)-2,2-dimetilciclopropanoico, 3-fenoxifenilacetonitrilo, 3-fenoxibenzaldehído y éster metílico del ácido 4-fenoxibenzoico. A partir de los metabolitos identificados, se propusieron posibles rutas metabólicas para cada insecticida, sugiriendo que ambas cepas, C. gleum (P31D2) y C. neteri (P2HD2), tienen un alto potencial para biodegradar estos compuestos, lo cual podría ser prometedor y de gran interés biotecnológico en estrategias de biorremediación. Estos hallazgos proporcionan evidencia del papel funcional de la microbiota intestinal en la respuesta de los insectos a los insecticidas y abren nuevas perspectivas para el desarrollo de estrategias de control de vectores más sostenibles, orientadas a comprender las interacciones entre el insecto y su comunidad bacteriana. (Texto tomado de la fuente)Item type: Ítem , Estudio del microbioma asociado a insectos vectores triatominos en zonas de transmisión de la enfermedad de Chagas(Universidad Nacional de Colombia, 2025) Varón Saavedra, Angie Natalia; Moreno Herrera, Claudia Ximena; Cadavid Restrepo, Gloria Ester; Vivero Gómez, Rafael José; Moreno Herrera, Claudia Ximena [0000000281325223]; Cadavid Restrepo, Gloria Ester [0000000310266358]; Vivero Gómez, Rafael José [0000000167684097]; Microbiodiversidad y BioprospecciónLa enfermedad de Chagas, causada por Trypanosoma cruzi, continúa siendo un importante problema de salud pública en América Latina; en esta región, la transmisión ocurre principalmente a través de insectos triatominos, que eliminan el parásito en sus heces. Según su capacidad para transmitir el parásito, estos insectos se clasifican en vectores primarios y secundarios En Tolima, Colombia, el vector secundario Rhodnius colombiensis ha adquirido una relevancia epidemiológica debido a su capacidad para colonizar ambientes domiciliarios y a sus altas tasas de infección por T. cruzi, lo que aumenta el riesgo de transmisión en áreas donde los vectores primarios, como R. prolixus, han sido controlados; comprender las interacciones ecoepidemiológicas de este vector, incluyendo sus fuentes de alimentación sanguínea, la microbiota intestinal, la presencia de endosimbiontes y la infección por T. cruzi, es clave para evaluar su capacidad vectorial y su posible uso en estrategias de control biológico. En este estudio se caracterizó el microbioma intestinal de R. colombiensis mediante enfoques dependientes e independientes del cultivo, incluyendo la secuenciación de próxima generación (NGS) del gen 16S rRNA y la detección de endosimbiontes bacterianos, las fuentes de alimentación sanguínea y la presencia de T. cruzi, para esto, se analizaron especímenes en diferentes etapas de desarrollo, provenientes ambientes selváticos e insectario de Coyaima-Tolima y, la identificación de los insectos se realizó mediante claves taxonómicas y análisis molecular del gen COI. Se analizaron 151 especímenes (85 silvestres y 66 de insectario), en el DNA intestinal donde se detectaron los endosimbiontes Cardinium (2,2%) y Microsporidia (4,4%), Didelphis marsupialis y Gallus gallus como fuentes de sangre, y ADN de T. cruzi estuvo presente en el 92% de las muestras evaluadas. El análisis por NGS reveló que los filos bacterianos más abundantes fueron Actinobacteria (54%), Firmicutes (24%) y Proteobacteria (19%), con Gordonia, Lactococcus y Enterobacter como géneros predominantes. Los métodos dependientes del cultivo permitieron aislar y caracterizar 22 cepas bacterianas, siendo Staphylococcus, Yokenella y Dietzia las más representativas. Estos hallazgos sobre la composición y diversidad bacteriana, reportados por primera vez en este estudio, junto con la información sobre sus hospederos silvestres y las tasas de infección por el parásito, destacan la importancia de investigar la microbiota en vectores secundarios como R. colombiensis, este conocimiento puede contribuir a mejorar la vigilancia y el desarrollo de estrategias de control dirigidas a triatominos no domésticos en Colombia. (Texto tomado de la fuente)