El sistema ENSO y las Ondas Tropicales del Este se encuentran entre los factores que ayudan a explicar las anomalías hidrológicas en Colombia. En el presente trabajo se implementan la Transformada en Onditas y la Transformada de Hilbert-Huang al estudio de series de lluvia diaria en los Andes Tropicales de Colombia con el fin de estudiar la influencia de las Ondas Tropicales del Este en la precipitación para diferentes fases del ENSO. Se analizan los dos años más fuertes de cada fase del sistema ENSO (El Niño y La Niña) basados en los índices ONI y MEI, y la información disponible de precipitación. Los resultados muestran que todas las estaciones presentan frecuencias predominantes con periodos asociados a 3-7 días y porcentajes de potencia superiores al 65% que se pueden asociar con las características de las Ondas Tropicales del Este. Dichas frecuencias disminuyen para los años El Niño. Los espectros de potencias en Onditas y de Hilbert-Huang exhiben mayor variabilidad para los meses Junio-Noviembre de los años La Niña y Normal que para los años El Niño, lo que contribuye a explicar la reducción drástica de la precipitación en Colombia en la fase cálida del ENSO.