La materia orgánica del suelo es una mezcla heterogénea de productos debida a transformación microbiana de residuos la cual depende de las características del material originario y las condiciones del medio. Compuestos como almidón, celulosa, hemicelulosa y proteínas sencillas se degradan con mayor facilidad siendo transformados a compuestos intermedios menos complejos y finalmente a sustancias más simples como el CO2. Otros como lignina, resinas y taninos son de difícil degradación y pueden mantenerse ligeramente alterados o inalterados durante tiempo indeterminado y, finalmente, transformados a humus. Para identificar los compuestos del carbono provenientes de la aplicación de vinaza (0, 10, 40, 80, 120 y 160 m3/Ha) a un mollisol del Valle del Rio Cauca se empleó pirolisis acoplada a espectroscopía de masas. Los compuestos se obtuvieron a partir de la materia orgánica del suelo mediante separación granulométrica y extracción sucesiva empleando una solución de NaOH 0.1M, centrifugación (4000 rpm), purificación a través de tratamientos ácidos HCl-HF con agitación de 48 horas, diálisis y finalmente liofilización. Se identificaron polisacáridos, compuestos de lignina, ácidos grasos, compuestos nitrogenados, aromáticos, azufrados, fenoles, poliaromáticos y terpenos. Estos resultados permiten concluir que la aplicación de vinazas no produce cambios fundamentales en los procesos microbiológicos de descomposición en el suelo///Abstract: Soil organic matter is a heterogeneous mixture of compounds resulting from microbial transformation of organic waste which depends on the organic compounds characteristics and on the environmental conditions. Some can be more easily degraded than others like starch, cellulose, hemi-cellulose and simple protein giving first intermediate compounds more or less complex and finally CO2. Lignin resins and tannins are difficult to degrade and remain slightly altered or unaltered for a certain period of time. Pyrolysis coupled to mass spectroscopy were used to identify chemical compounds coming from of vinasse (0, 10, 40, 80,120 and 160m3/Ha) application to a mollisol from the Cauca river valley. Organic compounds were obtained by granulometric separation and a successive extraction using a solution of NaOH 0,1M, centrifugation (4000 rpm), purified through acid treatment (HCl-HF) 48 hours stirring and dialysis and finally lyophilization. The main organic compounds extracted from soil after applying different doses of vinasse on the soil studied were polysaccharides, lignine compounds, fatty acids, aromatic compounds, phenols and nitrogen and sulfur compounds and. The results obtained mean that the use of vinasses does not cause changes in the microbiologic activity in the soils.