Perfil de expresión de microRNAs en pacientes con cáncer colorrectal esporádico
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Trabajo de grado - Maestría
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EspañolPublication Date
2015Metadata
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Introducción: El cáncer colorrectal (CRC) ocupa el cuarto lugar en mortalidad en Colombia, registrando cerca de 12 casos por cada 100 mil habitantes. Aún no existen estrategias de detección temprana efectivas, no invasivas. En cáncer los microRNAs (miRNAs) se han propuesto como potenciales biomarcadores ya que alteran su expresión dependiendo el estadio tumoral y son tejido-específicos. Objetivo: Evaluar los miRNAs circulantes en muestras de pacientes con cáncer colorrectal esporádico. Metodología: Se realizó la secuenciación de miRNA en 16 muestras de CCR, para seleccionar los miRNAs a evaluar en suero mediante qRT-PCR en tiempo real. Se evaluaron los niveles de expresión de 21 miRNAs en 37 muestras de CCR, 15 individuos control sanos, 17 muestras de pólipos y 7 adenomas respectivamente. Se realizó una predicción de blancos moleculares para aquellos que presentaron diferencias significativas. Resultados: De los 21 miRNA seleccionados se encontró que tres tuvieron una expresión diferencial: hsa-miR-10a-5p (p=0,05) disminuyó en comparación a los controles mientras que, hsa-miR-20a-5p (p=0,04) y hsa-miR-423-3p (p=0,02) presentaron sobre expresión. Por otro lado, hsa-miR-423-3p (p=0,04) presentó sobre expresión en adenomas frente a pólipos Los tres miRNAs circulantes fueron asociados a las vías principales de carcinogénesis de cáncer colorrectal evidenciando su potencial diagnóstico a futuro. Conclusiones: La expresión diferencial de miRNAs de CCR y controles así como pólipos y adenomas, demuestra que la regulación de los miRNAs puede hacer de ellos candidatos promisorios a biomarcadores no invasivos en cáncer colorrectal.Summary
Abstract. Introduction: colorectal cancer is the fourth cause of mortality in Colombia; there are about 12 new cases per every 100.000 people per year. MicroRNAs are short transcripts (18-25 nucleotides) of non-coding RNA that are able to regulate genic expression; in the context of cancer, these change their expression depending upon tumor stage and tissue. Objective: Evaluate the presence of circulating microRNAs in samples from patients with colorectal cancer taking healthy individuals as controls. Methodology: complementary DNA libraries were built from sixteen cryopreserverved tumor specimens of sporadic colorectal cancer. Next generation sequencing was performed using MiSeq Sequencing System, miRNAs expression was validated by real time PCR in serum samples. Results: Sequencing identified 763 sequence reads, from which 21 were evaluated by real time PCR. Three circulating miRNAs, hsa-miR-10a-5p (p=0,05), hsa-miR-20a-5p (p=0,04) and hsa-miR-423-3p (p=0,02)showed differences among cases and controls and were associated with the main pathways of colorectal carcinogenesis. Conclusions: miRNAs sequencing is an effective method in the search of miRNAs with clinical relevance. The evaluation of miRNAs differential expression is a complementary strategy to currently available colorectal cancer screening tests. Circulating miRNAs evaluated in this study may be promising diagnostic biomarkers candidates for colorectal cancer.Keywords
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