Caracterización molecular y morfológica de aislamientos de Fusarium spp. productores de micotoxinas
Type
Trabajo de grado - Doctorado
Document language
EspañolPublication Date
2016Metadata
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El género Fusarium se caracteriza por una amplia diversidad y número de especies que afectan a cultivos de importancia económica, además de producir micotoxinas que perturban la salud de los animales y el hombre. Con el objetivo de reconocer las especies presentes en aislamientos del género Fusarium como también detectar y cuantificar sus toxinas se caracterizaron 206 aislamientos obtenidos de diferentes hospedantes. La caracterización molecular se realizó haciendo uso de PCR con los cebadores ITS1 – ITS4 y TEF-1α. Las secuencias de los productos de PCR se compararon con el National Center for Biotecnology Information (NCBI) y el programa Fusarium ID y se alinearon usando Clustal W2, se construyeron las relaciones filogenéticas con el programa MEGA 6 con el coeficiente de similitud del vecino más cercano y máxima parsimonia con un bootstrap de 1000 réplicas. La detección molecular de las micotoxinas del grupo de los tricotecenos, zearalenona y fumonisinas se realizó por PCR, la cuantificación de las mismas se realizó mediante la prueba de inmunoimpresión ELISA. Los resultados de secuenciación para los marcadores mostraron coincidencias en el 95% de la población evaluada. El concepto filogenético permitió agrupar las 14 especies. Se encontró presencia de micotoxinas en las especies F. graminearum, F. equiseti, F. verticillioides, F. proliferatum y F. oxysporum. Los valores obtenidos desde medio de cultivo muestran alta cantidad de fumonisinas especialmente en cultivos de maíz.Summary
//Abstract: The genus Fusarium is characterized by a wide variety and number of species that affect economically important crops, and produce mycotoxins that disturb the health of animals and man. In order to recognize the species, present in a population of fungi of the genus Fusarium and their toxins detect and quantify 206 isolates obtained from different hosts were characterized. The molecular characterization was implemented using PCR primers with ITS1 - ITS4 and TEF-1α. The sequences of the PCR products were compared with the National Center for Biotechnology Information (NCBI) and the Fusarium ID program and aligned using Clustal W2, phylogenetic relationships with the MEGA program 6 were constructed with the similarity coefficient of neighbor joining and maximum parsimony bootstrap 1000 replicates. The molecular detection of mycotoxins group of trichothecenes, zearalenone and fumonisin was made by PCR, quantification of these was did by immunoblotting ELISA test. The sequencing results showed matches for markers in 95% of the study population. Phylogenetic concept grouped the 13 species. Mycotoxins were found in F. graminearum species, F. equiseti, F. verticillioides, F. proliferatum, F. napiforme and F. oxysporum. The allowed values for Colombia show a high amount of fumonisin in corn.Keywords
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