Objetivo: Estimar la asociación entre el tipo de diálisis y la supervivencia de pacientes con enfermedad renal crónica, ajustando por covariables dependientes de tiempo, utilizando modelos marginales estructurales. Metodología: Estudio observacional analítico tipo cohorte histórica, conformada por adultos con ERC en diálisis tratados en las clínicas de Renal Therapy Services (RTS) en Colombia durante 2009–2012. Se evaluó la asociación entre el tipo de terapia dialítica (peritoneal vs hemodiálisis) y la supervivencia, ajustando por variables basales y que dependen del tiempo, utilizando modelos estructurales marginales (MSM). Los resultados se compararon con el método multivariado de Cox extendido. Resultados: 7262 pacientes cumplieron criterios de elegibilidad; 57,5% eran de sexo masculino; la mediana de edad fue de 60,8 años (RIQ 20,3 años); 60,51% de los pacientes recibieron diálisis peritoneal como primera opción al inicio del seguimiento (día 91 de terapia dialítica) de los cuales 14.13% cambiaron a hemodiálisis en algún momento del seguimiento; la mediana de supervivencia global fue de 60 meses para el grupo de hemodiálisis y de 53 meses para el grupo de diálisis peritoneal, sin que esta diferencia fuera estadísticamente significativa. En el análisis multivariado con modelos estructurales marginales no se encontraron diferencias entre los grupos de comparación una vez el modelo fue ajustado por covariables que cambian en el tiempo y otras variables basales (HR 1,13; IC 95% 0,98 a 1,30). Estos mismos resultados se observaron en el análisis con el modelo de regresión de Cox (HR 0,96; IC 95% 0,86 a 1,06). Conclusiones: No se encontró asociación entre el tipo de terapia y el tiempo a la muerte, ajustando por covariables basales y dependientes de tiempo, por ninguno de los métodos estadísticos propuestos.Abstract: Objective: To estimate the association between the type of dialysis and the survival of patients with chronic kidney disease, adjusting for time-dependent covariates, using marginal structural models. Methodology: Historical cohort study. We review medical records of adults with grade 5 CKD treated at Renal Therapy Services clinics in Colombia during 2009-2012. The association between type of dialysis therapy (peritoneal vs hemodialysis) at the beginning of follow-up (day 91 of therapy) and survival, adjusted for baseline and time-dependent variables using marginal structural models was evaluated. The results were compared with the extended Cox multivariate method. Results: 7262 patients met eligibility criteria; 57.5% were male; the median age was 60.8 years (IQR 20.3 years); 60.51% of the patients received peritoneal dialysis as the first option, of which 14.13% switched to hemodialysis during follow-up. The overall median survival time was 60 months for the hemodialysis group and 53 months for the peritoneal dialysis group, this difference was not statistically significant. In the multivariate analysis with marginal structural models, no differences were found between the comparison groups in the model adjusted for time-dependent covariates and other baseline variables (HR 1.13 CI 95% 0.98 to 1.30). Similar results were observed in the analysis with the extended Cox regression model (HR 0.96, CI 95% 0.86 to 1.06). Conclusions: Using two different statistical methods, no association was found between type of therapy and survival after adjusting for baseline and time-dependent covariates.