Caracterización molecular de Bordetella pertussis en Colombia, 1995-2014

Abstract

La tosferina una enfermedad causada por Bordetella pertussis, prevenible por vacuna que en los últimos años ha tenido un importante aumento de casos confirmados en Colombia con una incidencia de 8,5 X 100.000 habitantes en el 2012 que no se registraba desde 1987. Con el fin de conocer el tipo de población de B. pertussis que circula en Colombia se analizaron por la PFGE (electroforesis en gel de campo pulsado) y MLST, (tipificación de las secuencias “multi-locus”) 67 aislamientos de B. pertussis aislados entre 1999-2016 y 80 aspirados nasofaríngeos por MLST de 2016 de casos confirmados de tosferina. Los perfiles más frecuentes para los aislamientos colombianos fueron: CDC010-prn2-ptxP3-ptxA1-fim3-1(30%), CDC002-prn2-ptxP3-ptxA1-fim3-1 (15%), CDC013-prn2-ptxP3-ptxA1-fim3-2 (15%) y el genotipo común para las muestras de casos confirmados fue prn2-ptxP3-ptxA1-fim3-1 (78,8%). El uso de PFGE+MLST fueron más discriminatorias (D= 0,86) que las pruebas de tipificación por separado. Es estudio provee evidencia de la alta frecuencia y dominancia del genotipo prn2-ptxP3-ptxA1-fim3-1 en Colombia que es similar a lo que circula actualmente en otros países que realizan epidemiología molecular. Los alelos encontrados en las vacunas difieren a los genotipos hallados en las muestras y aislamientos colombianos.

Abstract: Pertussis is a disease caused by Bordetella pertussis that is preventable by vaccination and that in recent years it has had a significant increase in confirmed cases in Colombia, reaching an incidence of 8.5 X 100.00 inhabitants in 2012 that was not registered since 1987. This research aims to know the type of population of B. pertussis circulating in Colombia, therefore, they were analyzed by PFGE (pulsed field gel electrophoresis) and MLST, (Multi-locus Sequence Typing) 67 isolates of B. pertussis collected 1999-2016 and 80 nasopharyngeal aspirates were processed from cases confirmed by MLST of 2016. Frequent profiles were: CDC010-prn2-ptxP3-ptxA1-fim3-1 (30%), CDC002-prn2-ptxP3- ptxA1-fim3-1 (15%), CDC013-prn2-ptxP3-ptxA1-fim3-2 (15 %) and the frequent genotype for the samples was prn2-ptxP3-ptxA1-fim3-1 (78.8%). PFGE + MLST was discriminatory (D = 0.86) than typing tests separately. This study provides evidence of the high frequency and dominance of the prn2-ptxP3-ptxA1-fim3-1 genotype in Colombia that is like what currently circulates in other countries that perform molecular epidemiology. The alleles found in the vaccine strains have differences to the genotypes found in Colombian samples and isolates.