La Guadua angustifolia es un bambú leñoso perteneciente a la familia Poaceae, es endémica de América y se considera como nativa de Colombia, Venezuela y Ecuador. El área de guaduales naturales y plantados durante los últimos 25 años en Colombia es de 51,000 ha, de las cuales 46,000 ha son naturales y 5,000 ha son cultivadas. Se ha registrado una diversidad de 100 especies de bambúes en 19 géneros, de las cuales 24 son endémicas. Es considerada como uno de los bambúes de América más apropiados para la fabricación de papel, para la construcción de muebles, objetos decorativos, instrumentos y edificaciones en bahareque. La guadua como recurso genético de la biodiversidad del trópico no ha sido suficientemente estudiada, la tala indiscriminada y la destrucción de guaduales sin plantear estrategias de resiembra y recuperación, inciden directamente en la pérdida de este recurso. El objetivo principal de este trabajo fue estudiar la diversidad genética de Guadua angustifolia y la estructura poblacional de guaduales en el eje cafetero colombiano usando marcadores moleculares microsatélites.//Abstrac: The American giant bamboo Guadua angustifolia is a woody bamboo; it belongs to Poaceae family, is endemic from South America and is considered as a native resource from Colombia, Venezuela and Ecuador. The total area of plantations and natural forests in Colombia is about 51000 ha, from which 46000 ha are natural forests and 5000 as commercial crops. Colombia has a biodiversity in bamboos of 100 species in 19 genus, 24 as endemic species. The Giant bamboo is considered as excellent material for paper fabrication, furniture elaboration, decorative elements and ideal for home construction. As a genetic resource from Colombian tropical biodiversity, it has not been sufficiently studied; the uncontrolled use and destruction of natural forests without planning of recuperation strategies have lead to the lost of this resource. The main objective of this research was to study the genetic diversity and population structure of Guadua angustifolia in the Colombian coffee region using microsatélites molecular markers.