Caracterizar la microbiota funcional en suelos cultivados en un estudio de caso con Bixa orellana en el corregimiento de Chintadó, municipio del Atrato – Chocó - Colombia.
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Resumen
Esta investigación, desarrollada como estudio de caso exploratorio, tuvo como objetivo caracterizar la microbiota funcional del suelo asociada al cultivo de Bixa orellana en el corregimiento de Chintadó (Chocó), comparando suelos con cultivos de tres y diez años. La investigación integro métodos dependientes e independientes de cultivo para describir la composición bacteriana, la actividad microbiana del suelo y la presencia de grupos funcionales e interés agrícola, con el propósito de aportar conocimiento sobre la relación suelo y microorganismo en un sistema agrícola productivo tropical poco documentado.
El análisis metataxonomico evidencio diversas bacterias, dominadas por filos ampliamente reportados en suelos agrícolas, entre ellos Acidobacteriota y Proteobacteria, mientras que las técnicas de cultivo de microorganismos permitieron identificar grupos funcionales como fijadores de nitrógeno, solubilizadores de fósforo, microorganismos celulolíticos, proteolíticos, así como esporas micorrizales. La posible relevancia funcional de estos taxones fue interpretada a partir de la literatura científica, dado que el estudio no incluyo la verificación experimental directa del rol funcional.
La actividad respiratoria del suelo mostró diferencias asociadas a la edad del cultivo de B. orellana, aportando información sobre la dinámica microbiana con distinto tiempo de establecimiento de la planta. Asimismo, se detectaron microorganismos que incluyen con potencial fitopatógeno, como el género Ralstonia, aunque en baja proporción pero que requiere de supervisión en la planta. La prueba de ecotoxicidad con E. foetida confirmo la inocuidad de los suelos tratados con compost, respaldando su uso como enmienda orgánica bajo las condiciones evaluadas. Además, los resultados indican que los mismos taxones de microorganismos están presentes en los suelos de tres y diez años, aunque con pocas variaciones en su abundancia, conforman una base de referencia para comprender la microbiota asociada a B. orellana en el corregimiento de Chintadó, así como un punto de partida para futuros estudios orientados a la validación funcional, el aprovechamiento de microorganismos autóctonos y el fortalecimiento de estrategias de manejo sostenible para el cultivo. (Texto tomado de la fuete)
Abstract
This research, developed as an exploratory case study, aimed to characterize the functional soil microbiota associated with Bixa orellana cultivation in the Chintadó district (Chocó), comparing soils with three- and ten-year-old crops. The research integrated culture-dependent and culture-independent methods to describe the bacterial taxonomic composition, soil microbial activity, and the presence of functional groups of agricultural interest, with the purpose of contributing knowledge about the soil-microorganism relationship in a poorly documented tropical production system.
The metataxonomic analysis revealed diverse bacterial communities, dominated by phyla widely reported in agricultural soils, including Acidobacteriota and Proteobacteria, while the culture techniques allowed the identification of functional groups such as nitrogen fixers, phosphorus solubilizers, cellulolytic and proteolytic microorganisms, as well as mycorrhizal spores. The potential functional relevance of these taxa was interpreted based on the scientific literature, given that the study did not include direct experimental verification of their functional role. Soil respiration activity showed differences associated with crop age, providing information on microbial dynamics in systems with varying establishment times. Microorganisms, including potentially phytopathogenic species such as Ralstonia, were also detected, although in proportions that require monitoring. The ecotoxicity test with E. foetida confirmed the safety of the compost-treated soils, supporting their use as an organic amendment under the evaluated conditions. Furthermore, the results indicate that the same microbial taxa are present in soils aged three and ten years, although with variations in abundance. These results provide a baseline for understanding the microbiota associated with B. orellana in the Chocó region, as well as a starting point for future studies focused on functional validation, the utilization of native microorganisms, and the strengthening of sustainable management strategies for the crop.
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