Caracterización del microbioma asociado a casos de síndrome febril agudo y su relación con características sociodemográficas y clínicas en la población Wayuu de Manaure, La Guajira-Colombia 2024
Cargando...
Autores
Tipo de contenido
Editor
Document language:
Español
Fecha
Título de la revista
ISSN de la revista
Título del volumen
Documentos PDF
Resumen
En Colombia, el síndrome febril agudo (SFA) de origen infeccioso constituye una de las principales causas de atención en salud y se asocia a agentes de diversa naturaleza biológica. En las comunidades indígenas Wayuu de la sabana de Manaure, La Guajira, las condiciones sociales y ambientales, la falta de acceso a agua potable y las inequidades en el acceso y calidad de los servicios sanitarios son determinantes estructurales de vulnerabilidad frente a infecciones y sus complicaciones. La población estudiada fue predominantemente infantil, con frecuencia relevante de bajo peso y dependencia de fuentes hídricas no tratadas, factores que refuerzan el contexto de riesgo sanitario. En este estudio, el SFA fue abordado mediante un enfoque de secuenciación no dirigido aplicado al análisis de virus y bacterias en hisopados nasofaríngeos, virus en sueros y virus, bacterias y parásitos intestinales en materia fecal. La evaluación estructural del microbioma se realizó exclusivamente en hisopados nasofaríngeos, dada la predominancia del foco respiratorio evidenciado. El entorno de residencia y las fuentes de agua para el consumo actúan como posibles moduladores de la composición microbiana respiratoria. Asimismo, la presencia de síntomas se asoció con mayor abundancia relativa de virus y patobiontes como Haemophilus influenzae, junto con una disminución de bacterias comensales, en un patrón consistente con disbiosis durante una infección viral activa. Se evidenció circulación de especies de Enterovirus, Betainfluenzavirus, Alphacoronavirus, Orthopicobirnavirus hominis, entre otros. El análisis filogenético de este último confirmó su pertenencia al genogrupo PBV-1 y su relación con linajes respiratorios previamente descritos, constituyendo el segundo reporte en el país y el primero en la comunidad Wayuu. En suero se detectaron principalmente Anellovirus y Circovirus de significado clínico aún no establecido, y sin evidencia molecular de arbovirus. En materia fecal se observó un perfil microbiano compatible con condiciones de saneamiento limitado, con predominio de Blastocystis spp., Entamoeba spp., dominancia de Prevotella y circulación de virus ARN del orden Picornavirales. En conjunto, estos hallazgos describen un panorama etiológico heterogéneo del SFA en una población indígena vulnerable, donde la interacción con determinantes socioambientales condiciona la estructura respiratoria. La integración de secuenciación no dirigida con variables socioambientales aportó evidencia relevante para fortalecer la vigilancia genómica y el abordaje epidemiológico. (Texto tomado de la fuente)
Abstract
In Colombia, acute febrile syndrome of infectious origin constitutes one of the leading causes of healthcare consultation and is associated with agents of diverse biological nature. In the Wayuu indigenous communities of the Manaure savannah, La Guajira, social and environmental conditions, lack of access to potable water, and inequities in access to and quality of healthcare services act as structural determinants of vulnerability to infections and their complications. The studied population was predominantly pediatric, with a relevant frequency of underweight status and dependence on untreated water sources, reinforcing the context of increased health risk. In this study, AFS was investigated using an untargeted sequencing approach applied to the analysis of viruses and bacteria in nasopharyngeal swabs, viruses in serum samples, and viruses, bacteria, and intestinal parasites in fecal samples. Structural microbiome analysis was performed exclusively on nasopharyngeal swabs, given the predominance of respiratory involvement. The place of residence and water sources used for consumption acted as potential modulators of respiratory microbial composition. Additionally, the presence of respiratory symptoms was associated with a higher relative abundance of viruses and pathobionts such as Haemophilus influenzae, along with a reduction in commensal bacteria, consistent with dysbiosis during active viral infection. Circulation of Enterovirus species, Betainfluenzavirus, Alphacoronavirus, and Orthopicobirnavirus hominis, among others, was identified. Phylogenetic analysis of the latter confirmed its classification within genogroup PBV-1 and its relationship with previously described respiratory lineages, representing the second report in the country and the first in the Wayuu community. In serum, Anellovirus and Circovirus were predominantly detected, both commonly described as commensal components of the human virome with uncertain clinical significance, and no molecular evidence of arboviruses was found. Fecal samples showed a microbial profile consistent with limited sanitation conditions, characterized by predominance of Blastocystis spp., Entamoeba spp., bacterial dominance of Prevotella, and circulation of RNA viruses belonging to the order Picornavirales.
Overall, these findings describe a heterogeneous etiological landscape of AFS in a vulnerable indigenous population, where socioenvironmental determinants shape respiratory microbial structure. The integration of untargeted sequencing with territorial variables provides relevant evidence to strengthen genomic surveillance and the molecular epidemiological approach to febrile syndrome in structurally vulnerable settings.
Descripción
ilustraciones a color, diagramas, fotografías, tablas