Relación entre ancestría genética, variantes germinales, y características clinicopatológicas en una cohorte de pacientes colombianas con cáncer de ovario seroso de alto grado
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Español
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Resumen
El cáncer de ovario es el séptimo más incidente y la séptima causa de muerte por cáncer en mujeres a nivel mundial, representando la segunda causa de mortalidad entre los cánceres ginecológicos. En Colombia, constituye una enfermedad con una alta tasa de mortalidad atribuible no solo a la inespecificidad de sus síntomas, sino también a diversos factores socioeconómicos que podrían influir en su diagnóstico tardío. Aunque su incidencia global es menor en comparación con otros tipos de cáncer, se ha observado un incremento de estas tasas en países menos desarrollados. El subtipo histológico seroso de alto grado (HGSOC) corresponde aproximadamente al 75% de los casos y se asocia frecuentemente con alteraciones en genes que participan en la vía de reparación por recombinación
homóloga, como BRCA1 y BRCA2.
Las disparidades en la incidencia y desenlaces clínicos del CO responden a una interacción compleja entre factores genéticos y no genéticos, incluyendo la ancestría genética. Sin embargo, la evidencia en poblaciones latinoamericanas es limitada. Por ello, este estudio tuvo como objetivo evaluar la viabilidad de inferir la ancestría genética a partir de un panel de cáncer hereditario en pacientes colombianas con HGSOC y explorar su relación con variables clínico-patológicas y genéticas.
Metodológicamente, se realizó un estudio exploratorio ambispectivo en una cohorte de pacientes atendidas en el Instituto Nacional de Cancerología. La inferencia de ancestría se estimó a partir de SNPs del panel TruSight™ Hereditary Cancer Panel mediante análisis de componentes principales y modelos de mezcla poblacional, y se comparó con resultados obtenidos a partir de secuenciación de exoma completo en una submuestra pareada de la cohorte.
Los resultados evidenciaron un predominio consistente de ancestría europea y nativoamericana, seguida de la africana, con una concordancia similar entre panel y WES. Aunque no se evidenciaron asociaciones clínicas significativas con la composición ancestral, se observaron señales exploratorias en la distribución de variantes genéticas. Estos hallazgos sugieren que los paneles dirigidos pueden ser una herramienta útil para la inferencia de la ancestría. Sin embargo, reconocemos limitaciones en el tamaño muestral. (Texto tomado de la fuente)
Abstract
Ovarian cancer (CO) is the seventh most commonly diagnosed cancer and the seventh cause of cancer-related death among women worldwide, representing the second cause of mortality among gynecological cancers. In Colombia, it constitutes a disease with a high incidence rate attributable not only to the nonspecificity of its symptoms but also to socioeconomic factors that can influence its late diagnosis. Although its global incidence is comparatively lower than that of other types of cancer, an increase in both incidence and mortality rates has been observed in less developed countries. High-grade serous ovarian cancer (HGSOC) accounts for approximately 75% of cases and is frequently associated with alterations in genes such as BRCA1 and BRCA2. However, evidence addressing the role of ancestry in CO remains limited, particularly in Latin American populations.
Therefore, this study aimed to evaluate the feasibility of inferring genetic ancestry using a hereditary cancer panel in Colombian patients with HGSOC and to explore its association with clinicopathological characteristics and genetic variants. An exploratory ambispective study was conducted in a cohort of patients, whose genetic ancestry was inferred using single nucleotide polymorphisms (SNPs) from the TruSight™ Hereditary Cancer Panel through principal component analysis and population admixture models, and results were compared with whole-exome sequencing (WES) data in a paired subsample of the cohort.
The results revealed a consistent predominance of European and Native American ancestry, followed by African ancestry, with similar concordance between panel-based and WES-based estimates. Although no significant clinical associations with ancestral composition were identified, exploratory signals were observed in the distribution of genetic variants. These findings suggest that targeted gene panels may represent a useful tool for genetic ancestry inference, while acknowledging limitations related to sample size.
Descripción
ilustraciones, diagramas